跳到主要内容gydF4y2Ba

感谢您访问nature.com。您使用的是对CSS支持有限的浏览器版本。为了获得最好的体验，我们建议您使用最新的浏览器(或关闭Internet Explorer的兼容性模式)。同时，为了确保持续的支持，我们将在没有样式和JavaScript的情况下显示站点。gydF4y2Ba

单细胞分辨率下的骨髓微环境gydF4y2Ba

自然gydF4y2Ba体积gydF4y2Ba569gydF4y2Ba，gydF4y2Ba页面gydF4y2Ba222 - 228 (gydF4y2Ba2019gydF4y2Ba）gydF4y2Ba引用本文gydF4y2Ba

主题gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba作者修正gydF4y2Ba本文发表于2019年7月12日gydF4y2Ba

本文已被gydF4y2Ba更新gydF4y2Ba

摘要gydF4y2Ba

骨髓微环境在调节造血中起着关键作用，但其分子复杂性和应激反应尚不完全清楚。在这里，我们绘制了小鼠骨髓血管、血管周围和成骨细胞群在单细胞分辨率下的转录景观，包括在稳态和应激诱导的造血条件下。这一分析揭示了以前未被重视的骨髓生态位内的细胞异质性水平，并解决了促造血生长因子、趋化因子和膜结合配体的细胞来源。我们的研究表明，在应激条件下，小生境元素的转录重构相当重要，包括血管周围细胞的脂肪细胞倾斜。在应力诱导的变化中，我们观察到血管Notch δ样配体(编码于gydF4y2BaDll1gydF4y2Ba和gydF4y2BaDll4gydF4y2Ba)被调低了。在没有血管的情况下gydF4y2BaDll4gydF4y2Ba，造血干细胞过早地诱导了髓系转录程序。这些发现完善了我们对骨髓生态位的细胞结构的理解，揭示了对应激高度敏感的动态和异质分子景观，并说明了单细胞转录组数据在评估离散生态位种群对造血的调节方面的应用。gydF4y2Ba

这是订阅内容的预览，gydF4y2Ba通过你所在的机构访问gydF4y2Ba

相关的文章gydF4y2Ba

引用本文的开放获取文章。gydF4y2Ba

访问选项gydF4y2Ba

租或购买这篇文章gydF4y2Ba

只要这篇文章，只要你需要它gydF4y2Ba

39.95美元gydF4y2Ba

了解更多gydF4y2Ba

价格可能受当地税收的影响，在结账时计算gydF4y2Ba

图1:稳定状态下骨髓微环境的scRNA-seq分析。gydF4y2Ba
图2:骨髓微环境中促造血因子的表达。gydF4y2Ba
图3:化疗对骨髓生态位反应的单细胞转录组谱。gydF4y2Ba
图4:血管内皮细胞是心肌梗死的主要来源gydF4y2BaDll4gydF4y2Ba和gydF4y2BaDll1gydF4y2Ba在骨髓中。gydF4y2Ba
图5:血管内皮细胞表达的DLL4可防止造血祖细胞的髓系偏斜。gydF4y2Ba

数据可用性gydF4y2Ba

原始测序数据和表达计数数据存入GEO，登录号gydF4y2BaGSE108892gydF4y2Ba。一个交互式查询和可视化工具的不同人群的骨髓生态位可在gydF4y2Bahttp://aifantislab.com/nichegydF4y2Ba。gydF4y2Ba

改变历史gydF4y2Ba

  • 2019年7月12日gydF4y2Ba

    本文的修正案已经发表，可通过论文顶部的链接访问。gydF4y2Ba

参考文献gydF4y2Ba

  1. 莫里森，S. J. &斯卡登，D. T.造血干细胞的骨髓生态位。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba505gydF4y2Ba， 327-334(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  2. 魏，Q. & Frenette, p.s.造血干细胞及其子代的龛位。gydF4y2Ba免疫力gydF4y2Ba48gydF4y2Ba， 632-648(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  3. 丁，L. & Morrison, S. J.造血干细胞和早期淋巴样祖细胞占据不同的骨髓生态位。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba495gydF4y2Ba， 231-235(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  4. 朱，等。成骨细胞支持b淋巴细胞的承诺和分化从造血干细胞。gydF4y2Ba血gydF4y2Ba109gydF4y2Ba， 3706-3712(2007)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  5. Méndez-Ferrer, S.， Lucas, D.， Battista, M. & Frenette, p.s.造血干细胞释放受昼夜节律振荡调节。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba452gydF4y2Ba， 442-447(2008)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  6. 卢卡斯，D.等。化疗引起的骨髓神经损伤损害造血再生。gydF4y2Ba地中海Nat。gydF4y2Ba。gydF4y2Ba19gydF4y2Ba， 695-703(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  7. Chow, A.等。骨髓CD169gydF4y2Ba+gydF4y2Ba巨噬细胞促进造血干细胞和祖细胞在间充质干细胞生态位的保留。gydF4y2BaJ.实验医学gydF4y2Ba。gydF4y2Ba208gydF4y2Ba， 261-271(2011)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  8. 布伦斯等人。巨核细胞通过CXCL4分泌调节造血干细胞的静止。gydF4y2Ba地中海Nat。gydF4y2Ba。gydF4y2Ba20.gydF4y2Ba， 1315-1320(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  9. 山崎等人。非髓鞘化雪旺氏细胞维持造血干细胞在骨髓生态位的冬眠。gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba147gydF4y2Ba， 1146-1158(2011)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  10. 库松贝，a . P.， Ramasamy, S. K. & Adams, R. H.骨中特定血管亚型的血管生成和成骨耦合。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba507gydF4y2Ba， 323-328(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  11. 周博欧，岳瑞，Murphy, m.m.， Peyer, J. G. & Morrison, S. J.瘦素受体表达间充质间质细胞是成人骨髓形成骨的主要来源。gydF4y2Ba细胞干细胞gydF4y2Ba15gydF4y2Ba， 154-168(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  12. 沟口，T.等。在骨髓发育过程中，Osterix标志着原始和最终间质祖细胞的明显波动。gydF4y2BaDev细胞。gydF4y2Ba29gydF4y2Ba， 340-349(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  13. Butler, A, Hoffman, P, Smibert, P, Papalexi, E. & Satija, R.整合不同条件、技术和物种的单细胞转录组数据。gydF4y2BaNat。gydF4y2Ba。gydF4y2Ba36gydF4y2Ba， 411-420(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  14. 骨中血管和血管壁龛的结构和功能。gydF4y2Ba干细胞gydF4y2Ba。gydF4y2Ba2017gydF4y2Ba， 5046953(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  15. 徐，C.等。干细胞因子是由骨髓中动脉内皮细胞选择性分泌的。gydF4y2BaNat。CommungydF4y2Ba。gydF4y2Ba9gydF4y2Ba， 2449(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  16. 胡珀，a.t.等人。造血系统的植入和重建依赖于vegfr2介导的窦内皮细胞的再生。gydF4y2Ba细胞干细胞gydF4y2Ba4gydF4y2Ba， 263-274(2009)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  17. nombella - arrieta, C.等人。骨髓微环境中造血干和祖细胞定位及缺氧状态的定量成像。gydF4y2Ba细胞生物学gydF4y2Ba。gydF4y2Ba15gydF4y2Ba， 533-543(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  18. 克兰，g.m.，杰弗瑞，E. &莫里森，s.j.成人造血干细胞生态位。gydF4y2BaNat. Rev. Immunol。gydF4y2Ba17gydF4y2Ba， 573-590(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  19. Ghazanfari, R.， Li, H.， Zacharaki, D.， Lim, H. C. & Scheding, S.人类非造血CD271gydF4y2BaposgydF4y2Ba/ CD140agydF4y2Ba低/否定gydF4y2Ba骨髓基质细胞在连续移植中符合严格的干细胞标准。gydF4y2Ba干细胞开发gydF4y2Ba。gydF4y2Ba25gydF4y2Ba， 1652-1658(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  20. 米特罗里斯等人。分泌蛋白Del-1调节造血干细胞生态位中的骨髓生成。gydF4y2Baj .中国。投资gydF4y2Ba。gydF4y2Ba127gydF4y2Ba， 3624-3639(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  21. 杨，G.等。肥厚软骨细胞的成骨命运。gydF4y2Ba细胞ResgydF4y2Ba。gydF4y2Ba24gydF4y2Ba， 1266-1269(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  22. 温克勒，i.g.等。血管生态位e -选择素调节造血干细胞休眠、自我更新和化疗抗性。gydF4y2Ba地中海Nat。gydF4y2Ba。gydF4y2Ba18gydF4y2Ba， 1651-1657(2012)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  23. Cordeiro Gomes, A.等人。造血干细胞生态位产生谱系指示信号以控制多能祖细胞分化。gydF4y2Ba免疫力gydF4y2Ba45gydF4y2Ba， 1219-1231(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  24. Mrózek, E.， Anderson, P. & Caligiuri, m.a.白细胞介素-15在人类CD56发展中的作用gydF4y2Ba+gydF4y2Ba来自CD34的自然杀伤细胞gydF4y2Ba+gydF4y2Ba造血祖细胞。gydF4y2Ba血gydF4y2Ba87gydF4y2Ba， 2632-2640(1996)。gydF4y2Ba

    PubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  25. 高德曼，d.c.等。BMP4调节造血干细胞生态位。gydF4y2Ba血gydF4y2Ba114gydF4y2Ba， 4393-4401(2009)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  26. Shi, C.等。骨髓间充质干细胞和祖细胞诱导单核细胞迁移响应循环toll样受体配体。gydF4y2Ba免疫力gydF4y2Ba34gydF4y2Ba， 590-601(2011)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  27. Nemeth, M. J, Topol, L.， Anderson, S. M.， Yang, Y. & Bodine, D. M. Wnt5a在造血干细胞中抑制典型Wnt信号并促进再生。gydF4y2Ba国家科学院学报美国gydF4y2Ba104gydF4y2Ba， 15436-15441(2007)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  28. 史密斯，G. D.， Gunnell, D. & Holly, J.癌症和胰岛素样生长因子- i。gydF4y2BaBMJgydF4y2Ba321gydF4y2Ba， 847-848(2000)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  29. 于文伟等。骨髓中独特的间充质-实质细胞配对控制着B细胞分化。gydF4y2Ba干细胞报告gydF4y2Ba7gydF4y2Ba， 220-235(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  30. Mauch, P.等人。造血干细胞室:放疗和化疗的急性和晚期效应。gydF4y2BaInt。j . Radiat。肿瘤防治杂志。医学杂志。理论物理gydF4y2Ba。gydF4y2Ba31gydF4y2Ba， 1319-1339(1995)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  31. Hérault, A.等。骨髓祖细胞簇形成驱动紧急和白血病骨髓生成。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba544gydF4y2Ba， 53-58(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  32. 周，B. O.等。骨髓脂肪细胞通过分泌SCF促进干细胞再生和造血。gydF4y2Ba细胞生物学gydF4y2Ba。gydF4y2Ba19gydF4y2Ba， 891-903(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  33. 5-氟尿嘧啶挽救造血干细胞的研究。gydF4y2BaJ.实验医学gydF4y2Ba。gydF4y2Ba159gydF4y2Ba， 679-690(1984)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  34. 克里纳基斯等人。Notch通路在髓系白血病中的一种新的肿瘤抑制功能。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba473gydF4y2Ba， 230-233(2011)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  35. 宋，R.等。淋巴细胞壁龛中的Mind bomb 1对于T细胞和边缘区B细胞的发育至关重要。gydF4y2BaJ.实验医学gydF4y2Ba。gydF4y2Ba205gydF4y2Ba， 2525-2536(2008)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  36. Poulos, m.g.等。内皮细胞Jagged-1是体内平衡和再生造血所必需的。gydF4y2Ba细胞的报道gydF4y2Ba4gydF4y2Ba， 1022-1034(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  37. 科赫等人。Delta-like 4是胸腺T细胞谱系转移过程中Notch1的必要的非冗余配体。gydF4y2BaJ.实验医学gydF4y2Ba。gydF4y2Ba205gydF4y2Ba， 2515-2523(2008)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  38. Schmitt, t.m.， Ciofani, M, Petrie, h.t. & Zúñiga-Pflücker, j.c. T细胞规范和分化的维持需要经常性的Notch受体-配体相互作用。gydF4y2BaJ.实验医学gydF4y2Ba。gydF4y2Ba200gydF4y2Ba， 469-479(2004)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  39. Lehar, S. M.， Dooley, J.， Farr, A. G. & Bevan, M. J. Notch配体Delta1和Jagged1向t细胞前体传递不同的信号。gydF4y2Ba血gydF4y2Ba105gydF4y2Ba， 1440-1447(2005)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  40. 奥尔森，A.等。单细胞混合谱系状态分析导致二元细胞命运选择。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba537gydF4y2Ba， 698-702(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  41. 保罗，F.等。髓系祖细胞的转录异质性和谱系承诺。gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba163gydF4y2Ba， 1663-1677(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  42. 普罗克，C. J.等。阐明了一个髓样祖细胞层次结构的表型、功能和分子地形。gydF4y2Ba细胞干细胞gydF4y2Ba1gydF4y2Ba， 428-442(2007)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  43. Ng, S. Y.， Yoshida, T.， Zhang, J. & Georgopoulos, K.全基因组谱系特异性转录网络强调造血干细胞中ikaros依赖的淋巴样启动。gydF4y2Ba免疫力gydF4y2Ba30.gydF4y2Ba， 493-507(2009)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  44. Acar, M.等。骨髓深部显像显示非分裂干细胞主要分布在鼻窦周围。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba526gydF4y2Ba， 126-130(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  45. 彼得拉斯，E. M.等人。功能独特的谱系偏倚多能祖细胞亚群控制正常和再生条件下的血液生产。gydF4y2Ba细胞干细胞gydF4y2Ba17gydF4y2Ba， 35-46(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  46. Giladi, A.等人。造血祖细胞的单细胞特征及其在稳态和紊乱造血中的运动轨迹。gydF4y2Ba细胞生物学gydF4y2Ba。gydF4y2Ba20.gydF4y2Ba， 836-846(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  47. 雅各布森，S. E. W. & Nerlov, C.先进单细胞技术时代的造血。gydF4y2Ba细胞生物学gydF4y2Ba。gydF4y2Ba21gydF4y2Ba， 2-8(2019)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  48. 帕萨罗，D.等人。CXCR4是T细胞急性淋巴母细胞白血病中白血病启动细胞活性所必需的。gydF4y2Ba癌症细胞gydF4y2Ba27gydF4y2Ba， 769-779(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  49. 皮特，洛杉矶等。产生cxcl12的血管内皮龛控制急性T细胞白血病的维持。gydF4y2Ba癌症细胞gydF4y2Ba27gydF4y2Ba， 755-768(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  50. 阿尔瓦，J. A.等。ve - cadherin - cre -重组酶转基因小鼠:用于谱系分析和内皮细胞基因缺失的工具。gydF4y2BaDev。直流发电机gydF4y2Ba。gydF4y2Ba235gydF4y2Ba， 759-767(2006)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  51. DeFalco, J.等。病毒辅助的神经输入映射到下丘脑的进食中心。gydF4y2Ba科学gydF4y2Ba291gydF4y2Ba， 2608-2613(2001)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  52. Kim, J. E. Nakashima, K. & de Crombrugghe, B.在成骨细胞和成牙细胞中表达配体诱导的Cre重组酶的转基因小鼠:一种检测出生后骨骼和牙齿生理和疾病的新工具。gydF4y2Ba点。j .病理学研究gydF4y2Ba。gydF4y2Ba165gydF4y2Ba， 1875-1882(2004)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  53. Madisen, L.等人。一个强大的和高通量的Cre报告和表征系统的整个小鼠大脑。gydF4y2BaNat。>gydF4y2Ba。gydF4y2Ba13gydF4y2Ba， 133-140(2010)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  54. Economides, A. N.等。条件反转为条件等位基因的生成提供了一种通用的方法。gydF4y2Ba国家科学院学报美国gydF4y2Ba110gydF4y2Ba， e3179-e3188(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  55. Hozumi, K.等。Delta-like 1是产生边缘区B细胞所必需的，而不是T细胞gydF4y2Ba在活的有机体内gydF4y2Ba。gydF4y2BaNat。ImmunolgydF4y2Ba。gydF4y2Ba5gydF4y2Ba， 638-644(2004)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  56. 李，E. C.等。高效的gydF4y2Ba大肠杆菌gydF4y2Ba该系统适用于BAC DNA的重组基因靶向和亚克隆。gydF4y2Ba基因组学gydF4y2Ba73gydF4y2Ba， 56-65(2001)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  57. Reizis, B. & Leder, P.上游增强子对于未成熟T淋巴细胞中前T细胞受体α基因的表达是必要和充分的。gydF4y2BaJ.实验医学gydF4y2Ba。gydF4y2Ba194gydF4y2Ba， 979-990(2001)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  58. Dobin, A.等人。STAR:超快通用RNA-seq对准器。gydF4y2Ba生物信息学gydF4y2Ba29gydF4y2Ba， 15-21(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  59. Liao, Y.， Smyth, G. K. & Shi, W. featuremets:一种高效的通用程序，用于分配序列读取基因组特征。gydF4y2Ba生物信息学gydF4y2Ba30.gydF4y2Ba， 923-930(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  60. Love, m.i, Huber, W. & Anders, S.使用DESeq2对RNA-seq数据的折叠变化和离散度进行调节估计。gydF4y2Ba基因组医学杂志gydF4y2Ba。gydF4y2Ba15gydF4y2Ba， 550(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  61. 郑国祥等。大规模并行数字单细胞转录谱分析。gydF4y2BaNat。CommungydF4y2Ba。gydF4y2Ba8gydF4y2Ba， 14049(2017)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  62. 马科斯科，e.z.等。使用纳米升液滴对单个细胞进行高度平行的全基因组表达分析。gydF4y2Ba细胞gydF4y2Ba161gydF4y2Ba， 1202-1214(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  63. Mayer, C.等人。皮层抑制中间神经元的发育多样化。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba555gydF4y2Ba， 457-462(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  64. 罗达，L. B.等。淋巴结基质细胞的单细胞RNA测序揭示了生态位相关的异质性。gydF4y2Ba免疫力gydF4y2Ba48gydF4y2Ba, 1014 - 1028。e6(2018)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  65. 菲纳克，G.等人。MAST:一种灵活的统计框架，用于评估单细胞RNA测序数据中的转录变化和表征异质性。gydF4y2Ba基因组医学杂志gydF4y2Ba。gydF4y2Ba16gydF4y2Ba， 278(2015)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  66. 泰鲁什，我，等人。通过单细胞RNA-seq分析转移性黑色素瘤的多细胞生态系统。gydF4y2Ba科学gydF4y2Ba352gydF4y2Ba， 189-196(2016)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba广告gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  67. 特拉普内尔，C.等。通过单细胞的伪时间排序揭示了细胞命运决策的动力学和调控因子。gydF4y2BaNat。gydF4y2Ba。gydF4y2Ba32gydF4y2Ba， 381-386(2014)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  68. 于刚，王丽光，韩艳，何庆云。clusterProfiler:一个R包，用于比较基因集群中的生物学主题。gydF4y2Ba组学gydF4y2Ba16gydF4y2Ba， 284-287(2012)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba中科院gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  69. 陈，e.y .等。enrichment:交互式协作HTML5基因列表丰富分析工具。gydF4y2BaBMC生物信息学gydF4y2Ba14gydF4y2Ba， 128(2013)。gydF4y2Ba

