跳转到主要内容

谢谢你访问nature.com。您使用的浏览器版本支持有限的CSS。为了获得最好的体验,我们建议您使用更最新的浏览器(Internet Explorer或关闭兼容性模式)。同时,为了确保继续支持,我们网站没有显示样式和JavaScript。

扩大的tRNA修改及其相关性疾病

主题

文摘

转移核糖核酸是一个适配器在mRNA分子链接一个特定的密码子对应的氨基酸在蛋白质合成。转运rna转录酶修改。各种各样的tRNA修改在tRNA反密码子,这是至关重要的精确的密码子识别和阅读框维护,从而确保准确和高效的蛋白质合成。此外,tRNA-body地区也经常修改,从而在细胞中稳定。在过去的二十年里,16个小说tRNA的修改被发现在各种各样的生物,化学空间的tRNA修改继续扩张。最近的研究显示,tRNA修改可以动态地改变以应对细胞代谢物水平和环境压力。重要的是,我们现在了解到不足tRNA修改可以有病理的后果,称为“RNA modopathies”。失调的tRNA修改涉及线粒体疾病、神经系统疾病和癌症。

这是一个预览的订阅内容,通过访问你的机构

相关的文章

开放获取文章引用这篇文章。

访问选项

买条

时间有限或全文访问ReadCube。

32.00美元

所有价格是净价格。

图1:tRNA的基本结构和功能。
图2:人类tRNA的集成视图的修改。
图3:tRNA修改在过去的二十年里发现的。
图4:控制解码的tRNA摆动的修改。
图5:人类线粒体代谢和病理调控tRNA的修改。
图6:移动有限公司2t的浓度调节水平6一个。
图7:Codon-specific翻译控制由tRNA修改癌症。

引用

  1. 华立,r . w . et al .核糖核酸的结构。科学147年,1462 - 1465 (1965)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  2. 克里克p.h. Codon-anticodon配对:摆动假说。j·摩尔,杂志。19,548 - 555 (1966)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  3. 眉目传情,j . M。,Murphy, F. V., Tarry, M. J. & Ramakrishnan, V. Selection of tRNA by the ribosome requires a transition from an open to a closed form.细胞111年,721 - 732 (2002)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  4. 铃木,t .微调的RNA功能修改和编辑12卷(ed。Grosjean, h) 23 - 69(斯普林格出版社,2005年版)。

  5. Agris、p . f . et al .庆祝摆动解码:半个世纪,仍然是新的。RNA杂志。15,537 - 553 (2018)。

    PubMed谷歌学术搜索

  6. 汉族,l . & Phizicky e . m .反密码子的理由tRNA修改电路回路。核糖核酸24,1277 - 1284 (2018)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  7. 比约克,g R。,Wikstrom, P. M. & Bystrom, A. S. Prevention of translational frameshifting by the modified nucleoside 1-methylguanosine.科学244年,986 - 989 (1989)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  8. 舵,m & Alfonzo j . d . RNA转录后的修改:在细胞的新陈代谢游戏化学乐高乐园。化学。医学杂志。21,174 - 185 (2014)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  9. Motorin y &, m . tRNA稳定通过修改后的核苷酸。生物化学49,4934 - 4944 (2010)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  10. Sylvers,洛杉矶。,Rogers, K. C., Shimizu, M., Ohtsuka, E. & Soll, D. A 2-thiouridine derivative in tRNAGlu是一个积极的行列式为氨酰化大肠杆菌glutamyl-tRNA合成酶。生物化学32,3836 - 3841 (1993)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  11. 铃木T。,Ueda, T. & Watanabe, K. The ‘polysemous’ codon–a codon with multiple amino acid assignment caused by dual specificity of tRNA identity.EMBO J。16,1122 - 1134 (1997)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  12. vooorhees, r . m . & Ramakrishnan诉结构平动延伸循环的基础。为基础。学生物化学启。82年,203 - 236 (2013)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  13. Florentz c & Giege r在斯特拉斯堡tRNA的历史研究。IUBMB生活71年,1066 - 1087 (2019)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  14. Ibba, m & Soll后,d .氨酰合成。为基础。学生物化学启。69年,617 - 650 (2000)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  15. 麦克莱恩,w·h·规则管理tRNA身份在蛋白质合成。j·摩尔,杂志。234年,257 - 280 (1993)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  16. Muramatsu表示,t . et al .密码子和氨基酸特异性转移核糖核酸都是转换的一个转录后修饰。自然336年,179 - 181 (1988)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  17. 圣吉,B。,一个uxilien, S., Englisch, U., Cramer, F. & Fasiolo, F. The modified wobble base inosine in yeast tRNAIle是一个积极的行列式为氨酰化isoleucyl-tRNA合成酶。生物化学36,8269 - 8275 (1997)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  18. Thiaville, p . c . et al . threonylcarbamoyladenosine (t的重要性6),一个普遍的tRNA修改,在细菌。摩尔。Microbiol。98年,1199 - 1221 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  19. 酒井敦t . et al .承认tRNA的反密码子循环Ile1由isoleucyl-transfer RNA合成酶大肠杆菌核苷核苷酸核酸13,1231 - 1237 (1994)。

    中科院谷歌学术搜索

  20. 笨蛋,J。,Florentz, C., Benseler, F. & Giege, R. A single methyl group prevents the mischarging of a tRNA.Nat。结构。医学杂志。1,580 - 582 (1994)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  21. 乌伦贝克,o . c &施克拉德,j . m .进化优化影响细菌的设计为将非天然氨基酸的转运rna核糖体。咕咕叫。当今。化学。医学杂志。46,138 - 145 (2018)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  22. LaRiviere f·J。,Wolfson, A. D. & Uhlenbeck, O. C. Uniform binding of aminoacyl-tRNAs to elongation factor Tu by thermodynamic compensation.科学294年,165 - 168 (2001)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  23. Asahara, h &乌伦贝克,o . c .预测misacylated转运rna的结合亲和力栖热菌属酸奶EF-Tu.GTP。生物化学44,11254 - 11261 (2005)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  24. 洛伦茨,C。,Lunse, C. E. & Morl, M. tRNA modifications: impact on structure and thermal adaptation.生物分子735 (2017)。

    公共医学中心谷歌学术搜索

  25. 周,D。,Tanzawa, T., Lin, J. & Gagnon, M. G. Structural basis for ribosome recycling by RRF and tRNA.Nat。结构。摩尔。杂志。2725-32 (2020)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  26. Boccaletto, p . et al . MODOMICS: RNA的数据库修改路径。2017年更新。核酸Res。46D303-D307 (2018)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  27. 2009年f等人tRNAdb朱尔:编译tRNA序列和tRNA基因。核酸Res。37D159-D162 (2009)。

