在超过100万的参与者中发现和系统描述冠状动脉疾病的风险变异和基因 全基因组关联分析,功能知情精细作图和互补基因优先级方法确定新的风险位点和候选效应基因的CAD。 Krishna G. Aragam 道江 CARDIoGRAMplusC4D联盟 文章 开放获取 2022年12月6日
NALCN通道调节转移和非恶性细胞扩散 离子通道NALCN调节小鼠细胞脱落,增强小鼠癌症模型的转移。没有致癌基因突变的弥散性细胞在次要部位形成正常结构,这表明细胞脱落是肿瘤发生过程中被劫持的生理过程。 埃里克·p·拉赫曼 大卫Shorthouse 理查德·j·吉尔伯特森 文章 开放获取 2022年9月29日
增强子-启动子相互作用和转录在CTCF、内聚蛋白、WAPL或YY1急性缺失时基本维持 小鼠胚胎干细胞的Micro-C和新生转录本分析显示,增强子-启动子相互作用对CTCF、内聚蛋白、WAPL或YY1的急性耗竭具有很强的抵抗力。活细胞单分子成像显示,内聚蛋白耗竭减少了转录因子与染色质的结合。 谢宗汉 克劳迪娅Cattoglio 罗伯特Tjian 文章 开放获取 2022年12月5日
两个bHLH转录因子对水稻种子休眠的拮抗控制 SD6它与另一bHLH因子ICE2一起编码一种bHLH转录因子,通过调节ABA分解代谢和生物合成基因,以温度依赖的方式拮抗控制水稻种子休眠。 风扇徐 Jiuyou唐 Chengcai楚 文章 2022年12月5日
全基因组CRISPR筛选确定CALCOCO2作为影响2型糖尿病风险的β细胞功能的调节器 在人EndoC-βH1胰腺β细胞系中的全基因组CRISPR敲除筛选确定了580个细胞内胰岛素含量的调节因子。的损失CALCOCO2扰乱胰腺β细胞胰岛素颗粒稳态。 安特耶·k·罗特纳 迎迎你们 安娜·l·格洛因 文章 开放获取 2022年12月21日
人类肺的空间分辨图谱显示了腺体相关的免疫生态位 对45个人类肺样本的多组学分析显示,沿着肺的近端到远端轴,有80种不同的细胞类型,某些细胞类型显示出疾病相关基因的富集。在气道粘膜下腺(SMG)中也发现了表达iga的浆细胞的免疫生态位。 值得信赖Madissoon 阿曼达·j·奥利弗 克斯汀·b·迈耶 文章 开放获取 2022年12月21日
5-羟甲基胞嘧啶可阻止引起先天免疫反应的伪转录 平滑肌细胞特异性敲除Tet3在小鼠中导致基因内5-羟甲基胞嘧啶的丢失,假转录本的积累和tlr7 /8介导的肺炎症类似于人类肺样本中的哮喘。 风扇吴 乡里 托马斯·布劳恩 文章 开放获取 2022年12月20日
通过对欧洲和东亚血统的100,204例病例和154,587例对照的多组学分析,破译结直肠癌遗传学 一项多祖先全基因组关联研究荟萃分析,结合转录组和甲基组全关联分析,确定了与结直肠癌相关的风险位点。可信的效应基因及其靶组织也被突出显示,显示超过三分之一的效应基因可能作用于结肠粘膜外。 Ceres Fernandez-Rozadilla 玛丽亚Timofeeva 乌尔丽克•彼得斯 文章 2022年12月20日
小鼠胚胎和生殖系发育过程中DNA羟甲基化和甲基化的动态研究 DNA 5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)在小鼠着床前胚胎、着床后外胚层细胞、原始生殖细胞(PGCs)和配子中被定位。Nlrp14母本缺失干扰dna复制耦合被动去甲基化并损害5hmC沉积。 瑞燕 鑫程 风扇郭 文章 2022年12月20日
单细胞sortChIC识别造血过程中的分层染色质动态 排序辅助单细胞染色质免疫切割(sortChIC)将单细胞组蛋白修饰分析与荧光激活细胞分选(FACS)相结合,使罕见细胞群的研究成为可能。H3K4me1/H3K4me3, H3K9me3和H3K27me3的血液分析提示了一种谱系共享的抑制性和细胞类型特异性活性染色质模型。 彼得泽勒 杰克杨 亚历山大·范·乌德纳登 技术报告 开放获取 2022年12月20日
寻找冠状动脉疾病潜在风险的致病基因 以往的冠状动脉疾病(CAD)全基因组关联研究发现了多个易感位点,但在很大程度上未能发现致病基因。一项新的研究确定了数百种可能导致CAD遗传风险的致病基因。 保罗·l·奥尔 新闻及观点 2022年12月6日
两个bHLH转录因子通过调控ABA水平来影响发芽 对于植物来说,发芽的决定是对其后续生存的一场赌博。Xu等人发现了一种通过调节ABA水平来决定萌发和休眠的机制。 吉田秀树 Makoto松岗 新闻及观点 2022年12月5日
人类疾病遗传变异的多功能功能分析 我们开发了一种基于crispr的功能检测方法,用于检测人类疾病中发现的基因序列变异,探测它们对细胞增殖、存活、运动性和任何通过荧光激活细胞分选(FACS)可测量的生理或病理过程的影响。该方法在体外和体内准确地评估了变异致病性、药物反应性或耐药性以及在疾病中的机制作用。 研究简报 2022年12月5日
确定弥漫性中线胶质瘤的细胞来源 组蛋白H3的K27M突变已被确定为弥漫性中线胶质瘤的驱动事件。两项研究使用全面的多模型单细胞基因组学、表观基因组学和染色质结构分析来描述细胞的起源,并在脑桥和丘脑肿瘤之间发现了H3K27M的独特病因,并表明脑桥胶质瘤含有更多未成熟的少突胶质细胞样前体细胞。 李笑南 新闻及观点 2022年12月5日
战胜风险:卵巢癌长期幸存者的分子特征 高级浆液性卵巢癌是这种疾病最常见的形式,通常是致命的。这项研究调查了在最初诊断后存活10年以上的女性肿瘤的基因组和免疫特征,并将其与短期和中期幸存者进行了比较。 研究简报 2022年12月1日
基因未来主义 大规模的基因分型和表型分型工作,包括生物银行,已经彻底改变了我们对人类特征和疾病的遗传结构的理解。多年来规模越来越大的全基因组关联研究(GWAS)已经产生了导致复杂性状的遗传变异目录。这项研究的一个必然结果是开发了个性化多基因评分(PGS)或多基因风险评分(PRS)。 编辑 2022年12月5日