扩展数据图6:网络分析的ATAC和RNA-seq米娅和反面小胶质细胞。
一个、密度的转录因子(TF)和目标(TG)监管方向建立编码数据和丰富的米娅和反面小胶质细胞。监管的方向确定使用皮尔逊相关系数的负值表明压制网络和积极的价值观表示一个激活网络。TF-TG对丰富的米娅小胶质细胞(红色),反对小胶质细胞(灰色)或常见的两组(蓝色)。b、褶皱变化(米娅和反面之间)和意义具体TF-TG对米娅小胶质细胞(红色)和反面小胶质细胞(灰色)使用PECA决定。cCytoscape网络的高纯度TF-TG网络用色彩表示反对(灰色)和米娅的浓缩(红色)。行指示TF-TG网络。d e,总DNA的浓度与抗体被急忙逃走IRF1 (d)和STAT2 (e) IRF1: n反对从2 = 4老鼠窝,n米娅从2 = 4老鼠窝,STAT2: n反对从3 = 4老鼠窝,n米娅从2 = 4老鼠窝。做减法特定目标DNA捕获使用CUT&RUN-qPCR表示为总额的百分比输入DNA的TF IRF2 (f),或STAT2 IRF1 (g)为目标的基因:Fas和il - 6和STAT2:IL-23a。n是个体动物。一个双边t检验分析的数据。n和d e一样。ITF1 -Fas:t (6) = 2.5, p = 0.047, IRF1 -il - 6:t (6) = 3.15, p = 0.02, STAT2 -IL-23:t (5) = 4.74, p = 0.005。d中的箱形图显示中值(中线)、差(框限制)和1.5×差(胡须)。* p < 0.05