    PubMed谷歌学术搜索

  28. 弗莱,M。,Jaffrey, S. R., Pan, T., Rechavi, G. & Suzuki, T. RNA modifications: what have we learned and where are we headed?Nat,启麝猫。17,365 - 372 (2016)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  29. Alfonzo, j . d .转录后修饰是非常重要的。RNA杂志。11,1481 - 1482 (2014)。

    PubMed谷歌学术搜索

  30. Grosjean, h .微调的RNA功能修改和编辑12卷(ed。Grosjean, h) 22页(斯普林格出版社,2005年版)。

  31. Chan p p &劳,t . m . GtRNAdb 2.0:扩大转移核糖核酸基因数据库中标识完整基因组草案。核酸Res。44D184-D189 (2016)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  32. 库特,c . et al .波尔三世绑定在六个哺乳动物显示保护氨基酸中同形像尽管tRNA基因之间的差异。Nat,麝猫。43,948 - 955 (2011)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  33. Gogakos, t . et al .描述表达和处理人类转移rna hydro-tRNAseq和PAR-CLIP前体和成熟。细胞的代表。20.,1463 - 1475 (2017)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  34. 瞒,a . e . et al . ARM-seq: AlkB-facilitated RNA甲基化测序揭示了一个复杂的景观改造tRNA碎片。Nat方法。12,879 - 884 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  35. 郑,g . et al .高效和定量高通量tRNA测序。Nat方法。12,835 - 837 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  36. 霍夫曼,et al。准确的映射tRNA读取。生物信息学34,1116 - 1124 (2018)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  37. Pinkard, O。,McFarland, S., Sweet, T. & Coller, J. Quantitative tRNA-sequencing uncovers metazoan tissue-specific tRNA regulation.Commun Nat。114104 (2020)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  38. 李X。,Xiong, X. & Yi, C. Epitranscriptome sequencing technologies: decoding RNA modifications.Nat方法。1423-31 (2016)。

    PubMed谷歌学术搜索

  39. 王,J。,Toffano-Nioche, C., Lorieux, F., Gautheret, D. & Lehmann, J. Accurate characterization of大肠杆菌tRNA修改的深度排序图书馆准备用一个简单的方法。RNA杂志。https://doi.org/10.1080/15476286.2020.1790871(2020)。

    文章PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  40. 克拉克,w . C。,Evans, M. E., Dominissini, D., Zheng, G. & Pan, T. tRNA base methylation identification and quantification via high-throughput sequencing.核糖核酸22,1771 - 1784 (2016)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  41. 歌,j . et al .微分的作用人类PUS10 microrna的处理和tRNA pseudouridylation。Nat,化学。医学杂志。16,160 - 169 (2020)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  42. 木村,S。,Dedon, P. C. & Waldor, M. K. Comparative tRNA sequencing and RNA mass spectrometry for surveying tRNA modifications.Nat,化学。医学杂志。16,964 - 972 (2020)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  43. 铃木T。,Nagao, A. & Suzuki, T. Human mitochondrial tRNAs: biogenesis, function, structural aspects, and diseases.为基础。启麝猫。45,299 - 329 (2011)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  44. 铃木t . et al .完整的人类线粒体转运rna的化学结构。Commun Nat。114269 (2020)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  45. 马库斯,j . o . & Bystrom a微调的RNA功能修改和编辑,12卷(ed, Grosjean h .) 87 - 120(斯普林格出版社,2005年版)。

