MSCA研究分子晶体精确能量排序的有效方法的博士研究生
(2022年10月21日至2022年12月23日有效)
语言:英语(英国)
国家:卢森堡
物理及材料科学系组织学系(DPHYMS）
数据:
工作人数:UOL05342
固定期限合同
类型:
持续时间36个月
安排全职
类型:
每周工作时间40.0小时
预计01/02/2023
开始日期:
工作的博士研究员
(内部):
功能:博士候选人
此职位是居里夫人行动博士网络(MSCADN)PHYMOL（http://phymol.eu/)：
物理学，准确性和机器学习:迈向下一代分子势。
在PHYMOL我们汇集了分子模拟、量子化学、晶体结构预测等领域的顶尖专家，
分子间建模、光谱学、机器学习和纳米簇，来自12个学术机构和国家实验室，以及4个工业实验室
实体，在一个雄心勃勃的研究和培训计划，以培养分子建模领域的新一代研究人员。PHYMOL
以一种共生的方式，将分子相互作用的最先进的物理理解与机器学习结合起来，将产生新的
一代有能力推动解决医疗保健、能源和环境以及基础科学等重要问题的研究人员。
私营部门是PHYMOL并参与管理、培训和研究。有了来自学术界，工业界的联合力量
从欧盟和美国，我们寻求保持分子模拟技术在欧盟工业和科学的前沿。
PHYMOL是一个研究和培训网络。我们需要研究人员对分子相互作用有更深的物理理解
在计算机辅助学习方面有深厚的专业知识:只专注于其中一项技能不会让我们达到我们想要达到的目标。机器学习(毫升)
需要精确的数据，虽然我们有一些最精确的从头计算方法(许多是由这个联盟的成员开发的)，但我们知道非常
他们的局限性和缺点。因此,在PHYMOL我们已经建立了一个研究和培训计划，涵盖了所有重要的领域
分子间相互作用领域:方法的开发，参考数据的生成和测试，利用物理思想开发模型
以及机器学习，以及这些模型在高精度光谱计算和大规模分子动力学计算机中的应用
复杂系统的模拟。
的PHYMOL博士网络将从英国和欧盟的10个参与机构招募11名博士候选人。
你的角色……
最先进的:一种能准确有效地预测分子晶体稳定相的方法是非常可取的
开发新药。如果一种药物是在亚稳相中生产的，然后再转化为更稳定的相，它就会产生
这药不溶且无效。一些药物，如利托伐尼，是一种艾滋病毒经处理后，已因不能从市场上召回
及时发现最稳定的变形体。晶体结构预测如此具有挑战性的一个主要原因是其中一个主导因素
将分子晶体结合在一起的相互作用是范德华相互作用，这是一种固有的量子力学现象。此外，当范德
两个单个分子之间的瓦尔斯相互作用是弱的，多体效应甚至会引起系统中分子之间的集体相互作用
相距几百埃的距离，才变得可感知。
范德华相互作用的复杂性质和药物相关分子晶体的大小阻碍了计算的使用
预测晶体结构的方法，甚至建立密度泛函理论(DFT)，现代计算化学的主力，无效。两个
事态发展正在改变这种状况。首先，我们小组最近证明了DFT可以补充一个近似的模型
范德华相互作用称为多体色散(MBD)模型，可以提高分子晶体预测的定量精度
结构。第二，机器学习力场的领域正在取得巨大的进步，他们现在能够得出结果
与量子力学方法相比，他们训练的准确性在数量级上降低了成本。我们打算利用这些新的
提高晶体结构预测方法的精度和效率的发展直接着眼于工业应用。
研究目标:博士候选人将测试在DFT+MBD上训练的机器学习力场方法，并改进和集成这些方法
晶体结构预测工作流程，着眼于适当平衡不同分子内部和分子间相互作用之间的复杂相互作用。
日常:该研究将涉及在一个基于linux的高性能计算集群上工作，使用python运行和分析计算和
实现/扩展方法的不同方面的晶体结构预测工作流程。用各种语言编程将成为主流
在将新方法集成到现有软件包中时要集中精力。的TCP集团有几个经验丰富的博士后，将能够协助
掌握本研究各个方面的博士研究生。此外，这项工作将由我们的工业合作伙伴共同监督，以便
将研究导向现实世界的应用。
先决条件……
良好的数学和编程能力，对基本量子力学、热力学、物理和化学直觉有良好的理解。
流动性需求
研究人员可以来自任何国家。他们必须遵守交通规则。研究人员通常被要求进行跨国研究
受聘时的流动性(即从一个国家迁往另一个国家)。一个通用规则适用于大学研究人员的任命
网络:在接收组织招募时，研究人员不得居住或进行主要活动(工作、研究等)
在紧接参考日期之前的3年内，在其东道国居住超过12个月。短期停留，如假期
和/或义务国民服务不被考虑在内。就国际欧洲利益组织或国际组织而言
有关方面，这一规则不适用于合格研究人员的接待。然而，被任命的研究人员不得在美国工作超过12个月
在提交建议书或由主办机构招聘的参考截止日期前的3年(视乎有关行动而定)
同一委任机构。
总之……
*合同类型:固定期限合同36个月
*工作时间:全职每周40.0小时
*位置:Limpertsberg
*职位编号:UOL05342
如何应用…
应用程序应该包括:
*简历
*求职信
我们非常鼓励尽早申请，因为我们会在收到申请后立即处理。请申请在线正式通过人力资源系统。
以电邮方式递交的申请将不获考虑。
卢森堡大学以包容和多样性为核心价值观。我们完全致力于消除与……有关的任何歧视性障碍
性别，不仅仅是在我们员工的招聘和职业发展方面。
参考文献
什么是晶体结构预测?为什么这么难?-剑桥大学晶体学数据中心(控烟条例）
约翰内斯·霍贾、柯新宇、马库斯·a·诺伊曼、罗伯托·卡尔、罗伯特·a·迪斯塔西奥和亚历山大·特卡琴科“可靠而实用
分子晶体多态性的计算描述。Adv.， 5, eaau3338(2019)对一般问题和
DFT+MBD是博士候选人将使用的方法。
PI，共同导师:卢森堡大学Alexandre Tkatchenko(主要导师)，Dahvyd Wing(共同导师);马库斯·a·诺伊曼(共同导师)，
先锋材料仿真公司;Alston Misquita(导师)，伦敦大学
主办院校:卢森堡大学在2022年泰晤士高等教育青年大学排名中排名第25位，国际排名全球第3位
前景。先锋材料模拟德国有限公司，位于德国弗赖堡，是自动对盘及成交系统SARL该公司由马库斯·诺伊曼博士于2002年创立。它
是私人所有的，是在一家大型制药公司的资金和大力支持下创建的。公司的主要目标是发展
晶体结构预测软件。特别是它的软件包，格蕾丝，是目前使用最多的晶体结构预测软件
制药行业。
更新:描述PHYMOL、网络结构、培训、会议、DC福利。
网页:https://www.tcpunilu.com/，https://www.avmatsim.eu，PHYMOL
应用在这里https://emea3.recruitmentplatform.com/syndicated/private/syd_apply.cfm?ID=PSAFK026203F3VBQB7V7VV4I3&nPostingTargetId=115959&nPostingId=78676
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