    文章gydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

下载参考gydF4y2Ba

确认gydF4y2Ba

我们感谢NYULMC高性能计算、流式细胞仪、基因组技术中心、组织病理学核心和显微镜实验室。这项研究得到了美国国立卫生研究院(RO1CA202025, RO1CA202027 (I. Aifantis)， DK056638, HL069438, DK116312, DK112976到P.S.F.)，白血病和淋巴瘤协会(I. Aifantis和A.N.T)，亚历克斯柠檬水站儿童癌症基金会(I. Aifantis和A.N.T)， ERC高级拨款:欧洲研究委员会(AdG 339409, AngioBone) (R.H.A.)，美国癌症协会(RSG-15-189-01-RMC到A.T.)和St. Baldrick基金会(581357到A.T.)的支持。I. Aifantis感谢已故的H. von Boehmer的支持。gydF4y2Ba

审核人信息gydF4y2Ba

自然gydF4y2Ba感谢Andreas Trumpp和其他匿名审稿人对这项工作的同行评审所做的贡献。gydF4y2Ba

作者信息gydF4y2Ba

作者指出gydF4y2Ba

  1. 这些作者贡献相同:Anastasia N. Tikhonova, Igor DolgalevgydF4y2Ba

作者及隶属关系gydF4y2Ba

  1. 纽约大学医学院病理科，美国纽约gydF4y2Ba

    Anastasia N. Tikhonova, Igor Dolgalev, Hai Hu, Edlira Hoxha, Matthew Witkowski, Maria Guillamot, Catherine Diefenbach, Adriana Heguy, Aristotelis Tsirigos和Iannis AifantisgydF4y2Ba

  2. 劳拉和艾萨克·珀尔马特癌症中心，纽约大学医学院，纽约，美国gydF4y2Ba

    Anastasia N. Tikhonova, Igor Dolgalev, Hai Hu, Edlira Hoxha, Matthew Witkowski, Maria Guillamot, Catherine Diefenbach, Adriana Heguy, Aristotelis Tsirigos和Iannis AifantisgydF4y2Ba

