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人APOBEC3G抗HIV-1 Vif的结构基础

我们提供了这篇手稿的未经编辑的版本,以便早期访问其发现。在最终出版之前,手稿将进行进一步的编辑。请注意,可能存在影响内容的错误,所有法律免责声明均适用。

摘要

APOBEC3 (A3)蛋白是宿主抗病毒细胞蛋白,可使不同病毒家族的病毒基因组高突变。在逆转录病毒中,这个过程需要A3包装成病毒颗粒1 - 4.慢病毒编码一种蛋白Vif,通过靶向A3家族成员进行降解来拮抗它们。A3的多样化允许宿主逃离Vif,而Vif的适应性使灵长类慢病毒能够跨物种传播。这种分子军备竞赛是如何在结构水平上进行的尚不清楚。在这里,我们报道了人类APOBE3G (A3G)结合HIV-1 Vif和被劫持的细胞蛋白促进泛素介导的蛋白水解的低温电子显微镜结构。一个小表面解释了分子军备竞赛,包括导致HIV-1诞生的跨物种传播事件。出乎意料的是,我们发现RNA是Vif-A3G相互作用的分子粘合剂,使Vif通过泛素依赖和独立机制抑制A3G。我们的研究结果提出了一个模型,其中Vif通过拦截对病毒最危险的A3G形式来拮抗A3G,当它与RNA结合并在包装的过程中,以防止病毒限制。通过接触限制所需的基本表面,Vif利用了A3G中的一个漏洞,提出了一种一般机制,即RNA结合有助于定位宿主抗病毒基因的病毒拮抗所必需的关键残基。

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补充信息

该文件包括“补充讨论”、“补充图1-4”、“补充表1-2”和“补充参考”。补充讨论:本文件讨论了A3G-RNA-VCBC二聚物的结构,对应于扩展数据图1-4和7-8。补充图1包含了用于图1f和扩展数据图1a和5的未经裁剪的源图像。补充图2-4显示了适合A3G-RNA-VCBC单体和二聚物的模型图。表1总结了根据突变分析报道的参与RNA结合的Vif残基。表2总结了根据突变分析报道的参与RNA结合的A3G残基。

报告总结

补充视频1

状态1和状态2中二聚物结构的比较。状态1和状态2由A3G-RNA-VCBC原体的刚体运动相关。A3G以粉红色突出显示。

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引用本文

李,YL.,兰利,c.a., Azumaya, C.M.et al。人APOBEC3G抗HIV-1 Vif的结构基础。自然(2023)。https://doi.org/10.1038/s41586-023-05779-1

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  • DOIhttps://doi.org/10.1038/s41586-023-05779-1

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