克隆造血的多组学分析

克隆造血的多组学分析

单细胞多组学技术定义了体细胞DNMT3A突变改变人克隆造血的细胞表型。

自然遗传学是一个变革的杂志;作者可以使用传统的出版途径或通过即时的黄金开放获取进行出版。

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  • 高通量实验平台彻底改变了生物序列(如DNA、RNA和蛋白质)生化和功能特性的分析能力。通过对几种数据模式进行整理,使用直观的可视化呈现可定制的轨迹,基因组浏览器可以对不同类型的基因组分析实验和派生注释进行交互式和可解释的探索。然而,现有的基因组浏览器轨迹并不适合于直观地可视化高分辨率DNA序列特征,如转录因子基序。通常,调控DNA序列中的基序实例被可视化为基于bed的注释轨迹,它突出显示基序实例的基因组坐标,但不暴露其特定序列。相反,基因组序列轨迹需要与BED轨迹交叉引用,以确定母题命中的序列。即便如此,关于基序实例的定量信息,如亲和性或保守性,以及与共识基序的碱基分辨率的差异,并不是立即明显的。这使得解释变得缓慢且具有挑战性。当同时分析几个细胞状态和/或分子读数(如ATAC-seq和ChIP-seq)时,这个问题变得复杂,因为富集区域(峰)的坐标和活性转录因子基元的集合在细胞状态不同。

    • Surag Nair
    • Arjun巴雷特
    • Anshul Kundaje
    评论
  • 许多大型研究计划已经累计招募了数千名患有一系列复杂医疗问题但没有明确遗传病因的患者。然而,目前尚不清楚研究人员、机构和资助者应该如何管理这些数据,以及在这些研究结束时与那些尚未确诊的参与者的关系。在这篇评论中,我们概述了目前临床基因组学研究中与研究后义务相关的文献,并讨论了当前指南在未诊断参与者研究中的应用。

    • 梅根·c·哈雷
    • 尤安·a·阿什利
    • 霍莉·k·塔博尔
    评论
  • 在本期的自然遗传学在美国,我们庆祝200年前出生的格雷戈尔·孟德尔所留下的遗产。我们也注意到,今年是中国启动30周年自然遗传学.这两个里程碑的交汇有助于我们回顾遗传学领域的发展,也有助于我们展望未来,看看我们将走向何方。

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