摘要
化生乳腺癌是一种罕见的异质肿瘤(0.5-2%)。以三阴性肿瘤为主，但化疗反应较差，预后较差。我们研究的目的是描述疾病复发/进展的早期化生乳腺癌患者的匹配(原发-复发)肿瘤样本的分子特征和肿瘤演化。我们至少从肿瘤进化的两个不同时间点对肿瘤活检进行了基因组分析。肿瘤样本采用dna -下一代测序(Illumina 2 x 75bp)，使用Action OncoKitDX小组(Imegen-Health in Code组)分析，其中包括50个基因的点突变、CNVs和融合基因。仅考虑致病性和可能致病性变异进行分析，并根据ComPerMed标准进行分类。我们分析了21个匹配的肿瘤样本(8个原发和13个复发/进展样本)。匹配肿瘤样本的基因组分析显示，原发肿瘤中存在的突变通常在复发/疾病进展中保持。我们没有发现原发和复发/进展样本之间的点突变显著增加，尽管基因扩增在复发/进展样本中更频繁地被发现。肿瘤样本中含有高频率的TP53(100%)和叔启动子(29%)突变MYC扩增(80%在复发/进展样本中)。没有PI3KCA发现了突变，但是PTEN38%的样本富集变异(10%突变，28%缺失)。FGFR113%的样本(仅原发肿瘤)被鉴定为扩增。既不ERBB2也不表皮生长因子受体检测基因扩增。最常见的致病改变发生在周期调节的基因，包括TP53而且叔启动子突变，以及MYC放大。复发/进展样本高度富集MYC放大。需要更大规模的研究来更好地描述这些肿瘤，并确定改善这些患者预后的新策略。
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确认
我们要特别感谢患者和西班牙生物样本库网络集成的生物样本库HUB-ICO- IDIBELL (PT17/0015/0024)的合作，以及Elvira Purqueras对肿瘤样本的管理。此外，我们感谢“Biobanc de l 'Hospital infant Sant Joan de Déu per a la Investigació”集成在ISCIII的西班牙生物银行网络中进行样本和数据采购。这篇手稿没有得到具体的资助。
作者信息
作者及隶属关系
贡献
p。g。p。c。i。c。做了基因测试。a.s.， m.c.， a.p.， j.b.s。，T.S., and S.P. collected and analyzed clinical and anatomo-pathologic information. A.S., P.G., M.C., A.P., J.B.-S., P.C., S.R., A.V., A.F.O., C.F., M.G.G., S.V., R.V.V., T.S., IC, and S.P. integrated and analyzed the clinical data together with molecular data. A.S., P.G., and S.P. wrote the manuscript. All authors reviewed and accepted the manuscript.
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道德声明
相互竞争的利益
A.S.曾担任Novartis和Seagen的顾问。讲座、演讲、演讲局、手稿写作或教育活动的报酬或酬金:卫材、诺华、皮埃尔法布尔。支持参加会议和/或旅行:辉瑞，诺华。M.G.G曾担任Agendia和Astra-Zeneca的顾问。讲座、演讲、演讲局、手稿写作或教育活动的报酬或酬金:辉瑞、诺华、Daiichi-Sankyo和Eisai。支持参加会议和/或旅行:罗氏，辉瑞，诺华，礼来和第一三共。R.V.V曾担任诺华和礼来的顾问。讲座、演讲、演讲局、手稿写作或教育活动的报酬或酬金:诺华、卫材。支持参加会议和/或旅行:诺华，卫材和礼来。S.P.曾担任阿斯利康、daii - sankyo、Polyphor、Novartis、Seattle Genetics、Roche、Eisai和Pierre-Fabre的顾问/顾问。
伦理批准/同意参与
研究方案由Bellvitge-IDIBELL大学医院机构审查委员会批准(参考文献:BB20-017)。分析时，所有活着的患者都获得了知情的书面同意。所有样本都经过适当编码和匿名处理。在涉及人类参与者的研究中执行的所有程序都符合机构和/或国家研究委员会的道德标准以及1964年赫尔辛基宣言及其后来的修正案或可比的道德标准。
额外的信息
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关于本文
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斯特拉德拉，A.，加加洛，P.，塞胡埃拉，M.。et al。化生乳腺癌成对样本的基因组特征和肿瘤进化。国防部分册35， 1066-1074(2022)。https://doi.org/10.1038/s41379-022-01017-7
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