卷EM:一场静悄悄的革命需要的形状 卷电子显微镜(vEM)是一组技术,揭示细胞和组织的3 d超微结构通过持续至少1微米的深度。一个蓬勃发展的基层社区努力快速构建配置文件和暴露的影响vEM技术在生命科学和临床研究。 露西·m·歌 卡莱斯博斯 保罗Verkade 评论 2023年4月19日
single-coverage和复用的宏基因组装箱比较揭示出了大量隐藏污染 这项研究显示,在分析多试样宏基因组数据集时,复用的装箱方法优于single-coverage装箱替代发电箱与更高的质量和更少的污染。 詹妮弗鹤嘴锄 米克·沃森 简短的沟通 2023年6月29日
MultiVI:深生成模型的集成多通道数据 通过学习使用深联合表示生成建模、MultiVI集成多通道和single-modality单细胞的数据集,这增强了多个功能。 Tal Ashuach 马里亚诺·i Gabitto 近红外光谱Yosef 文章 开放获取 2023年6月29日
CherryML:可伸缩的系统模型的最大似然估计 CherryML方法扩大通用系统模型的最大似然估计的分子进化,提供几个数量级的加速比传统方法。 塞巴斯蒂安Prillo Yun邓 Yun美国歌曲 文章 2023年6月29日
多尺度分析pangenomes使改善表示重复的基因组多样性和临床相关的基因 PanGenome研究工具(PGR-TK)实现灵活的和可伸缩的表示,使用PanGenome图形可视化和分析基因变异。 Chen-Shan下巴 Sairam Behera 贾斯汀·m·祖克 文章 开放获取 2023年6月26日
扩张空间转录组 扩张空间转录组(Ex-ST)结合组织扩张的力量和一种改进的RNA协议执行捕获基于数组的空间转录组在高空间分辨率。 余杭风扇 Žaneta Andrusivova 薄王 简短的沟通 2023年6月22日
Multiplex-GAM:全基因组染色质联系人收益率的见解被高c忽略的识别 Multiplex-genome架构映射(multiplex-GAM)实现快速、公正、ligation-free映射的全基因组染色质交互。 罗伯特·Beagrie Christoph j·蒂米 安娜Pombo 文章 开放获取 2023年6月19日
基因组结构映射检测转录活跃,多路染色质联系人 基因组结构映射(GAM)使3 d核基因组结构的理解。我们直接multiplex-GAM相比,高c数据,发现当地染色质交互一般被两种方法,但活跃的基因组区域丰富的增强剂,建立了高阶接触者优先被GAM。 研究简报 2023年6月19日
一个灵活的系统的组织基因表达小鼠使用腺相关病毒 细胞类型特异性转基因表达小鼠在生物医学研究中具有广泛的实用程序。我们开发了一个通用的系统体内转基因交付使用腺相关病毒(AAV)。效率和组织转基因表达是通过调节基因编码AAV受体的表达,从而精确地瞄准AAV感兴趣的细胞类型。 研究简报 08年6月2023年
破译亚细胞组织和多路复用成像和深度学习 我们的研究介绍了多路复用条件autoencoder像素分析(坎),一个深度学习的框架,该框架使用高度复合成像识别一致的亚细胞跨异构细胞群和实验扰动的地标。生成可判断的细胞表型显示RNA生产的亚细胞组织和扰动之间的联系,RNA加工和细胞大小。 研究简报 2023年5月29日
