2020年1月11日,武汉市卫生应急响应小组离开关闭的华南海鲜批发市场。

2020年1月1日,中国武汉警方关闭了华南海鲜批发市场。图片来源:Noel Celis/法新社via Getty

科学家发布了三项研究,揭示了关于COVID-19大流行是如何开始的有趣的新线索。其中两份报告将疫情的爆发追溯到中国武汉一个出售活动物和其他商品的大型市场12第三份报告表明,2019年11月或12月,冠状病毒SARS-CoV-2至少两次从动物(可能是市场上出售的动物)传播给人类3..这三篇文章发表于2月25日和26日,都是预印本,因此还没有在同行评议的期刊上发表。

这些分析增加了最初的怀疑,即大流行始于华南海鲜批发市场,许多最早感染SARS-CoV-2的人都去过该市场。预印本包含对2019年12月和2020年1月从市场和感染者身上收集的冠状病毒样本的遗传分析,以及将许多样本与销售活动物的市场部分联系起来的地理位置分析。加州拉霍亚斯克里普斯研究所的病毒学家、两份报告的作者Kristian Andersen说,综合起来,这些证据指向市场是疫情的源头——这种情况类似于2002-04年严重急性呼吸系统综合症(SARS)的流行,动物市场被发现是爆发的起点。“这是非常有力的证据,”他说。

然而,没有一项研究包含明确的证据,说明在病毒传播给人类之前,哪种动物可能携带了这种病毒。安徒生推测,罪魁祸首可能是浣熊,一种在中国被用作食物和皮毛的类似狗的矮胖哺乳动物。他参与撰写的其中一项研究2这表明浣熊狗是在市场的一个区域出售的,那里收集了几个阳性样本。和报告4证明动物可以携带其他类型的冠状病毒。

尽管如此,一些病毒学家说,指向华南市场的新证据并不排除另一种假设。他们说,该市场可能只是一个大规模放大事件的发生地,在这个事件中,一个受感染者将病毒传播给许多其他人,而不是最初的溢出事件发生地。

位于蒙大拿州汉密尔顿的美国国立卫生研究院洛基山实验室的病毒学家文森特·蒙斯特说:“从分析的角度来看,这是一项出色的工作,但它仍有待进一步解释。”他说,在从市场上出售的动物和市场上出售动物的人采集的血液样本中寻找SARS-CoV-2和抗体,可以为COVID-19的起源提供更明确的证据。明斯特说,市场上的阳性样本数量确实表明了动物来源。但他对尚未进行更彻底的调查感到沮丧:“我们谈论的是一场颠覆了这么多人生活的大流行。”

地面零?

2020年1月初,中国当局将华南市场确定为病毒爆发的潜在源头,因为当时大多数感染COVID-19的人在开始出现症状前几天都去过那里,或者与曾在那里感染过COVID-19的人有过接触。为了阻止疫情的爆发,当局关闭了市场。研究人员随后收集了家禽、蛇、獾、大鲵、暹罗鳄和其他出售的动物的样本。他们还擦洗了下水道、笼子、厕所和摊贩的摊位,以寻找病原体。在世界卫生组织(世卫组织)领导的调查之后,研究人员在2021年3月发布了一份报告结果显示,直接从动物身上采集的近200个样本全部呈阴性,但从摊位和市场其他地方采集的约1000个环境样本呈阳性。

在东亚,一只圈养的浣熊(原浣熊)的肖像。

研究人员推测,浣熊等中间动物可能将冠状病毒SARS-CoV-2传播给了人类。华南市场已经开始出售浣熊狗。图片来源:埃德温·吉斯伯斯/自然图片库/科学图片库

包括中国疾病预防控制中心(CDC)研究人员在内的一个中国团队现已对从这些阳性样本中恢复的遗传物质进行了测序,并于2月25日以预印本形式发布了结果1.科学家们证实,这些样本中含有的SARS-CoV-2序列与在人类中传播的几乎相同。此外,它们表明,在大流行开始时流行的两种原始病毒谱系,即A和B,都出现在市场上。

“这是一项不错的工作,”流行病学家、美国疾病控制与预防中心(Centers for Disease Control and Prevention)中国分中心前主任叶雷(Ray Yip)表示。“他们已经证实,华南市场确实是一个非常重要的传播地点。”