  46. 吉田,m . et al .整流器异常的信使rna剪接复苏tRNA修改在家族性神经异常。Proc。《科学。美国112年,2764 - 2769 (2015)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  47. 铃木T。,铃木T。和田,T。,Saigo, K. & Watanabe, K. Taurine as a constituent of mitochondrial tRNAs: new insights into the functions of taurine and human mitochondrial diseases.EMBO J。21,6581 - 6589 (2002)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  48. 浅野、k . et al .代谢和化学调节tRNA修改与牛磺酸不足和人类疾病有关。核酸Res。46,1565 - 1583 (2018)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  49. Yokoyama s . et al .密码子识别的分子机制tRNA物种改良尿苷在第一个反密码子的位置。Proc。《科学。美国82年,4905 - 4909 (1985)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  50. Kurata, s . et al .改性尿苷C5-methylene tRNA反密码子的取代基在第一个位置稳定U·G摆动在解码配对。生物。化学。283年,18801 - 18811 (2008)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  51. Kirino, y . et al . Codon-specific平移摆动引起的缺陷修改缺陷的突变tRNA人类线粒体疾病。Proc。《科学。美国101年,15070 - 15075 (2004)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  52. 约翰逊,m . J。艾斯伯格,。黄,B。,比约克,g R。& Bystrom, A. S. Eukaryotic wobble uridine modifications promote a functionally redundant decoding system.摩尔。细胞。医学杂志。28,3301 - 3312 (2008)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  53. Yasukawa, T。铃木,T。石井,N。,Ohta, S. & Watanabe, K. Wobble modification defect in tRNA disturbs codon-anticodon interaction in a mitochondrial disease.EMBO J。20.,4794 - 4802 (2001)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  54. Tukenmez, H。徐,H。,Esberg, A. & Bystrom, A. S. The role of wobble uridine modifications in +1 translational frameshifting in eukaryotes.核酸Res。43,9489 - 9499 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  55. 墨菲,f . v . T。,Ramakrishnan, V., Malkiewicz, A. & Agris, P. F. The role of modifications in codon discrimination by tRNA利斯河下面部分Nat。结构。摩尔。杂志。11,1186 - 1191 (2004)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  56. Zinshteyn, b &吉尔伯特,w . v .守恒的tRNA的反密码子修改扰乱细胞信号。公共科学图书馆麝猫。9e1003675 (2013)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  57. Nedialkova d d & Leidel s . a .优化密码子翻译利率通过tRNA修改保持蛋白质组的完整性。细胞161年,1606 - 1618 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  58. 菲尔普斯,S。,Malkiewicz, A., Agris, P. F. & Joseph, S. Modified nucleotides in tRNA利斯河和tRNA瓦尔对易位很重要。j·摩尔,杂志。338年,439 - 444 (2004)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  59. 野生动物:&核糖体上,m . v . Thio-modification tRNA的摆动位置调节器动力学的解码和易位的核糖体。j。化学。Soc。139年,5857 - 5864 (2017)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  60. 墨菲,f . v . t . & Ramakrishnan诉结构purine-purine摆动碱基对的解码核糖体的中心。Nat。结构。摩尔。杂志。11,1251 - 1252 (2004)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  61. 狼,J。,Gerber, A. P. & Keller, W. tadA, an essential tRNA-specific adenosine deaminase from大肠杆菌EMBO J。21,3841 - 3851 (2002)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  62. 嘉宝,a p &凯勒,w .腺苷脱氨酶产生肌苷在摆动位置的图示。科学286年,1146 - 1149 (1999)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  63. 托雷斯,a . g . et al .肌苷的修改在人类转运rna结合前体tRNA的水平。核酸Res。43,5145 - 5157 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  64. 诺沃亚,e . M。,Pavon-Eternod, M., Pan, T. & Ribas de Pouplana, L. A role for tRNA modifications in genome structure and codon usage.细胞149年,202 - 213 (2012)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  65. 守屋,j . et al .小说修改核苷发现在第一位置的反密码子的蛋氨酸tRNA牛肝线粒体。生物化学33,2234 - 2239 (1994)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  66. Takemoto, c . et al .非常规解码AUA密码子的线粒体tRNA蛋氨酸见过与反密码子f5标出,揭示线粒体在体外翻译系统。核酸Res。37,1616 - 1627 (2009)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  67. Cantara, w。,墨菲,f . v . T。,Demirci, H. & Agris, P. F. Expanded use of sense codons is regulated by modified cytidines in tRNA.Proc。《科学。美国110年,10964 - 10969 (2013)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  68. Nakano, s . et al . NSUN3甲基化酶启动5-formylcytidine人类线粒体tRNA生源论见过Nat,化学。医学杂志。12,546 - 551 (2016)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  69. Van高级,l . et al .甲基化不足和mt-tRNA甲酰化见过摆动胞嘧啶在NSUN3病人携带突变。Commun Nat。712039 (2016)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  70. Haag, s . et al . NSUN3 ABH1修改mt-tRNA的摆动位置见过扩大在线粒体的密码子识别翻译。EMBO J。35,2104 - 2119 (2016)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  71. Kawarada, l . et al . ALKBH1 RNA加双氧酶负责细胞质和线粒体tRNA的修改。核酸Res。45,7401 - 7415 (2017)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  72. Copela,洛杉矶。,Fernandez, C. F., Sherrer, R. L. & Wolin, S. L. Competition between the Rex1 exonuclease and the La protein affects both Trf4p-mediated RNA quality control and pre-tRNA maturation.核糖核酸14,1214 - 1227 (2008)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  73. Kadaba, et al。核监测和hypomodified发起者tRNA退化见过酿酒酵母Dev的基因。18,1227 - 1240 (2004)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  74. Alexandrov, et al。快速tRNA衰减会导致缺乏不必要的修改。摩尔。细胞21,87 - 96 (2006)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  75. Dewe, j . M。,Whipple, J. M., Chernyakov, I., Jaramillo, L. N. & Phizicky, E. M. The yeast rapid tRNA decay pathway competes with elongation factor 1A for substrate tRNAs and acts on tRNAs lacking one or more of several modifications.核糖核酸18,1886 - 1896 (2012)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  76. 铃木T。,Nagano, T. & Suzuki, T. Human mitochondrial diseases caused by lack of taurine modification in mitochondrial tRNAs.威利Interdiscip。启RNA2,376 - 386 (2011)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  77. laowai n . et al . Mitochondria-specific RNA-modifying酶负责摆动基地线粒体生物合成的图示。对人类线粒体疾病的分子发病机制的影响。生物。化学。280年,1613 - 1624 (2005)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  78. 赫,r . j .牛磺酸的生理行为。杂志。牧师。72年,101 - 163 (1992)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  79. Bouckenooghe, T。,Remacle, C. & Reusens, B. Is taurine a functional nutrient?咕咕叫。当今。中国。减轻。金属底座。护理9,728 - 733 (2006)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  80. Verbrugghe, a & Bakovic m的一个碳代谢特性严格的食肉猫和猫肝脂沉积症的作用。营养物质5,2811 - 2835 (2013)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  81. 莫里斯,j·g .特殊营养需求的猫似乎食源性的进化适应。减轻。牧师》。15,153 - 168 (2002)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  82. 谢弗,s W。郑大世,c·J。华纳,D。,Ito, T. & Azuma, J. Taurine deficiency and MELAS are closely related syndromes.放置Exp。地中海,杂志。776年,153 - 165 (2013)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  83. Sturman j . a牛磺酸在发展。杂志。牧师。73年,119 - 147 (1993)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  84. Seikai, T。,Takeuchi, T. & Park, G. S. Comparison of growth, feed efficiency, and chemical composition of juvenile flounder fed live mysids and formula feed under laboratory conditions.鱼。科学。63年,520 - 526 (1997)。

    中科院谷歌学术搜索

  85. Sochacka、大肠等。C5-substituents尿苷和2-thiouridines出席tRNA的摆动位置确定keto-enol或两性离子的形成形式——读数精度的因素重要的鸟嘌呤核苷的3-end mRNA密码子。核酸Res。45,4825 - 4836 (2017)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  86. 菊池,G。,Motokawa, Y., Yoshida, T. & Hiraga, K. Glycine cleavage system: reaction mechanism, physiological significance, and hyperglycinemia.Proc。日本。专科学校爵士。B物理。医学杂志。科学。84年,246 - 263 (2008)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  87. 潜水鸟,g s & Rabinowitz j . d .一个碳代谢在健康和疾病。细胞金属底座。2527-42 (2017)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  88. Morscher, r . j . et al .线粒体翻译需要folate-dependent tRNA甲基化。自然554年,128 - 132 (2018)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  89. 你们,j . et al .丝氨酸分解代谢调节线粒体氧化还原控制在缺氧。癌症。4,1406 - 1417 (2014)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  90. 哇,C . C。,Chen, W. C., Teo, X. Q., Radda, G. K. & Lee, P. T. Downregulating serine hydroxymethyltransferase 2 (SHMT2) suppresses tumorigenesis in human hepatocellular carcinoma.Oncotarget7,53005 - 53017 (2016)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  91. Hashizume, o . et al .表观遗传调控nuclear-coded GCAT和SHMT2基因赋予人类与年龄有关的线粒体呼吸缺陷。科学。代表。510434 (2015)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  92. 莫雷,a . m .叶酸生物利用度和健康。Int。j . Vitam。减轻。Res。72年,46 - 52点(2002)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  93. Thiaville, p . C。,Iwata-Reuyl, D. & de Crecy-Lagard, V. Diversity of the biosynthesis pathway for threonylcarbamoyladenosine (t6),一个普遍的tRNA的修改。RNA杂志。11,1529 - 1539 (2014)。

    PubMed谷歌学术搜索

  94. 施魏策尔,m . P。切,g B。,Baczynskyj, L. & Hall, R. H. Aminoacyl nucleosides. VII. N-(Purin-6-ylcarbamoyl)threonine. A new component of transfer ribonucleic acid.生物化学8,3283 - 3289 (1969)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  95. Rozov,。,Demeshkina, N., Westhof, E., Yusupov, M. & Yusupova, G. Structural insights into the translational infidelity mechanism.Commun Nat。67251 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  96. Srinivasan m . et al,高度保守的KEOPS / EKC复杂是至关重要的一个普遍的tRNA修改,t6一个。EMBO J。30.,873 - 881 (2011)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  97. El Yacoubi et al。普遍的角色Kae1 / Qri7 YgjD (COG0533)家庭tRNA修改。EMBO J。30.,882 - 893 (2011)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  98. 林,h . et al . CO2敏感的tRNA修改与人类线粒体疾病有关。Commun Nat。91875 (2018)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  99. 史密斯·d·G。,Pal, R. & Parker, D. Measuring equilibrium bicarbonate concentrations directly in cellular mitochondria and in human serum using europium/terbium emission intensity ratios.化学18,11604 - 11613 (2012)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  100. 西门g . l .针对HIF-1癌症治疗。Nat。启癌症3,721 - 732 (2003)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  101. Benej m . et al .第九碳酸酐酶:监管和癌症的作用。亚晶胞。物化学。75年,199 - 219 (2014)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  102. 范德Heiden, m·G。,Cantley, L. C. & Thompson, C. B. Understanding the Warburg effect: the metabolic requirements of cell proliferation.科学324年,1029 - 1033 (2009)。

