在中国河北省张家口一家饲养毛皮动物的农场，笼子里的浣熊狗。

中国市场上的两只浣熊狗。在华南市场采集的SARS-CoV-2阳性棉签中发现了该物种的DNA，该市场被认为是COVID-19传播的地方。图源:Greg Baker/法新社via Getty

浣熊、竹鼠、棕榈果子狸:这些只是从中国武汉华南海鲜批发市场提取的棉签中发现的一些动物的DNA，该市场与COVID-19大流行的起源有关。棉签还检测出导致该疾病的SARS-CoV-2阳性。该分析报告于3月20日发布在研究资料库Zenodo上1一些研究人员说，这为SARS-CoV-2在市场上从动物蔓延到人类的假设提供了证据。

“当然，这不是直接证据，”香港大学(University Of Hong Kong)病毒学家潘伟强(Leo Poon)说，“但这是我们目前能得到的最好证据，因为所有的动物都已从市场上淘汰，我们也没有这些动物的棉签。”

3月16日，大西洋首先报道了分析．泽诺多发表的这篇文章尚未经过同行评议，这是该研究的全部内容首次公开发布，这可能为后续研究铺平道路，比如调查市场上的动物来自哪里，这可能有助于确定大流行的起源。

这些棉签是在2020年初市场关闭并清理动物产品后收集的。

尤其值得注意的是在两个摊位的六个样本中发现了浣熊狗的线粒体DNA。这些像狐狸一样的小动物很容易感染SARS-CoV-2，并且可以在没有明显患病迹象的情况下将感染传播给其他浣熊2．浣熊和果子狸也被发现感染了病毒，这些病毒与导致严重急性呼吸综合征的病毒几乎相同，这种病毒与SARS-CoV-2有关，并于2003年在人类中爆发。对棕榈果子狸细胞的研究表明，这些生物可能会感染SARS-CoV-23.．

研究人员正在寻找哺乳动物的证据，它们可能是病毒的中间宿主。他们发现了近乎完整的线粒体dna序列——每个序列大约有16000个碱基对长——这5个物种包括浣熊(Nyctereutes procyonoides)、马来亚豪猪(Hystrix短尾派)、黑龙江刺猬(Erinaceus amurensis)、果子狸(Paguma larvata)及白竹鼠(Rhizomys pruinosus)。研究报告的合著者亚历克斯·克里茨-克里斯托弗(Alex crts - christoph)说:“有一个列表是很了不起的。”他是一家非营利组织的计算生物学家，总部设在马里兰州的巴尔的摩。

研究表明，SARS-CoV-2的前体可能起源于蝙蝠，但尚不清楚它是如何从蝙蝠传播给人类的。科学家怀疑有一个中间宿主参与其中，但他们没有找到有力的证据，这导致人们猜测，病毒可能是有意或无意地从武汉的一个实验室泄露出来的。

这项新的研究并没有证实这些动物本身是否感染了这种病毒。但一些研究人员说，确定这些动物出现在市场上表明，大流行可能源于动物。

其他人则对从分析中得出这样的结论持谨慎态度。纽约冷泉港实验室的定量生物学家贾斯汀·金尼(Justin Kinney)说，这项工作确认了哪些动物物种在市场上销售，但由于它只包括检测呈阳性的样本，“这项工作中没有数据将SARS-CoV-2与任何这些动物的存在联系起来”。

世界卫生组织(世卫组织)总干事谭德塞在3月17日的新闻发布会上在听取了报告发布前的简报后说:“这些数据并没有为大流行如何开始的问题提供明确的答案。”“但每一条数据都很重要，能让我们更接近这个答案，”他说。

出现与消失

这种棉签最早是在George Gao的预印本论文中提到的42022年2月，中国疾病预防控制中心(中国疾病预防控制中心)前主任李晓东和他的同事们在研究广场上发帖称。研究人员曾多次要求公开这些数据，但都没有成功。

