DNA转座子,如Tc-1/mariner,具有倒置末端倒置重复序列(ITRs)和一个编码转座酶的开放阅读框(ORF)。它们的两侧是短的直接重复序列(dr)。逆转录转座子根据其是否具有编码逆转录转座子所需蛋白质的orf而分为自主和非自主两类。常见的自主逆转录转座子有(i) ltr或(ii)非ltr(关于其他不属于这两类的逆转录转座子的讨论,请参阅文本)。LTR逆转录转座子的例子是人类内源性逆转录病毒(HERV)(如图所示)和酿酒酵母的各种Ty元素(如图所示)。这些元素具有末端lts和轻微重叠的orf,用于其群体特异性抗原(gag)、蛋白酶(prt)、聚合酶(pol)和包膜(env)基因。它们在插入时产生目标位点副本(TSDs)。还显示逆转录酶(RT)和核酸内切酶(EN)结构域。其他负责小鼠移动元件插入的LTR逆转录转座子包括胸骨内a粒子(IAPs)、早期转座子(Etns)和哺乳动物LTR逆转录转座子(MaLRs)。这些元素在人体中不存在,而且基本上都有缺陷,所以它们在trans中的RT来源仍然未知。 L1 is an example of a non-LTR retrotransposon. L1s consist of a 5'-untranslated region (5'UTR) containing an internal promoter, two ORFs, a 3'UTR, and a poly(A) signal followed by a poly(A) tail (An). L1s are usually flanked by 7- to 20-bp target site duplications (TSDs). The RT, EN, and a conserved cysteine-rich domain (C) are shown. An Alu element is an example of a nonautonomous retrotransposon. Alus contain two similar monomers, the left (L) and the right (R), and end in a poly(A) tail. Approximate full-length element sizes are given in parentheses.
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