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想跟踪流行变异更快呢?解决生物信息学的瓶颈

工具、规则和激励屈曲的洪水下冠状病毒基因组序列——帮助控制疫情,研究者需要新的方法。
  1. 艾玛·b·Hodcroft

    1. 艾玛·b·Hodcroft Nextstrain博士后研究员和伯尔尼大学的瑞士伯尔尼。

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  2. 尼古拉De Maio

    1. 尼古拉De Maio EMBL-European生物信息学研究所的一位科学家在分子进化,英国剑桥。

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  3. Rob Lanfear

    1. 罗伯Lanfear副教授在澳大利亚国立大学分子进化,堪培拉,澳大利亚,和顾问GISAID支付。

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  4. 邓肯·r·MacCannell

    1. 邓肯r MacCannell是首席科学官办公室的先进分子检测在疾病控制和预防中心,乔治亚州,亚特兰大,美国。

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  5. Bui广明

    1. Bui广明高级讲师在计算phylogenomics澳大利亚国立大学,澳大利亚的堪培拉。

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  6. 海科a·施密特

    1. 海科a·施密特CIBIV高级博士后研究员,马克斯·佩鲁茨氏实验室,奥地利维也纳医科大学、维也纳大学。

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  7. Alexandros Stamatakis

    1. Alexandros Stamatakis永久性研究组长海德堡理论研究所、德国海德堡和卡尔斯鲁厄理工学院的计算机科学教授,德国卡尔斯鲁厄。

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  8. 尼克高盛

    1. 尼克高盛集团领袖和EMBL-European生物信息学研究所研究主管英国剑桥。

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  9. 克利斯朵夫Dessimoz

    1. 克利斯朵夫Dessimoz洛桑大学的生物信息学教授,瑞士,和伦敦大学学院,在瑞士生物信息学研究所的组长。

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减少疫苗效力从SARS-CoV-2变异升级的前景促使全球急于增加冠状病毒基因组的监测。这是至关重要的对快速识别和跟踪紧急菌株。它还可以确定个人之间如何发生传播比典型的接触者追踪可以更明确。正如这篇文章付印之时,世界各地的实验室已经测序超过610000 SARS-CoV-2样本;这一数字很可能超过一百万年大流行的结束。理论上,这些基因组可以帮助我们了解病毒的传播在社区和在全球范围内,允许我们摊位的感染。在实践中,这种分析揭示远低于他们可能会做。

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自然591年30-33 (2021)

doi: https://doi.org/10.1038/d41586 - 021 - 00525 - x

引用

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相互竞争的利益

R.L.支付顾问GISAID,一个股票SARS-CoV-2基因组数据的组织和其他病毒。

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