    谷歌学术搜索

  103. Nishimura s结构、生物合成和功能queuosine转移核糖核酸。掠夺。核酸研究摩尔。杂志。2849 - 73 (1983)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  104. 开赛,H。,Kuchino Y。,Nihei, K. & Nishimura, S. Distribution of the modified nucleoside Q and its derivatives in animal and plant transfer RNA’s.核酸Res。2,1931 - 1939 (1975)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  105. Iwata-Reuyl, d .生物合成7-deazaguanosine hypermodified转移核糖核酸的核苷。Bioorg化学。31日24-43 (2003)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  106. 标志、t & Farkas w . r .饮食的影响缺乏酪氨酸和queuine无菌的老鼠。物化学。Biophys。Commun >,230年,233 - 237 (1997)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  107. 法卡斯,w . r .饮食对无菌鼠的queuosine家庭的图示。生物。化学。255年,6832 - 6835 (1980)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  108. 哈特菲尔德,d . et al .色谱分析aminoacyl-tRNAs翻译所需的密码子在艾滋病毒和核糖体转移地点,htlv 1, BLV。加载病毒学173年,736 - 742 (1989)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  109. 穆勒,m . et al . Queuine链接在真核生物转化控制细菌的微量营养素。核酸Res。47,3711 - 3727 (2019)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  110. Tuorto, f . et al . Queuosine-modified转运rna带来营养控制蛋白质的翻译。EMBO J。37e99777 (2018)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  111. Iwata-Reuyl d & de Crecy-Lagard诉DNA和RNA修饰酶:结构、机理、功能和演化,377 - 391(兰德斯生物科学,2009)。

  112. 陈,y . C。,Kelly, V. P., Stachura, S. V. & Garcia, G. A. Characterization of the human tRNA-guanine transglycosylase: confirmation of the heterodimeric subunit structure.核糖核酸16,958 - 968 (2010)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  113. 博兰,C。,Hayes, P., Santa-Maria, I., Nishimura, S. & Kelly, V. P. Queuosine formation in eukaryotic tRNA occurs via a mitochondria-localized heteromeric transglycosylase.生物。化学。284年,18218 - 18227 (2009)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  114. Rakovich, t . et al . Queuosine缺乏真核生物妥协通过增加四氢生物蝶呤氧化酪氨酸生产。生物。化学。286年,19354 - 19363 (2011)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  115. 汉森,g . &科勒,j .密码子最优偏差和使用翻译和mRNA衰变。Nat。启摩尔。细胞杂志。1920 - 30 (2018)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  116. 戈尔曼,g . s . et al .线粒体疾病。Nat。启说,拘谨的。216080 (2016)。

    PubMed谷歌学术搜索

  117. 华莱士特区线粒体范式的代谢和退化性疾病,衰老和癌症:进化医学的黎明。为基础。启麝猫。39,359 - 407 (2005)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  118. Pavlakis, s G。,Phillips, P. C., DiMauro, S., De Vivo, D. C. & Rowland, L. P. Mitochondrial myopathy, encephalopathy, lactic acidosis, and strokelike episodes: a distinctive clinical syndrome.安。神经。16,481 - 488 (1984)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  119. 时代,N。,Tokiguchi, S., Shirakawa, K. & Tsubaki, T. Myoclonus epilepsy associated with ragged-red fibres (mitochondrial abnormalities): disease entity or a syndrome? Light-and electron-microscopic studies of two cases and review of literature.j .神经。科学。47,117 - 133 (1980)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  120. Goto, Y。,Nonaka, I. & Horai, S. A mutation in the tRNA低浓缩铀(UUR)基因与线粒体encephalomyopathies的米拉子群。自然348年,651 - 653 (1990)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  121. Shoffner, j . m . et al .肌阵挛癫痫和ragged-red纤维病(MERRF)是线粒体DNA tRNA利斯河突变。细胞61年,931 - 937 (1990)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  122. Goto, Y。,Nonaka, I. & Horai, S. A new mtDNA mutation associated with mitochondrial myopathy, encephalopathy, lactic acidosis and stroke-like episodes (MELAS).Biochim。Biophys。学报1097年,238 - 240 (1991)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  123. 凯利,s . O。,Steinberg, S. V. & Schimmel, P. Functional defects of pathogenic human mitochondrial tRNAs related to structural fragility.Nat。结构。医学杂志。7,862 - 865 (2000)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  124. Yasukawa, t . et al .修改缺陷在反密码子摆动线粒体转运rna的核苷酸低浓缩铀(UUR)和线粒体肌病的致病突变,脑病,乳酸酸中毒,类似中风发作。生物。化学。275年,4251 - 4257 (2000)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  125. Kirino Y。Goto, Y。,Campos, Y., Arenas, J. & Suzuki, T. Specific correlation between the wobble modification deficiency in mutant tRNAs and the clinical features of a human mitochondrial disease.Proc。《科学。美国102年,7127 - 7132 (2005)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  126. Yasukawa、t . et al .摆动修改中缺乏突变trna线粒体疾病患者。2月。579年,2948 - 2952 (2005)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  127. Yasukawa, t . et al。在修改缺陷线粒体tRNA的反密码子摆动核苷酸利斯河与MERRF encephalomyopathy致病突变。2月。467年,175 - 178 (2000)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  128. 里希特,等。RNA修改人类线粒体tRNA的景观利斯河调节蛋白质合成。Commun Nat。93966 (2018)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  129. Hayashi, j . et al .积累mtDNA tRNA基因突变在3271位置低浓缩铀(UUR)从看见病人基因引入海拉细胞缺乏mtDNA导致进步抑制线粒体呼吸功能。物化学。Biophys。Commun >,197年,1049 - 1055 (1993)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  130. 邓巴,d R。,Moonie, P. A., Zeviani, M. & Holt, I. J. Complex I deficiency is associated with 3243G:C mitochondrial DNA in osteosarcoma cell cybrids.嗡嗡声。摩尔,麝猫。5,123 - 129 (1996)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  131. Rikimaru, m . et al .牛磺酸改善线粒体功能受损,防止类似中风发作患者米拉。实习生。地中海。51,3351 - 3357 (2012)。

