生物标记物

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    一项跨祖先的全基因组关联研究荟萃分析在89个(61个新的)独立位点上确定了中风及其亚型的关联信号,揭示了推测的因果基因,突出了F11、KLKB1、PROC、GP1BA、LAMC2和VCAM1作为潜在的药物靶点,并提供了跨祖先的综合风险预测。

    • Aniket Mishra
    • Rainer马利克
    • 斯蒂芬妮Debette
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    当基因组改变被分类为I/II级(根据ESCAT)时,与基因组匹配的靶向治疗可提高无进展生存期,因此,基因组学应由转移性乳腺癌患者的靶点可动性驱动。

    • 法布里斯安德烈
    • 托马斯Filleron
    • 伊凡Bieche
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    对孕妇血液样本中循环无细胞RNA (cfRNA)的分析确定了基因表达的变化,可用于液体活检测试,以识别和监测有先兆子痫风险的个体。

    • Mira N. Moufarrej
    • Sevahn K. Vorperian
    • 斯蒂芬·r·奎克
  • 的角度来看|

    狗狗衰老项目是一项开放数据的社区科学研究,旨在确定与犬类健康寿命相关的遗传、环境和生活方式因素,产生可以很容易地转化为人类衰老的知识。

    • 凯特·e·克里维
    • 约书亚·m·阿基
    • 本杰明·威尔方
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    来自MetaCardis队列的2173个个体的分析量化了一系列药物对宿主健康、代谢组和肠道微生物组在心脏代谢性疾病中的个体和组合影响。

    • 索菲亚·k·福斯隆德
    • 裂缝Chakaroun
    • 博克同行
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    一种基于全外显子组测序数据的可靠、经济的技术可用于描述免疫浸润,将这些浸润的程度与肿瘤中的体细胞变化联系起来,并能够预测肿瘤对免疫检查点抑制治疗的反应。

    • 罗伯特•边沁
    • 凯文Litchfield
    • 尼古拉斯印度
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    作者报告了一项尿路上皮癌免疫治疗临床试验中循环肿瘤DNA的前瞻性探索性分析。

    • 托马斯Powles
    • 佐伊·琼·阿萨夫
    • (Sanjeev Mariathasan
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    蜂群学习是一种去中心化的机器学习方法,在保持机密性和隐私的同时,优于在单个站点为COVID-19和其他疾病开发的分类器。

    • 斯蒂芬妮Warnat-Herresthal
    • 哈特穆特•舒尔茨
    • 约阿希姆·l·舒尔茨
  • 的角度来看|

    LifeTime倡议是一项雄心勃勃的多学科计划,旨在通过跟踪疾病过程中的单个人类细胞和对治疗的反应来改善医疗保健,以便在欧洲开发和实施基于细胞的拦截医学。

    • 尼古拉斯Rajewsky
    • 吉纳维芙Almouzni
    • Frauke氧化锌碘仿糊
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    作者发现肝脏NADH/NAD升高+比率作为一种潜在的代谢参数,是由人类遗传变异形成的,并对关键代谢性状和疾病有因果关系。

    • 罗素·p·古德曼
    • 安德鲁·l·马克哈德
    • Vamsi K. Mootha
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    在超过1万名癌症患者的组织和血液样本中检测到微生物核酸,并使用机器学习表明,这些核酸可用于区分不同类型的癌症,这表明了一种新的基于微生物组的诊断方法。

    • 格雷戈里·d·普尔
    • Evguenia Kopylova
    • Rob骑士
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    蛋白质错误折叠循环扩增(Protein misfolding cyclic amplification, PMCA)技术可以根据脑脊液中α-synuclein聚集物的特征,区分帕金森病患者和多系统萎缩患者。

    • 穆罕默德Shahnawaz
    • Abhisek穆克吉
    • 克劳迪奥·索托
  • 文章|

    几组接受免疫检查点阻断治疗的患者的多组学分析强调了B细胞和三级淋巴样结构在促进治疗反应中的存在和潜在作用。

    • Beth A. Helmink
    • Sangeetha M. Reddy
    • 詹妮弗·a·沃戈
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    软组织肉瘤肿瘤微环境的免疫分析确定了一组具有高水平b细胞浸润和三级淋巴样结构的患者,这些患者对免疫检查点封锁治疗有改善的生存率和高应答率。

    • 弗洛伦特·Petitprez
    • Aurélien de Reyniès
    • 沃尔夫·h·弗里德曼
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    一种预测急性肾损伤风险的深度学习方法可能有助于在时间窗口内识别健康恶化风险的患者,从而实现早期治疗。

    • 托马Nenadš电动车
    • 泽维尔Glorot
    • Shakir穆罕默德
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    从患有和未患有前驱糖尿病的个体样本中,对转录组、代谢组、细胞因子和蛋白质组以及微生物组的变化进行深入分析,揭示了个体间的差异性以及微生物组变化与其他因素之间的关联。

    • 正为温榆周
    • Reza Sailani先生
    • 迈克尔·斯奈德
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    在一期试验中,针对未突变肿瘤抗原和新表位的高度个体化肽疫苗在CD8中引起持续反应+和CD4+T细胞,分别在新诊断的胶质母细胞瘤患者中。

    • 诺伯特自己
    • 塞布丽娜Kuttruff-Coqui
    • 沃尔夫冈•维克
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    急性髓系白血病患者的样本分析表明,药物反应与突变状态和基因表达相关;生成的数据集为该疾病的未来临床和功能研究提供了基础。

