数据可用性和政策

基因与免疫坚持施普林格大自然的数据政策.这意味着一种屈从基因与免疫暗示手稿中描述的材料,包括所有相关的原始数据,是否可以免费提供给任何希望使用它们的研究人员用于非商业用途,不违反参与者的机密。这也意味着a数据可用性声明(详情见下文)是该期刊的要求。

数据政策详情

该杂志强烈建议,读者应该能够获得论文结论所依赖的所有数据集。我们鼓励作者确保他们的数据集要么存放在公开可用的存储库中(如果可用且适当),要么尽可能在主要手稿或其他支持文件中呈现。请参阅施普林格Nature关于推荐库的信息。

通用存储库-用于所有类型的研究数据-如figshare和Dryad可以在适当的情况下使用。

如果在公共存储库中存在广泛建立的研究团体对数据存档的期望,则必须提交到社区认可的公共存储库*。

论文中必须提供相关数据集的持久标识符(如doi和登录号)。

*对于以下类型的数据集,必须提交到社区认可的公共存储库:

强制性的沉积

合适的存储库

蛋白质序列

Uniprot

DNA和RNA序列

基因库

日本DNA数据库(DDBJ)

EMBL核苷酸序列数据库(ENA)

DNA和RNA测序数据

NCBI跟踪档案

序列读存档(SRA)

遗传多态性

dbSNP

dbVar

欧洲变异档案(EVA)

链接的基因型和表型数据

dbGAP

欧洲基因组表型档案(EGA)

大分子结构

全球蛋白质数据库(wwPDB)

生物磁共振数据库(BMRB)

电子显微镜数据库(EMDB)

微阵列数据(必须兼容MIAME)

基因表达综合(GEO)

ArrayExpress

小分子的晶体学数据

剑桥结构数据库

数据可用性声明

作为基因与免疫数据可用性政策,所有原始文章必须包含数据可用性声明.数据可用性声明应包括在哪里可以找到支持文章中报告的结果的数据的信息,包括在适用的情况下,到研究期间分析或生成的公开存档数据集的超链接。通过数据,我们指的是解释、复制和构建文章中报告的发现所必需的最小数据集。我们认识到,公开分享研究数据并不总是可能的,例如当个人隐私可能受到损害时,在这种情况下,数据可用性仍然应该在手稿中连同任何访问条件一起声明。

数据可用性声明可以采用以下形式之一(如果需要多个数据集,可以采用多种形式的组合):

  1. 在当前研究期间生成和/或分析的数据集可在[NAME]存储库[持久WEB链接到数据集]中获得。
  2. 由于[数据不公开的原因],在当前研究期间生成和/或分析的数据集不是公开的,但可以根据合理的要求从通信作者那里获得。
  3. 在当前研究期间生成和/或分析的数据集可根据合理要求从通信作者处获得。
  4. 数据共享不适用于本文,因为在当前研究期间没有生成或分析数据集。
  5. 在这项研究中产生或分析的所有数据都包含在这篇发表的文章[及其补充信息文件]中。
  6. 支持本研究结果的数据可从[第三方名称]获得,但这些数据的可用性受到限制,这些数据是在当前研究的许可下使用的,因此不能公开。然而,经作者合理要求并获得[第三方名称]的许可,可从作者处获得数据。