女孩死于禽流感没有广为分发变体

一个11岁的女孩在柬埔寨南部上周去世后感染禽流感A (H5N1)有不同的应变比导致大规模死亡的野鸟和家禽在全球范围内,领导说,科学家努力序列的病毒样本的女孩。科学家最初担心那个女孩可能已经感染了广泛传播病毒,就是现在在某些哺乳动物传播,自2020年以来已经感染了少数人。

埃里克•Karlsson病毒学家在金边柬埔寨巴斯德研究所,自然关于他和他的同事病毒的全基因组测序样品的年轻女孩在不到一天的公共存储库GISAID上的数据共享。他说测序病毒属于一个组织,在该地区被发现在鸡鸭了至少十年,虽然女孩是第一个被发现的H5N1病毒的国家九年。

柬埔寨卫生部擦洗12的密切接触者,只有她49岁父亲阳性。H5N1感染通常发生在人与家禽密切接触,到目前为止,没有证据表明这一毒株人与人之间传播。女孩是如何接触到病毒的调查正在进行中。

你什么时候收到病毒样本的年轻女孩吗?

示例的第一次测试是在国家公共卫生研究所的金边,然后转移到美国。我们收到样品大约在2月22日下午5点,并在24小时内排序。这真的是COVID-19流行的方式增加了我们很快序列和共享数据的能力。

样本中的病毒载量足够高,我们可以放大整个流感基因组。如果病毒载量低,通常情况下,我们将不得不等待大约三天生长在细胞或鸡蛋足够的病毒序列。我们的重点是病毒测序并进入公共领域尽可能快。

从序列中,你学到了什么?

病毒属于进化枝2.3.2.1c,这是一个在该地区流行毒株。相同的应变是导致感染人数在2013年和2014年在柬埔寨,家禽中发现,间歇性地从那时起,包括鸡活禽市场。

每个人都很担心,女孩可能有压力2.3.4.4b,这是世界各地的循环,导致主要问题在欧洲,北美和南美。2.3.4.4b是一个新的病毒进化枝,我们不知道很多关于它。

研究人员一直在监视2.3.2.1c相当长一段时间,和有信息做出合理的判断对其传播性和致病性。但随时有人畜共患溢出,我们必须把它至关重要。

令人担忧的关于人畜共患的溢出效应是什么?

病毒,特别是RNA病毒如流感、非常混乱,会很快适应一个新的主持人。我们看到这导致COVID-19与病毒。溢出效应表明,病毒现在有机会去适应一个新的主持人。关于是因为适应可能导致病毒,可能人与人之间传播。出人头地,阻止任何潜在的传播,以及理解什么病毒在其新的主机,是至关重要的,可以通知的疫情应对活动。

你也从父亲测序样品吗?

我们正试图序列样本的父亲,但他似乎有一个降低病毒载量,这使得它有点难以迅速得到一个序列。我们将尝试一些更有针对性的方法,以及隔离病毒。但往往没有足够的病毒载量不仅仅是部分序列。

知道这个女孩是如何感染是什么?

我不知道为什么从禽类病毒已经蔓延到人们在这种情况下,经过十年的不被检测到。很多因素仍需调查,但已经有很多全球农业实践的变化由于COVID-19流行创造了溢出的条件。

我们知道,在柬埔寨,大流行的后院家禽养殖量增加。很多人,例如导游,不能工作,必须补充他们的收入和食物来源的家庭。在世界各地,人们仍在苦苦挣扎,这导致了农业生产方式的变化,可以增加溢出的风险。改变人们的健康,比如营养不良或超重,可以让人更容易受到感染。

希望这是一个孤立的事件,但它可能表明一个更大的问题。

你的团队做进一步分析是什么?

我希望我们会得到更多的信息在家禽样本周围的情况。我们可以比较这些病毒与病毒历史数据序列,例如从禽鸟市场监测,这些地区的柬埔寨,是否任何重大改变了,或者是发生在家禽人口迫使病毒进入,例如,风险更大的表型,或对人构成风险更高。

我们还将隔离和这种病毒生长在三级生物安全水平的实验室设施,这将帮助我们开发工具来更好地理解该病例的流行病学和病毒在该地区。例如,我们可以开发血液检测抗体的存在——过去感染的标记样本中收集的父亲,其他人住在女孩的家庭和更广泛的社区。隔离也将是至关重要的,世界各地的实验室研究病毒的传播性和致病性,包括在动物模型中,如雪貂。