    • 杰弗里·w·泰纳
    • 克里斯蒂娜·e·托尼翁
    • 布莱恩·j·德鲁克
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    利用血液样本中的遗传信息,可以在诊断前数年识别出患急性髓系白血病的高风险个体。

    • Sagi阿贝尔森
    • 恩典Collord
    • 丽然I.嘘嘘
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    microRNAs miR-221和miR-222在脂多糖耐受性的发展过程中调控巨噬细胞的重编程,这些microRNAs的表达增加与脓毒症患者的免疫抑制和预后不良有关。

    • 约翰·j·瑟雷
    • 丽贝卡·g·贝克
    • Sankar Ghosh
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    对914名儿童、青少年和年轻人的基因组进行分析,提供了一系列常见儿童癌症基因组改变的全面资源。

    • Susanne N. Gröbner
    • 芭芭拉c最差
    • 斯特凡·m·菲斯特
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    在人类中,TGFβ信号通路与免疫排斥肿瘤的免疫治疗缺乏反应有关;在这种免疫表型的小鼠模型中,只有当检查点抑制与TGFβ信号通路抑制相结合时,才能观察到T细胞的强大肿瘤浸润和肿瘤消退。

    • (Sanjeev Mariathasan
    • Shannon J. Turley
    • 托马斯Powles
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    早期非小细胞肺癌中的循环肿瘤DNA分析可用于跟踪血浆中的单核苷酸变异,以预测肺癌复发并识别参与转移过程的肿瘤亚克隆。

    • 克里斯托弗Abbosh
    • 尼古拉·j·伯克巴克
    • 查尔斯Swanton
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    在24个月时被诊断为自闭症的高风险婴儿中,6-12个月时的表面积扩张预示着大脑的过度生长,而第一年的皮质特征可以预测个体的诊断结果。

    • 希瑟·科迪·哈兹利特
    • 王宏斌顾
    • 顾芯
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    局部非无痛性前列腺癌的基因组分析确定了可预测复发的复发异常,并强调了早期前列腺癌和转移性去势抵抗疾病之间的差异。

    • 迈克尔·弗雷泽
    • Veronica Y. Sabelnykova
    • 保罗·c·布特罗斯
  • 简短的沟通|

    • Zhaleh Safikhani
    • Nehme El-Hachem
    • 本杰明Haibe-Kains
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    在缺血小鼠模型中,星形胶质细胞释放的线粒体颗粒被相邻神经元吸收,导致细胞生存信号增强;这种释放机制的破坏导致神经系统结果恶化。

    • Kazuhide Hayakawa
    • Elga埃斯波西托
    • 卢英辉
  • 简短的沟通|

    • 南秦
    • 艾曼纽·勒夏特列
    • Dusko Ehrlich
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    Glypican-1识别癌症外泌体,并作为检测早期胰腺癌患者和疾病小鼠模型的生物标志物;这些发现可能使早期和非侵入性识别和预防恶性癌症成为可能。

    • 索尼娅·a·梅罗
    • Linda B. Luecke
    • 拉Kalluri
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    许多因素被认为是造成酗酒风险的因素,但很难量化它们的影响;在这里,一项对大量青少年样本的纵向研究和机器学习被用来生成当前和未来酗酒的预测因子模型,评估许多因素的相对贡献,包括生命史、个体性格差异、大脑结构和基因型。

    • 罗伯特·惠兰
    • 理查德·瓦茨
    • Veronika Ziesch。
  • 文章
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    本文报道了作为癌症基因组图谱项目的一部分,在DNA、RNA和蛋白质水平上对尿路上皮性膀胱癌进行的整合分子分析;在32个基因中发现了周期性突变,包括细胞周期调节、染色质调节和激酶信号通路;染色质调节基因在尿路上皮癌中的突变频率高于目前所研究的任何其他常见癌症。

    • 约翰·韦恩斯坦
    • Rehan Akbani
    • 格雷格等
  • 的角度来看
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    讨论了用于指导临床试验中患者治疗的高通量“组学”检测准备就绪的标准清单;该检查表由美国国家癌症研究所与其他具有相关专业知识的科学家合作开发,提供了一个评估测试证据强度的框架,并概述了在临床环境中使用该测试之前需要考虑的实际问题,目的是避免在临床试验中过早推进基于组学的测试。

    • 丽莎·m·麦克沙恩
    • Margaret M. Cavenagh
    • 芭芭拉·a·康利
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    探索他汀类药物暴露和基因变异对基因表达的相互作用顺式eQTL与基因的表达有差异相关GATM该基因编码一种参与肌酸合成的限速酶,与他汀类药物治疗的主要不良反应——他汀类药物诱发肌病的发生率相关。

    • Lara M. Mangravite
    • 芭芭拉e恩格尔哈特
    • 罗纳德·m·克劳斯
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    在人类和猕猴中,牙釉质中钡的模式被证明是哺乳的可靠标记;此外,对尼安德特人儿童牙齿的研究揭示了这个已灭绝物种的断奶过程。

    • 克里斯汀·奥斯丁
    • 谭雅·m·史密斯
    • Manish Arora
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    《癌细胞系百科全书》首次展示了使用24种抗癌药物对大约947种癌细胞系进行大规模筛选的结果,目的是确定与对潜在治疗药物的选择性敏感性或耐药性相关的特定基因组改变和基因表达谱。

    • 乔迪Barretina
    • 佐丹奴Caponigro
    • Levi A. Garraway