    PubMed谷歌学术搜索

  132. 沢,y . et al。补充牛磺酸在米拉预防类似中风的情节:一个多中心、非盲、52周III期试验。j .神经。Neurosurg。精神病学90年,529 - 536 (2019)。

    PubMed谷歌学术搜索

  133. 托雷斯,a G。,Batlle, E. & Ribas de Pouplana, L. Role of tRNA modifications in human diseases.趋势地中海摩尔。。20.,306 - 314 (2014)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  134. 拉莫斯,j .傅& d tRNA的新兴影响大脑和神经系统的修改。Biochim。Biophys。Acta Regul基因。动力机械。1862年,412 - 428 (2019)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  135. Ghezzi, d . et al .突变mitochondrial-tRNA修饰符MTO1导致肥厚性心肌病和乳酸酸中毒。点。j .的嗡嗡声。麝猫。90年,1079 - 1087 (2012)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  136. Baruffini、大肠等。MTO1变异与肥厚性心肌病和乳酸酸中毒,导致人体缺乏呼吸链和酵母。嗡嗡声。Mutat。34,1501 - 1509 (2013)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  137. Fakruddin, m . et al。有缺陷的线粒体tRNA牛磺酸修改激活全球proteostress和导致线粒体疾病。细胞的代表。22,482 - 496 (2018)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  138. Kopajtich, r . et al . GTPBP3突变引起线粒体翻译与肥厚性心肌病相关缺陷,乳酸酸中毒,脑病。点。j .的嗡嗡声。麝猫。95年,708 - 720 (2014)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  139. Zeharia, a . et al .小儿急性肝衰竭由于TRMU基因的突变。点。j .的嗡嗡声。麝猫。85年,401 - 407 (2009)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  140. 吴,y . et al . Mtu1-mediated thiouridine线粒体的形成需要转运rna线粒体翻译和可逆的小儿肝损伤。公共科学图书馆麝猫。12e1006355 (2016)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  141. Paramasivam,。之一Meena, a K。,Venkatapathi, C., Pitceathly, R. D. S. & Thangaraj, K. Novel biallelic NSUN3 variants cause early-onset mitochondrial encephalomyopathy and seizures.j·摩尔。>。70年,1962 - 1965 (2020)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  142. 巴顿,j . R。,Bykhovskaya, Y., Mengesha, E., Bertolotto, C. & Fischel-Ghodsian, N. Mitochondrial myopathy and sideroblastic anemia (MLASA): missense mutation in the pseudouridine synthase 1 (PUS1) gene is associated with the loss of tRNA pseudouridylation.生物。化学。280年,19823 - 19828 (2005)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  143. 曼,j . e . et al .假尿苷合酶1缺陷小鼠模型为线粒体肌病sideroblastic贫血,展示肌肉的形态和生理变化。科学。代表。626202 (2016)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  144. 如何判定,t . m .等人信使rna结构决定修改假尿苷合酶1。Nat,化学。医学杂志。15,966 - 974 (2019)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  145. 赵,x et al。监管核受体活性的假尿苷合酶通过类固醇受体激活RNA的转录后的修改。摩尔。细胞15,549 - 558 (2004)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  146. Karijolich, J。,Yi, C. & Yu, Y. T. Transcriptome-wide dynamics of RNA pseudouridylation.Nat。启摩尔。细胞杂志。16,581 - 585 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  147. 莱利,c . m . et al。中央自主功能障碍与缺陷流泪;报告5例。儿科3,468 - 478 (1949)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  148. Norcliffe-Kaufmann, L。,Slaugenhaupt, S. A. & Kaufmann, H. Familial dysautonomia: history, genotype, phenotype and translational research.掠夺。一般人。152年,131 - 148 (2017)。

