霍华德·休斯医学研究所

科学计算助理-自动化认知神经科学研究

霍华德·休斯医学研究所

阿什本,美国

科学计算助理-自动化认知神经科学研究与机器视觉,协作机器人,游戏引擎,和基于代理的建模

简介:

二级科学计算助理(SCAII)职位代表了传统科学角色(例如博士后)的替代选择,并提供了一个理想的环境,以建立计算研究或软件工程的职业生涯。该职位旨在培养在计算研究和专业软件工程方面的资格和经验,使候选人能够在科学或工业领域追求未来的职业生涯。

我们正在寻找一个有才华和积极的计算科学家开发和部署软件来观察,控制,分析和模拟自由移动的啮齿动物(大鼠和小鼠)的行为神经科学实验。这需要开发和集成机器视觉系统、机器人控制和高性能3D游戏引擎的软件。在实验室中,我们使用协作机器人灵活地重新配置实验环境,以测量啮齿动物如何使用直观的物理学来解决熟悉问题的新实例(如取回)。我们用高速多摄像头系统记录行为数据(每个摄像头生成2-3GB/s的原始数据)并使用GPU-加速编码,每天捕获数小时长的数据集。通过将实时机器视觉系统与灵活的行为环境机器人控制集成在一起,我们允许神经科学家以新的和创造性的方式测量和模拟动物的认知和智力。

应聘者将在科学计算软件和约翰逊实验室之间密切合作。候选人将有机会获得全方位的计算和实验资源,包括高性能工作站,CPU/GPU集群、机器视觉摄像机和协作机器人。候选人将被安置在一个由计算科学家、软件工程师和认知神经科学家组成的高度协作的团队中。

SCAII职位的聘期为12至24个月,最后期限为12个月(总期限最多为36个月)。

职责:

候选人将:

  • 开发高分辨率、多摄像头视觉系统的解决方案:

    • 改进和扩展GUI(用C/ c++和Dear ImGui编写)来控制,流,注释和分析多摄像头视频。

    • 改进和管理GPU-加速视频编码、分析和存储管道。

    • 训练和部署动物和物体的三维姿态估计模型。

  • 开发实验场馆的三维数字双胞胎,用于实时控制和分析:

    • 使用3D动物、物体和机器人姿态信息在3D游戏引擎中重建实验数据(使用Unity或Isaac Sim)。

    • 将机器视觉系统与取放机器人集成,以程序生成实验任务配置。

    • 设计和部署一个视频游戏,以改善人类和算法对实验流程的控制。

    • 在数字双胞胎中训练3D虚拟啮齿动物,使用深度强化学习算法解决基于物理的推理任务。

资格:

教育:

  • 计算机科学或同等学历(最好是硕士或博士)

  • 熟悉C/ c++ / c#和Python编程语言

  • 有机器学习和大数据的经验

  • 有独立解决复杂问题的经验

  • 良好的沟通能力,良好的团队合作精神

  • 有没有机器视觉的经验,GPU编程、基于代理的建模、机器人、游戏开发或强化学习是加分项。

Janelia给你什么:

  • 为你提供一个计算和实验爱好者的环境

  • 有经验的科学家和软件工程师支持这个项目

  • 使你成为一名独立的科学家

  • 提供一个令人兴奋和鼓舞人心的工作环境霍华德·休斯医学研究所Janelia

关于具体问题,请随时联系Rob Johnsonjohnsonr@janelia.hhmi.org& Stephan Preibischpreibischs@janelia.hhmi.org

身体要求:

长时间保持正常的坐姿或站立姿势;通过伸出手或手臂达到和抓住;灵巧地用手指操作物体,例如使用键盘;运用口头语言的沟通技巧;能在正常范围内看到和听到;能够在工作空间中移动。这个职位需要机动性,包括能够移动重达几磅的材料(比如笔记本电脑或平板电脑)。

在合理的安排下,残疾人可以履行这一职位的基本职责。合理住宿的要求将按个人情况进行评估。

请注意:

该职位描述列出了该职位的主要职责、责任和要求;但是,它不应被理解为一份详尽的声明。除非以“可能”开头,以上所述的基本职责和责任都是《美国残疾人法案》所定义的工作的“基本职能”。

请通过招聘网站申请。

引用参考:R-1540