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|开放获取
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的角度来看|
神经系统类器官和集合体的命名共识
讨论了神经系统发育和疾病的人类多细胞模型的命名法,包括类器官、集合体和移植,并提出了一个共识框架。
- Sergiu P. paika
- ,Paola Arlotta
- &弗洛拉M.瓦卡里诺
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CRISPR屏幕果蝇细胞识别Vsg为Tc毒素受体
全基因组crispr - cas9介导敲除筛选果蝇细胞鉴定Visgun为毒素复合毒素的蛋白质受体,证明了这种方法在研究杀虫毒素和病原体方面的效用。
- 徐应
- ,Raghuvir Viswanatha
- &分钟董
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|开放获取非病毒的,特异性靶向的CAR-T细胞在B-NHL中具有很高的安全性和有效性
基因特异性靶向整合的非病毒CAR-T细胞在淋巴瘤患者中是安全有效的。
- Jiqin张
- ,Yongxian胡
- &他黄
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文章
|开放获取Cas9 r -环的形成及构象激活机制
冷冻电子显微镜结构酿脓链球菌Cas9在多种DNA结合状态下的存在,为Cas9被靶DNA激活的机制提供了新的认识。
- 马丁Pacesa
- ,Luuk Loeff
- &马丁Jinek
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|开放获取小鼠和人类组织中染色质可及性的空间分析
利用下一代测序技术对组织切片进行空间- atac -seq空间分辨染色质可及性分析,在小鼠胚胎中描绘出组织区域特异性表观遗传图谱,并识别出参与中枢神经系统和淋巴组织发育的基因调节因子。
- Yanxiang股份邓
- ,Marek Bartosovic
- &荣迷
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文章
|开放获取Live-seq可以对单细胞进行短时转录组记录
Live-seq是一种单细胞转录组分析方法,在使用流体力显微镜提取RNA时保持细胞活力,通过将scRNA-seq从终点转化为时间分析方法,可以解决一系列生物学问题。
- Wanze陈
- ,Orane Guillaume-Gentil
- &巴特Deplancke
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代表性酵母基因的同义突变大多是强非中性的
一项对21个酵母基因8341个突变的调查显示,同义突变几乎和非同义突变一样有害,部分原因是它们都影响突变基因的mRNA水平。
- 旭康沈
- ,Siliang歌
- &Jianzhi张
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文章
|开放获取丝裂糖体小亚基生物发生和预起始机制
对几个小丝裂糖体亚基中间产物的结构分析揭示了生物发生的顺序机制,以及装配连接到起始形成活性丝裂糖体的方式。
- 伊藤Yuzuru
- ,阿拉斯主席
- &Alexey Amunts
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不同的辅助因子依赖性定义了不同类型的人类增强因子
通过辅助因子依赖性对增强子进行系统分类,为理解增强子的序列和染色质多样性及其在不同基因调控程序中的作用提供了一个概念框架。
- Christoph梅尔
- ,Vanja Haberle
- &亚历山大·斯塔克
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大脑和肠道的组织样神经递质传感器
NeuroString是一种类似组织的生物界面,通过激光将聚酰亚胺与嵌入弹性体中的石墨烯/纳米粒子网络结合而成,允许在体内实时检测大脑和肠道中的神经递质。
- 金星数码李
- ,宇新刘
- &鲍哲南
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结构程序化毛细管流动事件的微流控链反应
微流体链反应在原位结构上编码程序,可以形成一个节俭、多功能、真正的芯片实验室,在液体处理和点护理诊断方面有广泛的应用
- 穆罕默德Yafia
- ,Oriol Ymbern
- &大卫·容克
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活胚胎中远端调控基因的转录偶联
在果蝇在美国,远距离同源基因有广泛的物理和功能联系,包括共享增强子的共同调控和近250个碱基距离上的共转录起始。
- 米甲左旋的
- ,若昂Raimundo
- &迈克尔·s·莱文
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的角度来看|