    PubMed谷歌学术搜索

  149. 安德森,s . l . et al .家族性神经异常是由IKAP基因的突变引起的。点。j .的嗡嗡声。麝猫。68年,753 - 758 (2001)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  150. 黄,B。,约翰逊,m . J。& Bystrom, A. S. An early step in wobble uridine tRNA modification requires the elongator complex.核糖核酸11,424 - 436 (2005)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  151. 约翰逊,m . j . O。,Xu, F. & Bystrom, A. S. Elongator-a tRNA modifying complex that promotes efficient translational decoding.Biochim。Biophys。Acta Regul基因。动力机械。1861年,401 - 408 (2018)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  152. Krutyholowa, R。,Zakrzewski, K. & Glatt, S. Charging the code - tRNA modification complexes.咕咕叫。当今。结构体。医学杂志。55,138 - 146 (2019)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  153. Karlsborn, T。,Tukenmez, H。,Chen, C. & Bystrom, A. S. Familial dysautonomia (FD) patients have reduced levels of the modified wobble nucleoside mcm5年代2在tRNA U。物化学。Biophys。Commun >,454年,441 - 445 (2014)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  154. 陈,y . t . et al .鼠标Ikbkap,亚基延伸机,导致转录赤字和胚胎可以拯救人类Ikbkap杀伤力。摩尔。细胞。医学杂志。29日,736 - 744 (2009)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  155. 科恩,j . s . et al . ELP2是一种新型的基因与神经发育障碍。点。j .地中海,麝猫。一个167年,1391 - 1395 (2015)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  156. 辛普森,c . l . et al .延伸机蛋白3 (ELP3)基因的变异与运动神经元变性有关。嗡嗡声。摩尔,麝猫。18,472 - 481 (2009)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  157. Edvardson,美国等人tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase缺陷由于KAE1 / TCS3 (OSGEP)突变清单由神经退化和肾tubulopathy。欧元。j .的嗡嗡声。麝猫。25,545 - 551 (2017)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  158. 布劳恩,d . a . et al . KEOPS-complex基因突变导致肾病综合症主要头小畸型。Nat,麝猫。49,1529 - 1538 (2017)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  159. Galloway w·h·& Mowat a p .先天性头小畸型食管裂孔疝和肾病综合症在两个兄弟姐妹。j .地中海,麝猫。5,319 - 321 (1968)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  160. Abbasi-Moheb, l . et al . NSUN2突变导致常染色体隐形智力残疾。点。j .的嗡嗡声。麝猫。90年,847 - 855 (2012)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  161. Davarniya, b . et al。小说的角色TRMT1基因突变和稀有GRM1基因缺陷在两个阿塞拜疆家庭智力障碍。《公共科学图书馆•综合》10e0129631 (2015)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  162. Freude教授k . et al . FTSJ1突变基因编码一种小说S-adenosylmethionine-binding蛋白质引起nonsyndromic x连锁精神发育迟滞。点。j .的嗡嗡声。麝猫。75年,305 - 309 (2004)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  163. 夏新,R。,一个l-Salam, Z., El-Hattab, A. W. & Alkuraya, F. S. The syndrome dysmorphic facies, renal agenesis, ambiguous genitalia, microcephaly, polydactyly and lissencephaly (DREAM-PL): report of two additional patients.点。j .地中海,麝猫。一个170年,3222 - 3226 (2016)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  164. Alazami, a . m . et al . ADAT3的突变编码腺苷脱氨酶作用于转移核糖核酸,会导致智力障碍和斜视。j .地中海,麝猫。50,425 - 430 (2013)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  165. Lentini, j . M。,一个lsaif, H. S., Faqeih, E., Alkuraya, F. S. & Fu, D. DALRD3 encodes a protein mutated in epileptic encephalopathy that targets arginine tRNAs for 3-methylcytosine modification.Commun Nat。112510 (2020)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  166. Goodarzi, h . et al .调制驱动特定的trna基因表达的表达和癌症进展。细胞165年,1416 - 1427 (2016)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  167. Gingold, h . et al .双重计划翻译调节细胞增殖和分化。细胞158年,1281 - 1292 (2014)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  168. Pavon-Eternod, m .等人tRNA表达在乳腺癌和功能的后果。核酸Res。37,7268 - 7280 (2009)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  169. 桑托斯,M。,Fidalgo, A., Varanda, A. S., Oliveira, C. & Santos, M. A. S. tRNA deregulation and its consequences in cancer.趋势地中海摩尔。。25,853 - 865 (2019)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  170. 德劳内,s & Frye m RNA修改调节细胞命运的癌症。Nat,细胞生物。21,552 - 559 (2019)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  171. 夏新,r . et al .突变WDR4损害tRNA m7G46甲基化和引起不同形式的microcephalic原始侏儒症。基因组医学杂志。16210 (2015)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  172. 林,s . et al . Mettl1 / Wdr4-mediated m7G tRNA methylome需要正常的信使核糖核酸的翻译和胚胎干细胞自我更新和分化。摩尔。细胞71年,244 - 255 e245 (2018)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  173. 冈本先生等人tRNA修改酶,NSUN2 METTL1,决定在海拉细胞对5 -氟尿嘧啶的敏感性。公共科学图书馆麝猫。10e1004639 (2014)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  174. Gustavsson, m &朗尼,h .证据表明tRNA修饰酶在酵母体内的5 -氟尿嘧啶目标很重要。核糖核酸14,666 - 674 (2008)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  175. 布兰科,s . et al .干细胞功能和压力反应是由蛋白质合成。自然534年,335 - 340 (2016)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  176. 马丁内斯,f . j . et al .全外显子组测序识别剪接变异在NSUN2 Dubowitz-like综合症的原因。j .地中海,麝猫。49,380 - 385 (2012)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  177. 汗,m·a . et al . NSUN2的突变编码RNA甲基转移酶,导致常染色体隐形智力残疾。点。j .的嗡嗡声。麝猫。90年,856 - 863 (2012)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  178. 布兰科,s . et al .异常甲基化的图示连接细胞压力神经发育障碍。EMBO J。33,2020 - 2039 (2014)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  179. Rapino, f . et al . Codon-specific翻译重组促进抵抗靶向治疗。自然558年,605 - 609 (2018)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  180. 麦克马洪,m &另,d .摇摇晃晃的耐药性在黑色素瘤:tRNA-modifying酶翻译重新编程。EMBO J。37e99978 (2018)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  181. 卡尔森,b . a . et al .转移核糖核酸修改状态影响逆转录病毒核糖体移码。病毒学255年,2 - 8 (1999)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  182. 为Waas, w·F。,Druzina, Z., Hanan, M. & Schimmel, P. Role of a tRNA base modification and its precursors in frameshifting in eukaryotes.生物。化学。282年,26026 - 26034 (2007)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  183. Droogmans, l . & Grosjean h .酶转化鸟苷3 '毗邻酵母tRNA的反密码子板式换热器N1-methylguanosine怀依核苷:反密码子序列的依赖。EMBO J。6,477 - 483 (1987)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  184. 诺玛,一个。,Kirino Y。,Ikeuchi, Y. & Suzuki, T. Biosynthesis of wybutosine, a hyper-modified nucleoside in eukaryotic phenylalanine tRNA.EMBO J。25,2142 - 2154 (2006)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  185. 诺玛,et al。扩大jumonji C的作用域作为一个RNA羟化酶。生物。化学。285年,34503 - 34507 (2010)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  186. 为Waas, w·F。,de Crecy-Lagard, V. & Schimmel, P. Discovery of a gene family critical to wyosine base formation in a subset of phenylalanine-specific transfer RNAs.生物。化学。280年,37616 - 37622 (2005)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  187. 格伦伯格,D。,Weinstein, I. B. & Mushinski, J. F. Deficiency of the Y base in a hepatoma phenylalanine tRNA.自然253年,66 - 67 (1975)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  188. Kuchino Y。Borek E。,格伦伯格,D。,Mushinski, J. F. & Nishimura, S. Changes of post-transcriptional modification of wye base in tumor-specific tRNA板式换热器核酸Res。10,6421 - 6432 (1982)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  189. Rossello-Tortella, m . et al。表观遗传损失RNA-modifying转移酶TYW2诱发核糖体在结肠癌转移。Proc。《科学。美国117年,20785 - 20793 (2020)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  190. 哈特菲尔德,d . et al .色谱分析aminoacyl-tRNAs翻译所需的密码子在艾滋病毒和核糖体转移地点,htlv 1, BLV。加载病毒学173年,736 - 742 (1989)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  191. 10张,h . et al . GSK-3beta-regulated N-acetyltransferase参与大肠癌入侵。中国。癌症Res。20.,4717 - 4729 (2014)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  192. 问:et al . NAT10沈,核仁的蛋白质,本地化的中间体和微管调节胞质分裂和乙酰化作用。Exp。细胞Res。315年,1653 - 1667 (2009)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  193. Larrieu D。,Britton, S., Demir, M., Rodriguez, R. & Jackson, S. P. Chemical inhibition of NAT10 corrects defects of laminopathic cells.科学344年,527 - 532 (2014)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  194. Ito, s . et al .人类NAT10 ATP-dependent RNA乙酰转移酶负责N4-acetylcytidine形成18 s核糖体RNA (rRNA)。生物。化学。289年,35724 - 35730 (2014)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  195. 沙玛,s . et al .酵母Kre33和人类NAT10是守恒的18 s rRNA胞嘧啶乙酰转移酶修改图示适配器Tan1 / THUMPD1协助。核酸Res。43,2242 - 2258 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  196. 希克斯,d . g . et al . TRMT2A的表达,一种新颖的细胞周期调节蛋白,确定一个子集的乳腺癌HER2过表达患者复发的风险增加。BMC癌症10108 (2010)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  197. 傅,d . et al。人类AlkB同族体ABH8 tRNA摆动尿苷修改所需的甲基转移酶和DNA损伤的生存。摩尔。细胞。医学杂志。30.,2449 - 2459 (2010)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  198. 傅,y . et al。哺乳动物的AlkB领域ABH8催化羟基化的5-methoxycarbonylmethyluridine摆动tRNA的位置。Angew。化学。Int,艾德。英格兰。49,8885 - 8888 (2010)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  199. Songe-Moller, l . et al .哺乳动物ALKBH8拥有tRNA甲基转移酶活动所需的多个摆动尿苷的生物起源的修改与平动解码。摩尔。细胞。医学杂志。30.,1814 - 1827 (2010)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  200. 什k . et al .小说人类AlkB同系物,ALKBH8,有助于人类膀胱癌症恶化。癌症Res。69年,3157 - 3164 (2009)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  201. 钱,D。,Vagbo, C. B., Al-Owain, M., Alhomaidi, S. & Alkuraya, F. S. Recessive truncating mutations in ALKBH8 cause intellectual disability and severe impairment of wobble uridine modification.点。j .的嗡嗡声。麝猫。104年,1202 - 1209 (2019)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  202. Steinthorsdottir诉et al。一个变种在CDKAL1影响胰岛素反应和2型糖尿病的风险。Nat,麝猫。39,770 - 775 (2007)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  203. Arragain, s . et al .识别真核和原核生物合成的methylthiotransferase 2-methylthio-N6-threonylcarbamoyladenosine tRNA。生物。化学。285年,28425 - 28433 (2010)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  204. 魏、f . y . et al . tRNA的赤字利斯河修改Cdkal1导致小鼠2型糖尿病的发展。j .中国。投资。121年,3598 - 3608 (2011)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  205. 桑托斯,m . et al . Irp2调节胰岛素生产通过iron-mediated Cdkal1-catalyzed tRNA修改。Commun Nat。11296 (2020)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  206. 铃木T。,Ikeuchi, Y., Noma, A., Suzuki, T. & Sakaguchi, Y. Mass spectrometric identification and characterization of RNA-modifying enzymes.Enzymol方法。425年,211 - 229 (2007)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  207. 苏,d . et al .核糖核苷的定量分析修改的tRNA HPLC-coupled质谱分析。Protoc Nat。9,828 - 841 (2014)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  208. 罗斯,r . L。,Cao, X. & Limbach, P. A. Mapping post-transcriptional modifications onto transfer ribonucleic acid sequences by liquid chromatography tandem mass spectrometry.生物分子721岁(2017年)。

