狩猎的生活方式促进繁荣的肠道微生物组

人类肠道充满了数以万亿计的微生物,但这个庞大社区的大多数研究都集中在人生活在城市地区。现在,一组研究人员已经从哈德人肠道微生物组测序——狩猎采集社会的成员在坦桑尼亚北部和比较他们与人在尼泊尔和加利福尼亚州¹。哈德的研究发现不仅往往比其他组的人肠道微生物,但西方的生活方式似乎减少肠道种群的多样性。

的哈德平均每人730种肠道微生物。加州平均肠道微生物组包含277个物种,和尼泊尔微生物之间。农业的生活方式的人平均436种微生物,而那些靠打猎为生的平均317。

研究组还发现物种哈微生物组没有出现在加州的样本,如螺旋状细菌梅毒succinifaciens。只有一些尼泊尔的微生物含有微生物,这表明细菌消失随着社会越来越工业化。

矫正这种不平衡

以往的研究表明,人类肠道微生物组不同地区和生活方式,但是有一个从非工业化人口缺乏数据,研究的合著者贾斯汀松嫩堡说,在加州的斯坦福大学的微生物学家。“测序工作的一部分来帮助填补这一空白,为地区提供更多的数据不足,”他说。

尽管众所周知,非工业的居民的生活方式更加多样化的微生物比人们在工业化社会中,研究结果表明,不同的是比此前认为的更加明显,研究的共同作者马修·卡特说,斯坦福大学的微生物学家。

“数据大大拓展我们人类微生物组的照片,”安德鲁·穆勒说,伊萨卡康奈尔大学的进化生物学家纽约。“我确信还有数不清的故事仍然隐藏在序列。”

研究人员收集的粪便样品中的微生物基因组测序从167年哈人——包括婴儿和母亲——在2013年和2014年之间。相比之下,该小组还生成序列从粪便样本收集四组人2016年在尼泊尔,和加州的参与者在2021年的一项研究的样本²探讨饮食如何影响微生物。

多样性减少

从这些样本,松嫩堡和他的团队超过90000的基因组测序人类肠道中的微生物,包括细菌、病毒感染细菌和单细胞生物组织称为古细菌和真核生物。大约44%的这些微生物基因组等大型目录尚未记录在统一人类胃肠道基因组数据库。从哈样品基因组序列中恢复,1000多名来自细菌或科学上的新热点。

此外,gut-microbe物种通常存在于工业化人口通常包含基因与应对氧化损伤有关。团队怀疑肠道慢性炎症可能会引发这样的伤害,创建这些基因的选择性压力,微生物学家研究的合著者马修洞螈说斯坦福大学。“如果你有一种慢性炎症状态,这将是有意义的,你的肠道微生物适应,”他说。这些基因没有检测到哈德的微生物。

微生物学家塞缪尔·福斯特,哈德逊研究所的医学研究在墨尔本,澳大利亚,说学习非西方人口将有助于建立一个更完整的人类肠道微生物,以及它如何在不同的生活方式和地区。这可以帮助研究人员跟踪哪些物种正在消失在工业化人口和如何影响人类健康,福斯特说。“我们有机会了解我们携带的完整的微生物,”他说。“这是有效地避免灭绝事件通过理解他们现在,之前他们迷路了。”