摘要
肿瘤通常由大量基因组独特的恶性克隆组成，其中只有少数可能有能力逃脱癌症治疗，生长为有症状的病变。因此，基因组多样性大的肿瘤有更高的机会导致患者死亡。然而，克隆命运可以由非基因组特征驱动。在这种背景下，新技术的出现不仅可以跟踪单个细胞及其子代的时空命运，还可以利用各种组学分析研究它们的分子特征。特别是，细胞条形码技术的最新发展促进了数千万到数百万个癌症克隆的标记，并使识别与克隆命运在不同微环境和治疗反应相关的复杂机制成为可能。在这篇综述中，我们重点介绍了基于慢病毒的细胞条形码技术，即遗传和光学条形码技术的最新发现。我们还强调了每种技术的优势和局限性，并讨论了在设计条形码实验时必须考虑的一些关键概念。最后，我们提出了进一步改进这些技术在癌症研究中的应用的新方向。
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确认
作者感谢F. El-Saafin和S. Gadipally的建设性反馈，感谢T. Weber的有益讨论。A.S.由墨尔本研究奖学金支持。D.M.由维多利亚癌症委员会、爱你的姐姐基金会、NBCF(研究者发起的研究计划拨款IIRS-19-082)、Susan G. Komen和澳大利亚癌症协会(CCR19606878)、维多利亚癌症机构职业中期研究奖学金(MCRF21011)和澳大利亚国家卫生和医学研究委员会(拨款2012196)支持。S.H.N.得到澳大利亚国家卫生和医学研究委员会的支持(赠款1062820、1100033、1101378、1124812和1145184)。作者和Olivia Newton-John癌症研究所感谢爱你姐姐基金会的慷慨支持和维多利亚政府通过维多利亚癌症机构的贡献。出版材料的内容完全是作者个人的责任，不反映澳大利亚癌症协会或其他资助机构的观点。
作者信息
作者和联系
贡献
D.M.和A.S.为这篇文章研究了数据。所有作者都对内容的讨论做出了很大贡献。D.M.和A.S.写的文章。所有作者在投稿前审阅和/或编辑了稿件。
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相互竞争的利益
作者声明没有竞争利益。
同行评审
同行审查的信息
自然评论癌症感谢Louis Vermeulen和其他匿名审稿人对这项工作的同行评议做出的贡献。
额外的信息
出版商的注意
施普林格自然对出版的地图和机构附属的管辖权要求保持中立。
术语表
- 克隆
-
由同一个祖细胞衍生而来的亚群细胞，具有基因组相似性。推广性地说，在细胞条形码研究中，“克隆”指的是含有相同条形码的细胞，因为这些细胞来源于一个独特的条形码细胞。
- 健身
-
个体克隆体在特定条件下生存和增殖的能力。
- 滞育
-
一种可逆的细胞状态，最初被观察为胚胎在环境条件不利时暂停其发育的一种生存机制
- 微小残留病
-
治疗后检测到的癌细胞数量较低。
- 光谱流式细胞术
-
一种流式细胞术，可以用多个检测器记录荧光的全光谱，而传统的流式细胞术只使用一个检测器。
- 连续稀释实验
-
由连续稀释细胞悬浮液以选择减少数量的细胞或分离单个细胞组成的实验。
- 感染复数
-
(MOI)。病毒粒子数与靶细胞数之比。
权利和权限
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关于这篇文章
引用这篇文章
A.塞拉诺，贝莱特，J.奈克，S.H.et al。掌握使用细胞条形码来探索癌症异质性。Nat牧师癌症22, 609 - 624(2022)。https://doi.org/10.1038/s41568-022-00500-2
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DOI：https://doi.org/10.1038/s41568-022-00500-2