    公共医学中心谷歌学术搜索

  209. Pomerantz, s c &麦克洛斯基j . a .分析RNA由液相色谱-光谱法等。Enzymol方法。193年,796 - 824 (1990)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  210. 坂口,Y。,Miyauchi, K。,Kang, B. I. & Suzuki, T. Nucleoside analysis by hydrophilic interaction liquid chromatography coupled with mass spectrometry.Enzymol方法。560年19-28 (2015)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  211. Heiss, M。,赖赫利,v F。& Kellner, S. Observing the fate of tRNA and its modifications by nucleic acid isotope labeling mass spectrometry: NAIL-MS.RNA杂志。14,1260 - 1268 (2017)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  212. 铃木Ohira t & t前体的图示被methylguanosine帽结构稳定。Nat,化学。医学杂志。12,648 - 655 (2016)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  213. Garalde, d . r . et al .高度并行直接RNA序列在纳米孔的数组。Nat方法。15,201 - 206 (2018)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  214. 金,d . et al . SARS-CoV-2转录的体系结构。细胞181年,914 - 921 e910 (2020)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  215. Smith, a . M。耆那教徒,M。,Mulroney, L., Garalde, D. R. & Akeson, M. Reading canonical and modified nucleobases in 16S ribosomal RNA using nanopore native RNA sequencing.《公共科学图书馆•综合》14e0216709 (2019)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  216. 刘,h . et al . m的准确检测6RNA在本地修改RNA序列。Commun Nat。104079 (2019)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  217. 工人,r . e . et al .纳米孔本机RNA转录组测序人类保利(a)。Nat方法。16,1297 - 1305 (2019)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  218. Guzzi: et al . Pseudouridylation tRNA-derived碎片引导平移控制干细胞。细胞173年,1204 - 1216 e1226 (2018)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  219. Yarham, j . w . et al。我有缺陷的6A37修改线粒体和胞质图示结果TRIT1及其基质tRNA的致病突变。公共科学图书馆麝猫。10e1004424 (2014)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  220. 鲍威尔,c . a . et al . TRMT5突变导致转录后修饰缺陷线粒体tRNA与多个呼吸链相关的缺陷。点。j .的嗡嗡声。麝猫。97年,319 - 328 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  221. Igoillo-Esteve, m .等人tRNA基因甲基转移酶同系物TRMT10A年轻糖尿病和主头小畸型的突变在人类身上。公共科学图书馆麝猫。9e1003888 (2013)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  222. Vilardo,大肠& Rossmanith w .分子见解HSD10疾病:SDR5C1突变对人类的影响线粒体核糖核酸酶P复杂。核酸Res。43,5112 - 5119 (2015)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  223. 陈,j . &巴顿,j . r .假尿苷合酶3鼠标修改tRNA的反密码子循环。生物化学39,12723 - 12730 (2000)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  224. Lecointe、f . et al .描述酵母蛋白质Deg1假尿苷合酶(Pus3)催化的形成psi 38和39 psi tRNA反密码子循环。生物。化学。273年,1316 - 1323 (1998)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  225. 夏新,r . et al .突变纯合子形成PUS3扩大tRNA的角色在认知正常修改。嗡嗡声。麝猫。135年,707 - 713 (2016)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  226. 这,a . p . m . et al .变异与演讲推迟PUS7引起智力障碍,头小畸型,身材矮小,攻击性行为。点。j .的嗡嗡声。麝猫。103年,1045 - 1052 (2018)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  227. Arrondel, c . et al .缺陷t6tRNA修改由于GON7和YRDC突变导致Galloway-Mowat综合症。Commun Nat。103967 (2019)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  228. 罗德里格斯,v . et al .染色体8 BAC阵列比较基因组杂交和表达分析识别放大和超表达TRMT12的乳腺癌。癌症基因的染色体46,694 - 707 (2007)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  229. 罗德里格斯,诉et al。结构分析人类TYW2所需酶的生物合成高度修改wybutosine phenylalanine-tRNA (yW)基地。《公共科学图书馆•综合》7e39297 (2012)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  230. de Crecy-Lagard诉et al .匹配tRNA修改在人类认识和预测酶。核酸Res。47,2143 - 2159 (2019)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  231. Miyauchi, K。,Ohara, T. & Suzuki, T. Automated parallel isolation of multiple species of non-coding RNAs by the reciprocal circulating chromatography method.核酸Res。35e24 (2007)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  232. 铃木铃木t & t .念珠柱层析法:隔离大量的个人rna在一个单一的步骤。Enzymol方法。425年,231 - 239 (2007)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  233. Nagao, a . et al .羟基化的守恒的tRNA修改建立不通用的棘皮动物线粒体遗传密码。Nat。结构。摩尔。杂志。24,778 - 782 (2017)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  234. 克罗格,j . s . et al . 3 - (3-amino-3-carboxypropyl) 5、6-dihydrouridine是两种新型转录后修饰在tRNALys(下面)锥虫属brucei。2月J。278年,4782 - 4796 (2011)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  235. Miyauchi, K。,木村,S。& Suzuki, T. A cyclic form ofN6作为一个广泛分布的tRNA hypermodification -threonylcarbamoyladenosine。Nat,化学。医学杂志。9,105 - 111 (2013)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  236. Matuszewski, m . et al .乙内酰脲同种型循环N6-threonylcarbamoyladenosine (ct6在图示)。核酸Res。45,2137 - 2149 (2017)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  237. Kang调查局et al . 2-methylthio循环的识别N6-threonylcarbamoyladenosine(女士2ct6)作为小说RNA在37的图示位置修改。核酸Res。45,2124 - 2136 (2017)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  238. 萨拉查,j . C。,一个mbrogelly, A., Crain, P. F., McCloskey, J. A. & Soll, D. A truncated aminoacyl-tRNA synthetase modifies RNA.Proc。《科学。美国101年,7536 - 7541 (2004)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  239. Ikeuchi, y . et al . Agmatine-conjugated胞嘧啶核苷的tRNA反密码子对AUA古生菌的解码过程至关重要。Nat,化学。医学杂志。6,277 - 282 (2010)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  240. d . et al . Agmatidine Mandal,修改密码子的热点tRNA胞嘧啶核苷Ile,碱基对腺苷但不与鸟嘌呤核苷。Proc。《科学。美国107年,2872 - 2877 (2010)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  241. Mandal, d . et al .标识和密码子阅读的属性5-cyanomethyl尿苷,修改一个新的核苷中发现的反密码子摆动位置变异haloarchaeal异亮氨酸图示。核糖核酸20.,177 - 188 (2014)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  242. 玫瑰,s . et al . hyperthermophilic伙伴Nanoarchaeum Ignicoccus稳定他们的tRNA T-loops通过不同但结构相同的修改。核酸Res。48,6906 - 6918 (2020)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  243. 酒井法子,Y。,Miyauchi, K。,木村,S。& Suzuki, T. Biogenesis and growth phase-dependent alteration of 5-methoxycarbonylmethoxyuridine in tRNA anticodons.核酸Res。44,509 - 523 (2016)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  244. 陈,P。,Crain, P. F., Nasvall, S. J., Pomerantz, S. C. & Bjork, G. R. A “gain of function” mutation in a protein mediates production of novel modified nucleosides.EMBO J。24,1842 - 1851 (2005)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  245. Dumelin, c, E。陈,Y。,Leconte, A. M., Chen, Y. G. & Liu, D. R. Discovery and biological characterization of geranylated RNA in bacteria.Nat,化学。医学杂志。8,913 - 919 (2012)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  246. 木豆Magro, c . et al .大大增加化学各种RNA包含thioacetal结构修改。Angew。化学。Int。。57,7893 - 7897 (2018)。