  3. 应用生物信息学实验室，纽约大学医学院，纽约，纽约，美国gydF4y2Ba

    Igor Dolgalev & Aristotelis TsirigosgydF4y2Ba

  4. 马克斯普朗克分子生物医学研究所，组织形态发生系，Münster大学医学院，Münster，德国gydF4y2Ba

    Kishor K. Sivaraj和ralph H. AdamsgydF4y2Ba

  5. 美国纽约哥伦比亚大学内科和外科医生学院生理与细胞生物物理系gydF4y2Ba

    Álvaro Cuesta-Domínguez & Stavroula KoustenigydF4y2Ba

  6. Ruth L.和David S. Gottesman干细胞和再生医学研究所，阿尔伯特爱因斯坦医学院，纽约，纽约，美国gydF4y2Ba

    Sandra Pinho & Paul S. FrenettegydF4y2Ba

  7. 爱因斯坦医学院病理科，美国纽约州纽约gydF4y2Ba

    伊尔赛亚·艾哈迈茨亚诺娃和大卫·r·福斯曼gydF4y2Ba

  8. Regeneron遗传学中心，塔利敦，纽约，美国gydF4y2Ba

    高杰和阿里斯·EconomidesgydF4y2Ba

  9. 发现与创新中心，哈肯萨克大学医学中心，美国新泽西州纳特利gydF4y2Ba

    迈克尔·c·古特金和杰森·m·巴特勒gydF4y2Ba

  10. 基因组技术中心，纽约大学医学院先进研究技术部，纽约，纽约，美国gydF4y2Ba

    张雨桐，Christian Marier和Adriana HeguygydF4y2Ba

  11. 纽约大学医学院人口健康系生物统计部，纽约，纽约，美国gydF4y2Ba

    钟华gydF4y2Ba

  12. 纽约基因组中心，纽约，纽约，美国gydF4y2Ba

    拉胡尔SatijagydF4y2Ba

作者gydF4y2Ba
  1. Anastasia N. TikhonovagydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  2. Igor DolgalevgydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  3. 海胡gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  4. Kishor K. SivarajgydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  5. Edlira等问题gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  6. Alvaro Cuesta-DominguezgydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  7. 桑德拉PinhogydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  8. Ilseyar AkhmetzyanovagydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  9. 杰高gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  10. 马修WitkowskigydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  11. 玛丽亚GuillamotgydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  12. 迈克尔·c·古特金gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  13. 宇通张gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  14. 基督教的玛丽gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  15. 凯瑟琳DiefenbachgydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  16. Stavroula KoustenigydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  17. 阿德里亚娜HeguygydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  18. 钟华gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  19. 大卫·r·福克斯曼gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  20. 杰森·m·巴特勒gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  21. 阿里斯EconomidesgydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  22. 保罗·s·弗雷内特gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  23. 拉尔夫·h·亚当斯gydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  24. 拉胡尔SatijagydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  25. Aristotelis TsirigosgydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

  26. Iannis AifantisgydF4y2Ba
    查看作者出版物gydF4y2Ba

    您也可以在gydF4y2BaPubMedgydF4y2Ba谷歌学者gydF4y2Ba

贡献gydF4y2Ba

A.N.T, I.D.和i。Aifantis设计了这项研究并准备了手稿。大部分实验都是由A.N.T.完成的。在R.S.和a.t.j.g.生成的小鼠品系的指导下，I.D.完成了所有的计算分析。H.H.和E.H.提供了小鼠模型的技术援助。M.W.和S.P.在P.S.F.的指导下进行了鉴别分析。所有显微镜检查均由k.k.s.、A.C.-D进行并解释。， M.C.G, A.N.T.和i.a Akhmetzyanova，在r.h.a.， d.r.f.， J.M.B.和s.k.y.z, C.M.和A.H.的指导下，生成了scRNA-seq数据。M.G.和C.D.协助移植化验。A.E.和R.H.A.提供小鼠品系并协助数据分析。H.Z.协助统计分析。gydF4y2Ba

相应的作者gydF4y2Ba

对应到gydF4y2BaAnastasia N. TikhonovagydF4y2Ba，gydF4y2BaAristotelis TsirigosgydF4y2Ba或gydF4y2BaIannis AifantisgydF4y2Ba。gydF4y2Ba

道德声明gydF4y2Ba

相互竞争的利益gydF4y2Ba

作者声明没有利益竞争。gydF4y2Ba

额外的信息gydF4y2Ba

出版商的注意:gydF4y2Ba施普林格自然对出版的地图和机构从属关系中的管辖权主张保持中立。gydF4y2Ba

扩展的数据图形和表格gydF4y2Ba

图1骨髓微环境种群的RNA-seq分析。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba， tdTomato代表性双光子成像gydF4y2Ba+gydF4y2Ba血管细胞(VE-Cad—tdTomato)gydF4y2Ba+gydF4y2Ba)，血管周围细胞(LEPR—tdTomatogydF4y2Ba+gydF4y2Ba)和成骨细胞(COL2.3—tdTomatogydF4y2Ba+gydF4y2Ba）.gydF4y2BabgydF4y2BaVE-Cad-tdTomato的代表性流式细胞仪gydF4y2Ba+gydF4y2Ba, LEPR-tdTomatogydF4y2Ba+gydF4y2Ba和COL2.3-tdTomatogydF4y2Ba+gydF4y2Ba人群。gydF4y2BacgydF4y2Ba，血管主成分分析(VE-Cad-tdTomatogydF4y2Ba+gydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 4)(红色)，血管周围LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba(LEPR-tdTomatogydF4y2Ba+gydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 4)(紫色)和成骨细胞(COL2.3-tdTomato)gydF4y2Ba+gydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 4)(蓝色)种群，基于散装RNA-seq中1000个最易变基因的表达。gydF4y2BadgydF4y2Ba， COL2.3的相对表达量gydF4y2Ba+gydF4y2Ba, LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba和VE-CadgydF4y2Ba+gydF4y2Ba在bulk RNA-seq中，骨髓生态位的三个亚群中的特征基因。采用DESeq2 R包进行归一化和统计分析。gydF4y2BaegydF4y2Ba，人群特异性标记物VE-Cad归一化表达水平(gydF4y2BaCdh5gydF4y2Ba)、麻风病(gydF4y2BaLeprgydF4y2Ba)和COL2.3 (gydF4y2BaCol1a1gydF4y2Ba)用于所有scRNA-seq集群。gydF4y2BangydF4y2Ba= 9,622个细胞。数据为均数±s.e.m。实验在10 (gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba，gydF4y2BabgydF4y2Ba)生物样本，结果相似。gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

扩展数据图2 VE-Cad分析gydF4y2Ba+gydF4y2Ba, LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba和COL2.3gydF4y2Ba+gydF4y2Ba人群。gydF4y2Ba