人类泛基因组计划:绘制基因组多样性的全球资源
人类泛基因组参考联盟的目标是提供最高质量和最完整的人类泛基因组参考,为人类群体提供多样化的基因组表示。
- Ting王
- ,露辛达Antonacci-Fulton
- &大卫Haussler
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绘制蛋白质结合结构域的能量和变构图
一种结合了深度突变扫描和基于神经网络的热力学建模的方法被用来提供两个常见蛋白质结构域突变的能量和变构效应的全面地图。
- 安德烈·j·福尔
- ,茱莉亚·多明戈
- &本·雷纳
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肝脏亚细胞结构的调节控制代谢稳态
利用增强聚焦离子束扫描电子显微镜成像和基于深度学习的自动分割进行详细重建,表明肝细胞亚细胞细胞器结构调节代谢。
- GuneşParlakgul
- ,Ana Paula Arruda
- &Gökhan S. hotamqqillygil
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文章
|开放获取CRISPR-Cas9失配监测的结构基础
Cas9失配解理过程中的低温电子显微镜结构为Cas9脱靶效应的控制机制提供了深刻的认识,这将有助于未来设计具有较少脱靶解理的高保真Cas9变体。
- 杰克·p·k·布拉沃
- ,Mu-Sen刘
- &大卫·w·泰勒
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|开放获取Omicron可以躲过现有的大多数SARS-CoV-2中和抗体
利用一个高通量酵母展示平台,分析了SARS-CoV-2受体结合域(RBD)中能够逃脱抗体的突变图谱,并表明大多数抗RBD抗体可以被Omicron变体逃脱。
- 云龙曹
- ,王静
- &谢晓亮
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空间基因组学使组织克隆异质性的多模式研究成为可能
一种使用条形码珠在组织切片内进行DNA测序的技术使肿瘤克隆异质性的空间分辨成为可能,并可与其他分析技术复用,用于分析复杂的细胞表型。
- Tongtong赵
- ,Zachary D. Chiang
- &范陈
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多视角共焦超分辨率显微镜
多视角成像、结构化照明、重构算法和深度学习预测的结合实现了荧光显微镜的空间和时间分辨率的提高,从衍射有限的输入图像生成超分辨率图像。
- Yicong吴
- ,(汉
- &哈里钱币兑换商
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|开放获取基于3366个基因组测序的鹰嘴豆遗传变异图谱
对3171份栽培鹰嘴豆和195份野生鹰嘴豆的全基因组测序用于构建鹰嘴豆泛基因组,为鹰嘴豆进化提供洞察,并制定可提高作物产量的育种策略。
- Rajeev K. Varshney
- ,Manish Roorkiwal
- &鑫刘
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AKIRIN2控制脊椎动物蛋白酶体的核导入
利用时间控制的CRISPR屏幕,作者确定AKIRIN2是参与蛋白酶体核导入的一个因素。
- 梅兰妮·德·阿尔梅达
- ,马提亚Hinterndorfer
- &约翰内斯Zuber
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变构扰动对模型分子开关的系统级效应
GTPase开关蛋白Gsp1(人RAN的酵母同源物)的界面突变会变构影响开关周期的动力学,揭示了多特异性的系统级机制。
- 蒂娜Perica
- ,克里斯托弗·j·p·马蒂
- &挚友Kortemme
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文章
|开放获取细胞环境塑造了核孔的复杂结构
细胞核孔复合体在其细胞环境中的结构揭示了一个明显扩张的中央通道,表明其核质环和细胞质环限制了通道的尺寸,并在内环处造成膜的不对称。
- 安东尼·p·舒勒
- ,马提亚Wojtynek
- &托马斯·施瓦茨
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|开放获取利用MERFISH对小鼠初级运动皮层的空间分辨细胞图谱
作为BICCN联盟的一部分,作者使用单细胞转录组成像方法生成了小鼠初级运动皮层细胞类型的高度定义图谱。
- 孟张
- ,Stephen W. Eichhorn
- &晓伟壮族
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使用等离子体活性显微镜载片进行比色组织学
通过使用表面等离子激元(其性质取决于样品的介电常数)将颜色对比添加到未染色的组织学样品中。
- Eugeniu巴拉乌尔龙
- ,桑德拉·奥图尔
- &布莱恩修道院
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|开放获取Kv4通道络合物门控调制的结构基础