但是，法国国家科学研究中心的进化生物学家Florence Débarre，也是最新报告的合著者之一，在3月4日几乎偶然地在公共数据存储库GISAID中发现了这些数据。她说:“基本上，(他们)就是我们等待了一年的人。”

总的来说，Débarre和她的同事从大约50个样本中下载了大约半tb的基因组数据。数据包括2020年1月至2月期间从下水道、市场摊位和地面上采集的几乎所有SARS-CoV-2检测呈阳性的棉签。“我们谈论的是数以百万计的测序读数，”Crits-Christoph说。

但在研究人员下载数据后不久，它们就从GISAID的公众视野中消失了。

在致自然在美国，GISAID的一位发言人表示，他们不会删除记录，但捐助者经常更新他们的记录，这使得他们“暂时不可见”。市场拭子数据“目前正在更新，作为目前正在审查的手稿的一部分，更新了更多的数据”。(高的论文被Nature Portfolio标记为“审查中”。自然《自然》的新闻团队独立于出版《自然》杂志Portfolio期刊的出版商施普林格Nature。)

Débarre和她的同事们表示，他们联系了预印本的作者和中国疾病预防控制中心合作进行分析，但中国疾病预防控制中心拒绝了。3月14日，她的同事以及中国疾控中心的成员在世界卫生组织新型病原体起源科学顾问组会议上向世界卫生组织介绍了他们的工作，该机构的任务是调查疫情，包括SARS-CoV-2的起源。

谭德塞在3月17日的世卫组织新闻发布会上呼吁中国疾控中心的研究人员在共享数据时保持透明。他说:“这些数据在三年前就可以、也应该分享。”

高晓松没有回应自然的置评请求。

Débarre承认分享这些数据花了很长时间，但对中国疾控中心进行的环境采样和测序工作表示肯定。“他们做了该做的事，”她说。“如果不是他们的工作，我们就不会有这些数据。”

疯狂的比赛

先前的研究发现，中国竹鼠(Rhizomys sinensis)和浣熊狗在2017年5月至2019年11月期间在华南市场出售5一些摊位可能在出售活的或刚宰杀的哺乳动物或其他肉类产品6．研究报告的合著者、加州大学圣地亚哥分校的分子流行病学家乔尔·韦特海姆说，这些数据证实，“我们认为市场上存在的东西，实际上就在市场上。”

大多数sars - cov -2阳性样本和大多数含有野生动物DNA的样本都在同一地区被发现，Poon说，这“符合病毒可能来自动物的假设”。Poon说，来自市场东部地区的许多阳性棉签均含有人类DNA，这表明2020年初市场上存在一些人际传播。

在一辆用于移动笼子的推车的样本中，研究人员发现了与浣熊-狗基因组匹配的材料，而与人类基因组匹配的材料很少。潘说:“最合乎逻辑的假设是，浣熊感染了SARS-CoV-2，并传播了病毒。”

但该地点有可能被其他来源的SARS-CoV-2 RNA污染了。“没有证据表明病毒来自受感染的浣熊;它也可能很容易来自受感染的人，”肯尼说。

需要更多数据

Crits-Christoph说，如果这些数据再次公开，可以从这些数据中获得更多的法医见解。例如，通过观察不同动物物种的RNA与DNA的比例，研究人员可以确定这些动物在市场上出现的时间，因为DNA通常比RNA在环境中存在的时间更长。但Wertheim说，还需要更多关于样本是如何收集、处理和测序的细节。

Crits-Christoph补充说，对RNA数据的仔细研究可能会确定市场上的动物是否患病。这些生物看起来是处于“疾病状态还是健康状态”?他问道。“数据中有各种各样奇妙而复杂的问题。”

还有更多数据尚未共享，包括对SARS-CoV-2检测呈阴性的环境棉签。韦特海姆说，分析这些数据很重要，可以更好地了解市场上正在发生的事情。