一个gydF4y2BaVE-Cad独立综合分析工作流程示意图gydF4y2Ba+gydF4y2Ba, LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba和COL2.3gydF4y2Ba+gydF4y2BascRNA-seq数据。gydF4y2BabgydF4y2Ba，gydF4y2BatgydF4y2Ba- VE-Cad的sne表示gydF4y2Ba+gydF4y2Ba人口。簇C1对应于动脉簇V1 (gydF4y2BaLy6agydF4y2Ba高gydF4y2Ba）.簇C2对应于正弦簇V2 (gydF4y2BaStab2gydF4y2Ba高gydF4y2Ba）.集群C3是循环集群。gydF4y2BacgydF4y2Ba，动脉、正弦和循环标志物的归一化表达(gydF4y2BaLy6agydF4y2Ba，gydF4y2BaStab2gydF4y2Ba和gydF4y2BaMki67gydF4y2Ba，分别)(gydF4y2BangydF4y2Ba= 4,551个细胞)。gydF4y2BadgydF4y2Ba， VE-Cad基因签名gydF4y2Ba+gydF4y2Ba骨髓中的亚群体，基于每个聚类的10个最显著标记的相对表达水平。gydF4y2BaegydF4y2Ba，gydF4y2BatgydF4y2Ba-SNE代表LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba人口。簇C1对应于脂肪细胞引物的簇P1 (gydF4y2BaMgpgydF4y2Ba高gydF4y2Ba)，并包含集群P2。集群C2对应于P3 (gydF4y2BaWif1gydF4y2Ba高gydF4y2Ba)，以及C3至P4 (gydF4y2BaSpp1gydF4y2Ba高gydF4y2Ba）.gydF4y2BafgydF4y2Ba， P1、P3、P4标记的归一化表达(gydF4y2BaMgpgydF4y2Ba，gydF4y2BaWif1gydF4y2Ba和gydF4y2BaSpp1gydF4y2Ba分别)。gydF4y2BangydF4y2Ba= 3907个细胞。gydF4y2BaggydF4y2Ba， LEPR基因标记gydF4y2Ba+gydF4y2Ba骨髓中的亚群体，基于每个聚类的10个最显著标记的相对表达水平。gydF4y2BahgydF4y2Ba，gydF4y2BatgydF4y2Ba-SNE表示COL2.3gydF4y2Ba+gydF4y2Ba人口。簇C1对应簇O1 (gydF4y2BaCol16a1gydF4y2Ba高gydF4y2Ba)、集群C2至集群O2 (gydF4y2BaFbn1gydF4y2Ba高gydF4y2Ba)和C3至O3 (gydF4y2BaBglapgydF4y2Ba高gydF4y2Ba）.gydF4y2Ba我gydF4y2Ba， O1、O2、O3标记的归一化表达(gydF4y2BaCol16a1gydF4y2Ba，gydF4y2BaFbn1gydF4y2Ba和gydF4y2BaBglapgydF4y2Ba分别)。gydF4y2BangydF4y2Ba= 1114个单元格。gydF4y2BajgydF4y2Ba， COL2.3的基因特征gydF4y2Ba+gydF4y2Ba骨髓中的亚群体，基于每个聚类的10个最显著标记的相对表达水平。C4簇代表动脉血管细胞(gydF4y2BaCdh5gydF4y2Ba，gydF4y2BaKdrgydF4y2Ba和gydF4y2BaLy6egydF4y2Ba）;C5是胶质样细胞(gydF4y2BaFabp7gydF4y2Ba，gydF4y2Ba合成gydF4y2Ba和gydF4y2BaEndrbgydF4y2Ba）;C6为肌细胞样细胞(gydF4y2BaPgfgydF4y2Ba，gydF4y2BaPlngydF4y2Ba和gydF4y2BaActa2gydF4y2Ba）.数据显示在gydF4y2BacgydF4y2Ba，gydF4y2BafgydF4y2Ba，gydF4y2Ba我gydF4y2Ba为平均值±s.e.m. MAST, Bonferroni校正(gydF4y2BadgydF4y2Ba，gydF4y2BaggydF4y2Ba，gydF4y2BajgydF4y2Ba）.gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

扩展数据图3 VE-Cad的表征gydF4y2Ba+gydF4y2Ba亚种。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba，在VE-Cad内，之前描述的动脉和正弦基因信号在稳定状态下的相对平均scRNA-seq表达水平gydF4y2Ba+gydF4y2BaV1和V2的集群。gydF4y2BabgydF4y2Ba， scRNA-seq平均表达量(左)(gydF4y2BangydF4y2Ba= 4,669个细胞)和ca -1动脉表达的骨髓免疫荧光(右)(gydF4y2BaLy6agydF4y2Ba)， cd102 (gydF4y2BaIcam2gydF4y2Ba)及PODXL (gydF4y2BaPodxlgydF4y2Ba） (gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只小鼠);LAMA1染色(蓝色)标记所有骨血管;黄色箭头表示动脉血管。虚线标记骨髓(bm)、致密骨(cb)、生长板(gp)和干骺端(mp)骨区域。gydF4y2BacgydF4y2Ba，小动脉骨髓免疫荧光与SCA-1和PODXL共染色。gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只老鼠。gydF4y2BadgydF4y2Ba， scRNA-seq平均表达水平(左)和正弦VEGFR3的骨髓免疫荧光(右)(gydF4y2BaFlt4gydF4y2Ba)(红色)及CD54 (gydF4y2BaIcam1gydF4y2Ba)(绿色)记号笔。gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只老鼠。LAMA1染色(蓝色)标记所有骨血管。gydF4y2BaegydF4y2Ba，使用SCA-1和scRNA-seq鉴定的LY6C进行动脉亚群(V1)的平均scRNA-seq表达水平和代表性流式细胞术分析(gydF4y2BaLy6c1gydF4y2Ba)及CD34 (gydF4y2BaCd34gydF4y2Ba)来自VE-Cad-tdTomato骨髓(gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只老鼠)。细胞预先在DAPI上进行门控gydF4y2Ba−gydF4y2BatdTomatogydF4y2Ba高gydF4y2Ba细胞。数据gydF4y2BabgydF4y2Ba，gydF4y2BadgydF4y2Ba，gydF4y2BaegydF4y2Bamean±S.E.M.gydF4y2Ba

图4血管周围LEPR的特征gydF4y2Ba+gydF4y2Ba亚种。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba，脂肪细胞的相对平均scRNA-seq表达水平gydF4y2Ba惠普gydF4y2Ba，gydF4y2BaLplgydF4y2Ba，gydF4y2BaAdipoqgydF4y2Ba，gydF4y2BaSlc1a5gydF4y2Ba，gydF4y2BaCd302gydF4y2Ba，gydF4y2BaGas6gydF4y2Ba和gydF4y2BaApoegydF4y2Ba)及与骨有关的(gydF4y2BaIbspgydF4y2Ba，gydF4y2BaSpp1gydF4y2Ba，gydF4y2BaAlplgydF4y2Ba，gydF4y2BaWif1gydF4y2Ba，gydF4y2BaBglapgydF4y2Ba，gydF4y2BaSp7gydF4y2Ba和gydF4y2BaRunx2gydF4y2Ba)基因，以及用来表征LEPR的标记gydF4y2Ba+gydF4y2Ba细胞(gydF4y2BaEsm1gydF4y2Ba，gydF4y2BaVcam1gydF4y2Ba，gydF4y2BaCd200gydF4y2Ba和gydF4y2BaCd63gydF4y2Ba）.gydF4y2BabgydF4y2Ba， LEPR-tdTomato股骨ESM1(绿色)骨髓免疫荧光。LAMA1染色(蓝色)标记所有骨血管。黄色箭头表示LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2BaESM1gydF4y2Ba+gydF4y2Ba细胞;白色箭头表示LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2BaESM1gydF4y2Ba−gydF4y2Ba细胞。gydF4y2BacgydF4y2BaLEPR-tdTomato股骨的CD200(绿色)和CD63(红色)骨髓免疫荧光。原子核，DAPI(蓝色)。黄色箭头，LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2BaCD200gydF4y2Ba+gydF4y2BaCD63gydF4y2Ba+gydF4y2Ba细胞;白色箭头，LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2BaCD200gydF4y2Ba−gydF4y2BaCD63gydF4y2Ba−gydF4y2Ba细胞。gydF4y2BadgydF4y2Ba，人间充质干细胞(hMSC)基因特征模块评分，覆盖于gydF4y2BatgydF4y2Ba新力表示。gydF4y2BangydF4y2Ba= 9,622个细胞。gydF4y2BaegydF4y2Ba， VCAM1的流式细胞术表达gydF4y2Ba高gydF4y2BaCD63gydF4y2Ba低gydF4y2Ba和VCAM1gydF4y2Ba低gydF4y2BaCD63gydF4y2Ba高gydF4y2BatdTomato细胞gydF4y2Ba+gydF4y2Ba在LEPR-tdTomato骨髓中。细胞预先在DAPI上进行门控gydF4y2Ba−gydF4y2BatdTomatogydF4y2Ba高gydF4y2Ba细胞。gydF4y2BafgydF4y2Ba，分类总LEPR成纤维细胞集落形成单元活性gydF4y2Ba+gydF4y2Ba(紫色),LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2BaVCAM1gydF4y2Ba低gydF4y2BaCD63gydF4y2Ba高gydF4y2Ba(栗色)和LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2BaVCAM1gydF4y2Ba高gydF4y2BaCD63gydF4y2Ba低gydF4y2Ba(黄色)LEPR-tdTomato小鼠骨髓细胞(gydF4y2BangydF4y2Ba= 8)，数据为均数±标准差(gydF4y2BafgydF4y2Ba）.n.s.，不显著，*gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.05，**gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.01。学生的gydF4y2BatgydF4y2Ba-test，双尾(gydF4y2BafgydF4y2Ba）.数据代表两个(gydF4y2BabgydF4y2Ba，gydF4y2BacgydF4y2Ba)或三个(gydF4y2BaegydF4y2Ba，gydF4y2BafgydF4y2Ba)独立实验。gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