电压门控钾通道Kv4.2单独和与辅助亚基(DPP6S和/或KChIP1)复合的冷冻电子显微镜结构揭示了这两种不同亚基在调节通道活性方面的不同机制。
- 义明Kise
- ,Kasuya去
- &Osamu Nureki
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单细胞Ribo-seq揭示细胞周期依赖性翻译暂停
在单密码子分辨率下,单细胞的高灵敏度核糖体谱分析能够识别单个细胞中不同的细胞周期依赖的翻译动态状态。
- 迈克尔VanInsberghe
- ,范登伯格
- &亚历山大·范·奥德纳登
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极性氧代谢组揭示了4-羟基曼德拉酸CoQ10的合成途径
18O2标记用于识别人类细胞中含有气态氧的代谢物,包括4-羟基曼德拉酸盐,辅酶Q10头基合成的中间体。
- 罗伯特·s·班
- ,Esther S. Kim
- &迈克尔·e·帕科德
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文章
|开放获取人类蛋白质组的高度精确的蛋白质结构预测
AlphaFold被用来预测人类蛋白质组中几乎所有蛋白质的结构——高置信度预测结构的可用性可以从结构的角度开启新的研究途径。
- 凯瑟琳Tunyasuvunakool
- ,乔纳斯·阿德勒
- &黛米斯。
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肠道微生物组的代谢组学管道
以微生物为中心的代谢组学管道和交互代谢组学配置文件explorer是表征肠道微生物及其宿主之间的相互作用的强大工具。
- 说汉
- ,威尔·范·崔伦
- &Justin L. Sonnenburg
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重型COVID-19患者的脑和脉络膜丛细胞类型失调
来自COVID-19患者额叶皮层和脉络膜丛样本的单核转录组揭示了与人类神经退行性疾病和慢性大脑疾病相关的病理细胞状态。
- Andrew C. Yang
- ,费边Kern
- &托尼Wyss-Coray
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文章|
Spo11通过协同切割拓扑应力点产生缺口
酵母中的减数分裂重组不仅是由单个断裂位点启动的,还由紧密间隔的依赖于spo11的双链DNA断裂造成染色体间隙。
- 西尔维亚Prieler
- ,陈明
- &弗朗茨·克莱因
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文章|
造血干细胞的碱基编辑挽救小鼠镰状细胞病
定制的腺嘌呤碱基编辑器可以将导致镰状细胞病的β-珠蛋白基因变体编辑成人类和小鼠细胞中的非致病性变体,并将编辑过的细胞移植到小鼠中挽救了镰状细胞病。
- 格雷戈里·a·纽比
- ,乔纳森·s·严
- &David R. Liu
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体内CRISPR碱基编辑PCSK9持久降低灵长类动物的胆固醇
在食蟹猕猴模型中,在脂质纳米颗粒中传递的CRISPR碱基编辑器被证明可以有效和稳定地敲除PCSK9降低血液中PCSK9和低密度脂蛋白胆固醇的水平。
- Kiran Musunuru
- ,Alexandra C. Chadwick
- &Sekar Kathiresan
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不同的裂变标志预示着线粒体降解或生物发生
在细胞器外围的线粒体裂变产生小的子线粒体,这些子线粒体被自噬去除,而在中部的裂变导致增殖。
- Tatjana Kleele
- ,蒂莫·雷伊
- &Suliana曼利
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活动,新陈代谢和行为的耦合果蝇大脑
双光子显微镜通过苍蝇的大脑使用传感器,允许同时测量神经活动和代谢通量,揭示了神经活动和能量代谢的全局和局部协调。
- 凯文·曼
- ,Stephane否认
- &托马斯·r·克兰迪宁
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文章
|开放获取生长素的直接可视化生物传感器
一种用于植物生长素分布定量可视化的基因编码传感器能够实时监测其被单个细胞和细胞间隔内的吸收和清除。
- Ole Herud-Sikimić
- ,安德烈·c·斯蒂尔
- &Gerd更加与众不同
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黑色素瘤中细菌来源的hla结合肽的鉴定
HLA肽组分析确定了在黑色素瘤HLA- i和HLA- ii分子上出现的周期性细胞内细菌衍生肽,揭示了细菌如何调节免疫功能和对癌症治疗的反应。
- 雪莱Kalaora
- ,Adi纳格尔
- &Yardena塞缪尔