    中科院谷歌学术搜索

  247. 贼鸥,G。,陈,P。& Bjork, G. R. Transfer RNA bound to MnmH protein is enriched with geranylated tRNA–a possible intermediate in its selenation?《公共科学图书馆•综合》11e0153488 (2016)。

    PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

  248. Sierant, m . et al。大肠杆菌tRNA 2-selenouridine合成酶(SelU)转换S2U-RNA通过S-geranylated-intermediate Se2U-RNA。2月。592年,2248 - 2258 (2018)。

    中科院PubMed谷歌学术搜索

  249. 赖赫利,v F。,Petrov, D. P., Weber, V., Jung, K. & Kellner, S. NAIL-MS reveals the repair of 2-methylthiocytidine by AlkB in大肠杆菌Commun Nat。105600 (2019)。

    中科院PubMed公共医学中心谷歌学术搜索

下载参考

确认

作者是感激他的实验室的成员,尤其是k . Miyauchi t Ohira和k . Minowa准备表和数据,并提供有价值的建议。这项工作是支持的科研补助金(18 h05272)从jsp和探索性研究先进技术(埃拉托;从JST JPMJER2002)。作者向那些许多贡献的同事道歉tRNA相关修改不能引用综述由于空间限制。

作者信息

作者和联系

作者

相应的作者

对应到Tsutomu铃木

道德声明

相互竞争的利益

作者宣称没有利益冲突。

额外的信息

同行审查的信息

自然评论分子细胞生物学谢谢胡安Alfonzo道潘,另,匿名的,审稿人(s)为他们的贡献的同行评审工作。

出版商的注意

施普林格自然保持中立在发表关于司法主权地图和所属机构。

补充信息

术语表

反密码子

三核苷酸单位职位34-36转移核糖核酸,对应三个核苷酸mRNA的密码子。

阅读框维护

三种可能的mRNA的阅读框架,只有一个阅读框生成正确的氨基酸序列。转移核糖核酸修饰的反密码子是至关重要的维持正确的阅读框。

受体抑制

阀杆结构由七个碱基对组成的5′和3′末端转移核糖核酸。3′CCA序列和鉴别器基础从这个阀杆伸出。

鉴频器基础

第四个核苷酸(73年位置)的3′末端转移核糖核酸(tRNA);经常被氨酰合成酶和氨酰化的是一个决定因素。

家庭的盒子

遗传密码,密码框的四个基码的编码相同的氨基酸。

Two-codon集

遗传密码,密码子组,两个密码子的结局在嘌呤嘧啶或同义(指定相同的氨基酸)。

核糖皱纹

核糖糖环的低应变构象中原子环背井离乡从飞机上。

C3′endo形式

主要的皱纹在一种双工的RNA核糖发现。

快速tRNA衰变

通路的5′3′exonucleolytic退化成熟转移rna(图示),缺乏一定的修改。

Warburg效应

是指肿瘤代谢葡萄糖厌氧,而不是耗氧即使氧气是可用的。

延伸机复杂

一个复杂RNA-modifying转移酶催化5-methoxyarbonylmethyluridine(罗马数字5U)的形成。

权利和权限

再版和权限

关于这篇文章

验证通过CrossMark货币和真实性

引用这篇文章

铃木t的扩大世界tRNA修改及其相关性疾病。Nat牧师摩尔细胞杂志22,375 - 392 (2021)。https://doi.org/10.1038/s41580 - 021 - 00342 - 0

下载引用

  • 接受:

  • 发表:

  • 发行日期:

  • DOI:https://doi.org/10.1038/s41580 - 021 - 00342 - 0

本文引用的

搜索

快速链接

自然简报

报名参加自然简报通讯-重要的科学,每天免费发送到您的收件箱中。

一天中最重要的科学故事,自由在你的收件箱。 报名参加自然简报
Baidu
map