扩展数据图5 COL2.3的表征gydF4y2Ba+gydF4y2Ba亚群和循环细胞。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba， O1-的相对平均scRNA-seq表达量(gydF4y2BaEdil3gydF4y2Ba，gydF4y2BaMmp14gydF4y2Ba，gydF4y2BaOstngydF4y2Ba，gydF4y2BaCol12a1gydF4y2Ba，gydF4y2BaAngptl2gydF4y2Ba和gydF4y2BaCol16a1gydF4y2Ba)， o2 - (gydF4y2BaSox9gydF4y2Ba，gydF4y2Ba电脑及相关知识gydF4y2Ba，gydF4y2Ba乍得gydF4y2Ba和gydF4y2BaCol10a1gydF4y2Ba)和O3- (gydF4y2BaCol11a2gydF4y2Ba，gydF4y2BaCol1a2gydF4y2Ba，gydF4y2BaSparcgydF4y2Ba，gydF4y2BaBglap2gydF4y2Ba和gydF4y2BaBglap3gydF4y2Ba)相关基因。gydF4y2BabgydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BadgydF4y2Ba， scRNA-seq平均表达量(gydF4y2BangydF4y2Ba= 9,622个细胞)和MMP14的骨髓免疫荧光(绿色)(gydF4y2BabgydF4y2Ba） (gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只小鼠)，CD9(绿色)(gydF4y2BacgydF4y2Ba） (gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只老鼠)和CAR3(绿色)(gydF4y2BadgydF4y2Ba） (gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只小鼠)的COL2.3-tdTomato股骨染色，箭头表示与tdTomato共染色(红色)。原子核，DAPI(蓝色)。箭头,COL2.3gydF4y2Ba+gydF4y2BaMMP14gydF4y2Ba+gydF4y2Ba（gydF4y2BabgydF4y2Ba), COL2.3gydF4y2Ba+gydF4y2BaCD9gydF4y2Ba+gydF4y2Ba（gydF4y2BacgydF4y2Ba)和COL2.3gydF4y2Ba+gydF4y2BaCAR3gydF4y2Ba+gydF4y2Ba（gydF4y2BadgydF4y2Ba）.gydF4y2BaegydF4y2Ba，表达水平gydF4y2BaMki67gydF4y2Ba在所有已确定的亚种群中。gydF4y2BangydF4y2Ba= 9,622个细胞。gydF4y2BafgydF4y2Ba富集基因本体(enrichment Gene Ontology)与循环簇(C)关联最紧密的生物过程术语，以重叠基因的比例为基础，根据富集和大小的显著性进行颜色编码。gydF4y2BangydF4y2Ba= 9,622个细胞。gydF4y2BaggydF4y2BaVE-Cad-tdTomato的贡献gydF4y2Ba+gydF4y2Ba, LEPR-tdTomatogydF4y2Ba+gydF4y2Ba和COL2.3-tdTomatogydF4y2Ba+gydF4y2Ba以稳定状态(gydF4y2BangydF4y2Ba= 70个细胞)。数据gydF4y2BabgydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BaegydF4y2Bamean±S.E.M.gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

图6 5-FU治疗对骨髓生态位亚群的影响。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba，对照组(PBS)或5-FU治疗后第5天骨髓苏木素和伊红染色切片(gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只老鼠)。gydF4y2BabgydF4y2Ba、对照组(CNTRL)治疗后第5天骨髓LSK细胞的频率和数量(gydF4y2BangydF4y2Ba= 4)或5-FU (gydF4y2BangydF4y2Ba= 5)。gydF4y2BacgydF4y2Ba，骨髓生态位细胞绝对数量，血管VE-CadgydF4y2Ba+gydF4y2Ba(控制,gydF4y2BangydF4y2Ba= 4;研究者用,gydF4y2BangydF4y2Ba= 10)，血管周围LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba(控制,gydF4y2BangydF4y2Ba= 2;研究者用,gydF4y2BangydF4y2Ba= 5)和COL2.3gydF4y2Ba+gydF4y2Ba成骨细胞(控制,gydF4y2BangydF4y2Ba= 4;研究者用,gydF4y2BangydF4y2Ba= 5)来自PBS或5- fu处理的小鼠。gydF4y2BadgydF4y2Ba， LEPR基因标记gydF4y2Ba+gydF4y2Ba亚群体(包括聚类P5)，基于每个聚类的10个最显著标记的平均相对表达水平，仅在LEPR内gydF4y2Ba+gydF4y2Ba子集。带有Bonferroni校正的MAST。gydF4y2BaegydF4y2Ba、LEPR中脂肪生成相关基因上调和成骨相关基因下调的相对表达量gydF4y2Ba+gydF4y2Ba亚群对5-FU治疗的反应。gydF4y2BafgydF4y2Ba在LEPR中富集的通路gydF4y2Ba+gydF4y2Ba细胞对5-FU处理的反应(gydF4y2BangydF4y2Ba= 17,374个细胞)。费雪精确检验法。gydF4y2BaggydF4y2BaVE-Cad-tdTomato的贡献gydF4y2Ba+gydF4y2Ba, LEPR-tdTomatogydF4y2Ba+gydF4y2Ba和COL2.3-tdTomatogydF4y2Ba+gydF4y2Ba细胞经5-FU处理后变为循环簇(gydF4y2BangydF4y2Ba= 418个细胞)。gydF4y2BahgydF4y2Ba，表达水平gydF4y2BaMki67gydF4y2Ba在所有确定的亚人群中，5-FU治疗后(gydF4y2BangydF4y2Ba= 17,374个细胞)。数据为均数±标准差，无显著性，**gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.01，***gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.001，****gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.0001。学生的gydF4y2BatgydF4y2Ba-test，双尾(gydF4y2BabgydF4y2Ba，gydF4y2BacgydF4y2Ba）.数据gydF4y2BahgydF4y2Bamean±S.E.M.gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

