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计算基因组学

在空间转录组学中绘制细胞关系

介绍了一种基于图神经网络的工具,使用空间分辨的转录组学数据来执行无监督的细胞聚类,这些数据可以揭示组织和器官中的细胞身份、相互作用和空间组织。

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图1:基于图的模型方法概述,处理由10x Visium生成的人类背外侧前额叶皮层的SRT数据7作为示例输入。

参考文献

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在空间转录组学中绘制细胞关系。Nat计算科学2, 354-355(2022)。https://doi.org/10.1038/s43588-022-00269-2

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