来自中国的报告一发布在网上,安徒生和他的同事们就赶紧发布了他们研究了数周的手稿。

在一个2该团队将注意力集中在华南市场的西南部分,那里最近在2019年还出售活的动物,因为那里是疫情爆发的潜在震中。研究人员通过汇编中国首批已知COVID-19病例的信息,得出了这一结论,这些信息来自各种来源,包括世卫组织的调查、报纸文章以及武汉医生和患者的音频和视频记录。地理空间分析发现,2019年12月发生的156例病例紧密聚集在市场周围,2020年1月至2月期间病例逐渐分散在武汉各地。

作者还检查了世界卫生组织研究报告中在市场中收集的阳性样本的位置,并通过收集商业登记信息、市场关闭前的照片和世界卫生组织调查后出现的科学报告,充实了这些地点潜在环境的信息。例如,去年发表的一篇论文52017年至2019年期间,武汉市场上销售了约4.7万只动物,其中包括31种保护物种。

安徒生及其同事报告的一项重大发现是,将市场上的五个阳性样本映射到一个出售活动物的摊位上,更具体地说,映射到一个金属笼子、用于移动动物的推车和用于去除鸟类羽毛的机器上2.该报告的合著者之一,澳大利亚悉尼大学的病毒学家埃迪·霍姆斯(Eddie Holmes)曾在2014年去过这个货摊,并拍摄了一些照片——包括在这项研究中——一只活浣熊被关在一个金属笼子里,堆在家禽箱上,整个组装都坐在下水道排水管上。值得注意的是,在中国疾控中心研究人员的研究中,该市场的污水检测出SARS-CoV-2阳性。

在第二份报告中3.安德森和他的同事们得出结论,从基因上讲,SARS-CoV-2的A系和B系彼此差异太大,以至于一种谱系在人类身上无法迅速进化成另一种谱系。因此,他们认为冠状病毒一定是在非人类动物身上进化而来的,这两种谱系分别传播给了人类。论文指出,由于一些原因,包括谱系B在2020年1月更加流行,作者认为它在谱系a之前就蔓延到了人类身上。其他冠状病毒的爆发,如SARS和中东呼吸综合征(MERS)流行病,也是由野生动物的反复引入造成的。

综合所有新数据,再加上一定程度的猜测,安徒生认为,浣熊可能是在一个农场被感染的,该农场于2019年11月或12月在武汉的市场上出售这些动物,病毒可能传染给了接触它们的人或买家。他说,在至少两次情况下,这些感染可能已经从指示病例传播给其他人。

“尽其所能”

在过去的一年里,图森亚利桑那大学的病毒学家迈克尔·沃罗贝(Michael Worobey)与安德森共同撰写了这些论文23.他说,他对COVID-19起源的看法已经转变。2021年5月,他在《纽约时报》上发表了一封信Science6在这篇文章中,他和其他人敦促科学界对这种大流行是否源于实验室持开放态度,一个有争议的假设这表明SARS-CoV-2要么是在实验室中创造的,要么是武汉病毒学研究所的研究人员意外或故意释放的。“你要认真对待这种事情,”他解释道。

但他说,从那以后,有其他证据支持人畜共患病起源的故事,类似于艾滋病毒、寨卡病毒、埃博拉病毒和多种流感病毒。“当你看到所有的证据时,很明显,这是从市场开始的。”他说,不同的分析线索都指向了它,两种不同的SARS-CoV-2谱系从实验室衍生出来,然后巧合地出现在市场上,这是极不可能的。

尽管如此,明斯特说,他并不完全相信有两个溢出事件,因为病毒可能在一个免疫功能受损的人身上从一个世系进化到另一个世系。他补充说,需要从人和动物身上收集更多的数据来回答这个问题,并证明第一次溢出发生在华南市场。加州斯坦福大学的微生物学家大卫·雷尔曼(David Relman)也认为,预印本不是决定性的,它们排除了人们在市场爆发之前就被感染了,但没有被诊断出来的可能性。

霍姆斯担心,来自早期人类病例和动物的其他样本可能永远无法实现。比如去年7月,中国官员说他们计划从2019年开始分析存放在武汉血液中心的患者血液样本,但如果这项研究已经进行,它还没有公开。福尔摩斯说:“这已经够好了。”“我们现在应该关注的是努力防止此类事件再次发生。”