扩展数据图7 scRNA-seq在VE-Cad中的验证gydF4y2Ba+gydF4y2Ba和LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba治疗后的细胞。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba，gydF4y2BabgydF4y2BaVE-Cad平均归一化表达式值的热图和层次聚类gydF4y2Ba+gydF4y2Ba（gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba)和LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba（gydF4y2BabgydF4y2Ba)在两个独立的scRNA-seq实验中对5- fu调控基因(前50位差异表达)进行对照处理和5- fu处理。gydF4y2BacgydF4y2Ba，gydF4y2BadgydF4y2Ba，差异表达基因的对数转换折叠变化(上调和下调> 1.2×，调整gydF4y2BaPgydF4y2Ba值< 0.001)gydF4y2Ba+gydF4y2Ba（gydF4y2BangydF4y2Ba= 697基因)细胞(gydF4y2BacgydF4y2Ba)和LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba（gydF4y2BangydF4y2Ba= 829基因)细胞(gydF4y2BadgydF4y2Ba)，进行两个独立的实验。使用线性模型计算趋势线(虚线)和置信区间(灰色阴影)。带有Bonferroni校正的MAST。VE-CadgydF4y2Ba+gydF4y2Bacontrol-treated,gydF4y2BangydF4y2Ba= 5,796个细胞;VE-CadgydF4y2Ba+gydF4y2Ba5-FU-treated,gydF4y2BangydF4y2Ba= 1481个cell;LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Bacontrol-treated,gydF4y2BangydF4y2Ba= 6,128个单元格;LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba5-FU-treated,gydF4y2BangydF4y2Ba= 4,867个细胞。gydF4y2Ba

扩展数据图8分析gydF4y2BaDll4-mCherrygydF4y2Ba，gydF4y2BaDll1-mCherrygydF4y2Ba和gydF4y2BaJag1-mCherrygydF4y2Ba记者老鼠。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba，的逆转录PCRgydF4y2BaDll4gydF4y2Ba，gydF4y2BaDll1gydF4y2Ba和gydF4y2BaJag1gydF4y2Ba在血管细胞(红色)，血管周围LEPRgydF4y2Ba+gydF4y2Ba细胞(紫色)和成骨细胞(蓝色)归一化为gydF4y2BaGapdhgydF4y2Ba（gydF4y2BangydF4y2Ba= 4只老鼠)。gydF4y2BabgydF4y2Ba，胸腺切片低倍率免疫荧光图像gydF4y2BaDll4-mCherrygydF4y2Ba，gydF4y2BaDll1-mCherrygydF4y2Ba和gydF4y2BaJag1-mCherrygydF4y2Ba老鼠。gydF4y2BacgydF4y2Ba代表性流式细胞术，测定骨髓mCherry荧光gydF4y2BaDll4gydF4y2Ba-gydF4y2BamCherrygydF4y2Ba，gydF4y2BaDll1gydF4y2Ba-gydF4y2BamCherrygydF4y2Ba和gydF4y2BaJAG1gydF4y2Ba-gydF4y2BamCherrygydF4y2Ba老鼠。指定的值表示完整CD144的百分比gydF4y2Ba+gydF4y2Ba和mCherrygydF4y2Ba+gydF4y2BaCD144gydF4y2Ba−gydF4y2Ba人群。细胞预先在DAPI上进行门控gydF4y2Ba−gydF4y2Ba细胞。gydF4y2BadgydF4y2Ba，代表mCherry水平在DAPIgydF4y2Ba−gydF4y2BaCD45gydF4y2Ba低gydF4y2BaTER119gydF4y2Ba低gydF4y2BaCD144gydF4y2Ba+gydF4y2Ba骨髓内皮细胞gydF4y2BaDll4-mCherrygydF4y2Ba(红色)(gydF4y2BangydF4y2Ba= 4),gydF4y2BaDll1-mCherrygydF4y2Ba(蓝色)(gydF4y2BangydF4y2Ba= 3),gydF4y2BaJag1-mCherrygydF4y2Ba(黑色)(gydF4y2BangydF4y2Ba= 4)和control(灰色)(gydF4y2BangydF4y2Ba= 5)老鼠。gydF4y2BaegydF4y2Ba，gydF4y2BafgydF4y2Ba，具有代表性的免疫荧光干骺端和骨干gydF4y2BaDll4-mCherrygydF4y2Ba（gydF4y2BaegydF4y2Ba),gydF4y2BaDll1-mCherrygydF4y2Ba（gydF4y2BafgydF4y2Ba)骨髓(gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只老鼠)。mCherry(红色)和LAMA1(蓝色)。gydF4y2BaggydF4y2Ba，gydF4y2BahgydF4y2Ba，左图为完整骨髓的代表性双光子图像，右图为右聚糖注射骨髓的代表性双光子图像gydF4y2BaDll4gydF4y2Ba-gydF4y2BamCherrygydF4y2Ba（gydF4y2BaggydF4y2Ba),gydF4y2BaDll1gydF4y2Ba-gydF4y2BamCherrygydF4y2Ba（gydF4y2BahgydF4y2Ba)老鼠(gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只老鼠)。gydF4y2Ba我gydF4y2Ba，对CD144进行了体RNA-seq中关键差异表达基因的归一化计数gydF4y2Ba−gydF4y2BaDLL1gydF4y2Ba+gydF4y2Ba细胞(紫色)(从gydF4y2BangydF4y2Ba= 2只小鼠)和CD144gydF4y2Ba+gydF4y2BaDLL1gydF4y2Ba+gydF4y2Ba细胞(黑色)(来自gydF4y2BangydF4y2Ba= 2只老鼠)。gydF4y2BajgydF4y2Ba， NK1.1中mCherry荧光检测的代表性流式细胞仪直方图gydF4y2Ba+gydF4y2Ba人口从gydF4y2BaDll1-mCherrygydF4y2Ba(粉红色)和对照(黑色)老鼠(gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只老鼠)。数据为均数±标准差，无显著性，*gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.05，**gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.01，***gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.001，学生gydF4y2BatgydF4y2Ba以及,双尾。数据代表两个(gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba，gydF4y2BaegydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BahgydF4y2Ba，gydF4y2BajgydF4y2Ba)或三个(gydF4y2BabgydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BadgydF4y2Ba)独立实验。gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

图9 VE-Cad增强了髓细胞分化的基因表达程序gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba公司。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba，gydF4y2BabgydF4y2Ba， VE-Cad中骨髓祖细胞的代表性百分比gydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba和同窝对照小鼠共同淋巴样祖细胞门(CLP门)(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-CadgydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 11) (gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba)和粒细胞-单核细胞祖细胞门(GMP门)(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-CadgydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 13) (gydF4y2BabgydF4y2Ba）.gydF4y2BacgydF4y2Ba， CD3的频率gydF4y2Ba+gydF4y2BaT细胞(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 12;VE-CadgydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 11)。gydF4y2BadgydF4y2Ba，他莫昔芬治疗VE-Cad中成熟造血亚群的总数gydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba和窝控小鼠，包括B220gydF4y2Ba+gydF4y2BaB细胞(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-CadgydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10)， cd3gydF4y2Ba+gydF4y2BaT细胞(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-CadgydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10)和CD11bgydF4y2Ba+gydF4y2BaGR1一起gydF4y2Ba+gydF4y2Ba骨髓细胞(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-CadgydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10)。gydF4y2BaegydF4y2Ba， VE-Cad胸腺细胞的绝对数量gydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba老鼠(gydF4y2BangydF4y2Ba= 11)和同窝小鼠(gydF4y2BangydF4y2Ba= 9)。gydF4y2BafgydF4y2Ba，他莫昔芬治疗VE-Cad患者胸腺亚群的代表性流式细胞仪分析gydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba还有控制垃圾的老鼠。gydF4y2BaggydF4y2Ba频率(控制，gydF4y2BangydF4y2Ba= 8;VE-CadgydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 5)和绝对数字(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 6;VE-CadgydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 4)来自VE-Cad的胸腺早期祖细胞gydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba还有控制垃圾的老鼠。gydF4y2BahgydF4y2Ba，百分比(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-CadgydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10)的造血干细胞、MPP2细胞、MPP3-4细胞、MPP4细胞和LSK细胞gydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba还有控制垃圾的老鼠。gydF4y2Ba我gydF4y2BaVE-Cad骨髓hsc、MPP2、MPP3、MPP4、LSK细胞总数gydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba而对照组小鼠(对照组，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-CadgydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10)。gydF4y2BajgydF4y2Ba，早期祖细胞的代表性免疫荧光(LingydF4y2Ba−gydF4y2BaCD48因子gydF4y2Ba−gydF4y2BaCD150gydF4y2Ba+gydF4y2Ba)与产生dll4的血管内皮相邻gydF4y2BaDll4-mCherrygydF4y2Ba。Lin鸡尾酒，CD11b, GR1, CD41, TER119和B220。箭头,林gydF4y2Ba−gydF4y2BaCD150gydF4y2Ba+gydF4y2Ba祖细胞。gydF4y2BangydF4y2Ba= 3只老鼠。gydF4y2BakgydF4y2Ba, scRNA-seqgydF4y2BatgydF4y2Ba- LSK腔室的sne可视化(gydF4y2BangydF4y2Ba= 21,116个细胞)，按基因型进行颜色编码。gydF4y2BalgydF4y2Ba，gydF4y2Ba米gydF4y2Ba，髓系祖细胞富集评分分布(gydF4y2BalgydF4y2Ba)及HSC (gydF4y2Ba米gydF4y2Ba)从他莫昔芬治疗VE-Cad的骨髓中提取的scrna -seq分析的HSPC群体中的基因标记gydF4y2Ba克里尔gydF4y2Ba-gydF4y2BaDll4gydF4y2Bai3COINgydF4y2Ba老鼠(汇集gydF4y2BangydF4y2Ba= 2)和窝控小鼠(合用gydF4y2BangydF4y2Ba= 2)。gydF4y2BangydF4y2Ba= 21,116个单元格。数据为均数±s.d.ns，不显著，*gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.05，**gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.01，***gydF4y2BaPgydF4y2Ba≤0.001，学生gydF4y2BatgydF4y2Ba-test，双尾(gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BadgydF4y2Ba，gydF4y2BaggydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2Ba我gydF4y2Ba)或Wilcoxon秩和检验(gydF4y2BalgydF4y2Ba，gydF4y2Ba米gydF4y2Ba）.数据代表了四个(gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BaegydF4y2Ba)或两个(gydF4y2BaggydF4y2Ba)独立实验。gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

图10内皮细胞的缺失gydF4y2BaDll1gydF4y2Ba不影响造血祖细胞的早期谱系启动。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BafgydF4y2Ba， VE-Cad-中骨髓祖细胞的流式细胞术分析gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba和对照组小鼠，显示出相同频率的常见淋巴样祖细胞(对照组，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-Cad -gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 8) (gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba)，粒细胞-单核细胞祖细胞(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 7;VE-Cad -gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 9) (gydF4y2BabgydF4y2Ba)和MPP4细胞(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-Cad -gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10) (gydF4y2BacgydF4y2Ba)，下载至B220gydF4y2Ba+gydF4y2BaB细胞(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-Cad -gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10) (gydF4y2BadgydF4y2Ba，gydF4y2BafgydF4y2Ba), CD3gydF4y2Ba+gydF4y2BaT细胞(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10;VE-Cad -gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10) (gydF4y2BadgydF4y2Ba，gydF4y2BafgydF4y2Ba)和CD11bgydF4y2Ba+gydF4y2BaGR1一起gydF4y2Ba+gydF4y2Ba单核细胞-粒细胞亚群(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 8;VE-Cad -gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 9) (gydF4y2BaegydF4y2Ba，gydF4y2BafgydF4y2Ba）.gydF4y2BaggydF4y2Ba， VE-Cad-的胸腺细胞的绝对数量gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba而对照组小鼠(对照组，gydF4y2BangydF4y2Ba= 6;VE-Cad -gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 10)。gydF4y2BahgydF4y2BaVE-Cad胸腺亚群的典型流式细胞仪分析gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba还有控制垃圾的老鼠。gydF4y2Ba我gydF4y2Ba频率(控制，gydF4y2BangydF4y2Ba= 4;VE-Cad -gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 6)和绝对数字(对照，gydF4y2BangydF4y2Ba= 4;VE-Cad -gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba，gydF4y2BangydF4y2Ba= 6)来自VE-Cad-胸腺的早期胸腺祖细胞gydF4y2BaDll1gydF4y2Bafl / flgydF4y2Ba还有控制垃圾的老鼠。数据为平均值±s.d.n.s，无显著性gydF4y2BatgydF4y2Ba以及,双尾。数据代表三个独立的实验。gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

补充信息gydF4y2Ba

补充信息gydF4y2Ba

此文件包含补充表1-5的完整指南。gydF4y2Ba

报告总结gydF4y2Ba

补充表gydF4y2Ba

该文件包含补充表1-5。全表图例显示在单独的PDF文件中。gydF4y2Ba

源数据gydF4y2Ba

权利和权限gydF4y2Ba

转载及权限gydF4y2Ba

关于本文gydF4y2Ba

通过CrossMark验证货币和真实性gydF4y2Ba

引用本文gydF4y2Ba

吉洪诺瓦，a.n.，杜加列夫，我，胡，H。gydF4y2Baet al。gydF4y2Ba单细胞分辨率下的骨髓微环境。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba569gydF4y2Ba， 222-228(2019)。https://doi.org/10.1038/s41586-019-1104-8gydF4y2Ba

下载引用gydF4y2Ba

  • 收到了gydF4y2Ba：gydF4y2Ba

  • 接受gydF4y2Ba：gydF4y2Ba

  • 发表gydF4y2Ba：gydF4y2Ba

  • 发行日期gydF4y2Ba：gydF4y2Ba

  • DOIgydF4y2Ba：gydF4y2Bahttps://doi.org/10.1038/s41586-019-1104-8gydF4y2Ba

这篇文章被引用gydF4y2Ba

评论gydF4y2Ba

通过提交评论，您同意遵守我们的gydF4y2Ba条款gydF4y2Ba和gydF4y2Ba社区指导原则gydF4y2Ba。如果您发现一些滥用或不符合我们的条款或指导方针，请标记为不适当。gydF4y2Ba

搜索gydF4y2Ba

高级搜索gydF4y2Ba

快速链接gydF4y2Ba

自然简报gydF4y2Ba

报名参加gydF4y2Ba自然简报gydF4y2Ba时事通讯-什么重要的科学，免费到您的收件箱每天。gydF4y2Ba

获取当天最重要的科学故事，免费在您的收件箱。gydF4y2Ba 注册《自然简报》gydF4y2Ba
Baidu
map