癌症遗传学

利用来自628388名个体的外显子组序列数据，在40208名潜力不确定的克隆造血携带者中鉴定出24个风险位点，并将其与COVID-19、心血管疾病和癌症等其他疾病联系起来。

在小鼠中，p53失活使恶性进化通过有序和可预测的模式进行Trp53杂合性的丧失，缺失的积累，基因组加倍和增益和扩增的出现。

在92%的弥漫性大B细胞淋巴瘤样本中，活性超增强子高度特异性地高突变，并显示激活诱导的胞苷脱氨酶活性特征，导致编码B细胞发育调节因子和癌基因的基因失调。

pou2f4 - oca - t复合物是簇状细胞身份的主要调节因子，也是簇状细胞样小细胞肺癌的突出分子易感因子。

翻译上的沉默喀斯特^G60G该基因突变阻止了隐性剪接供体位点的形成并使KRAS(Q61K)表达，揭示了Q61K基因的脆弱性拉^Q61以突变选择的方式进行治疗的癌症。

通过对30种癌症类型的聚集取代和插入的分析，可以深入了解APOBEC3通过其在染色体外DNA上的活性引起聚集突变事件的作用。

染色体外DNA (ecDNA)聚集在称为ecDNA枢纽的集群中，促进基因调控区域之间的分子间相互作用，从而放大致癌基因的表达，如MYC在癌细胞系中。

整合多组学数据集，以生成统一的、临床知情的脑膜瘤分子分类。

对728名子宫平滑肌瘤(子宫肌瘤)患者的样本和公开数据的分析表明，SRCAP组蛋白负载复合物基因的体细胞和种系突变与这种情况有关。

在体外和体内小鼠模型中，EGFR抑制和lenvatinib治疗肝癌细胞具有强大的抗增殖作用，lenvatinib联合吉非替尼治疗12例晚期肝癌患者产生了有意义的临床反应。

在白血病中发现的NUP98-HOXA9致癌融合蛋白在细胞核中经历相分离，这有助于促进白血病基因的激活并建立异常染色质环。

在用免疫检查点封锁治疗的小鼠肿瘤模型中，染色质调节器的CRISPR-Cas9筛选确定SETDB1是一种抑制肿瘤固有免疫原性的表观遗传检查点蛋白。

HLA多肽分析鉴定了黑色素瘤中HLA- i和HLA- ii分子上反复出现的细胞内细菌来源的多肽，揭示了细菌如何调节免疫功能和对癌症治疗的反应。

非整倍体癌细胞系对纺锤体组装复合物(SAC)的依赖性增强;最初它们对SAC扰动有抵抗力，但随着时间的推移，它们积累染色体畸变，损害了它们的适应性。

经历了全基因组加倍的癌细胞比接近二倍体的癌细胞更依赖dna复制因子、纺锤体组装检查点和有丝分裂运动蛋白KIF18A。

组蛋白H1的突变诱导染色质结构重构到更宽松的状态，通过组蛋白修饰和干细胞基因表达的改变导致恶性转化。

目前的结果来自正在进行的国家肺基质试验，这是一项治疗非小细胞肺癌的伞状试验，根据患者的肿瘤基因型对其进行分类，并与靶向治疗药物进行匹配。

肿瘤中升高的代谢物抑制赖氨酸去甲基化酶KDM4B，导致组蛋白3赖氨酸9的异常高甲基化和同源依赖的DNA修复减少。

来自人类肠道细胞的类器官，与携带遗传毒性的细菌共同培养繁荣正义党⁺胰岛出现了与结直肠癌相关的明显突变特征。

对涵盖大多数癌症类型的4,645个全基因组和19,184个外显子组序列的描述，确定了81个单碱基取代、双碱基取代和小插入-删除突变签名，提供了有助于癌症发展的突变过程的系统概述。

组蛋白乙酰化阅读蛋白ENL在一种儿科肾癌中发生突变，以这种方式聚集在靶基因上，增加转录机制的募集，增强转录，并在发育过程中解除对细胞命运的调控。

对具有多层玫瑰花结的胚胎肿瘤的原发和复发样本的分析，为这种致命疾病的发展和治疗提供了分子机制的基础。

成像和测序方法相结合表明，癌症中的染色体外DNA (ecDNA)是圆形的，具有独特的染色质结构，可放大癌基因的输出。

CDC7抑制选择性诱导肝癌细胞衰老TP53突变，这使得这些衰老细胞的选择性凋亡细胞死亡使用mTOR信号抑制剂。

在药物再发现方案试验中，215名癌症患者接受了批准标签之外的抗癌药物治疗，其中34%的患者获得了临床获益。

CTCF旁基BORIS在转录重编程的对靶向治疗有抗性的成神经细胞瘤细胞中上调，其中它促进了调节染色质相互作用，维持抗性表型。

全面的基因组分析和机制研究揭示了三种结构、功能和临床类型的激活FOXA1前列腺癌的突变和位点重排。

DNA解旋酶WRN的缺失可诱导双链DNA断裂，选择性地促进微卫星不稳定癌症的细胞凋亡和细胞周期阻滞，表明WRN是治疗这些癌症的一个有前途的药物靶点。

对几种癌症类型中出现的错义组蛋白突变的描述，为这些突变在改变染色质结构和可能促进肿瘤发展方面的潜在作用提供了见解。

MAPK通路突变的组织细胞瘤患者的概念验证临床试验显示，MEK1和MEK2抑制剂cobimetinib治疗具有持久的反应，这表明组织细胞肿瘤依赖于MAPK信号。

作者表明，循环肿瘤细胞可以与中性粒细胞相关联，这种相互作用支持它们的增殖和播下转移的能力。

在二倍体酵母模型中对适应性突变的重复选择导致遗传不稳定性的增加，并阐明了可能有助于肿瘤发生的遗传不稳定性机制。

复制危机期间的细胞死亡涉及由端粒功能障碍引起的自噬。

生殖系乳腺癌易感基因1功能丧失变异与早发性乳腺癌和卵巢癌易感性相关;在这里，作者使用CRISPR/Cas9基因组编辑来功能评估数千个乳腺癌易感基因1以方便临床对这些变异的解释。

一项大规模基因组学研究表明，细胞起源和创始突变决定疾病亚型，并导致混合表型急性白血病中多种造血谱系定义抗原的表达。

肿瘤微环境决定了肝癌的发展类型，转化的肝细胞引起肝内胆管癌或肝细胞癌取决于它们是否被发生坏死或凋亡的细胞包围。

葡萄糖对DNA 5-羟甲基胞嘧啶的调节揭示了AMPK-TET2-5hmC轴，该轴将糖尿病与癌症联系起来。

利用血液样本中的遗传信息，可以在诊断前数年识别出患急性髓系白血病的高风险个体。

超级增强子在室管膜瘤中调控癌基因和其他分子靶点，这些基因的鉴定提供了潜在的治疗靶点。

癌细胞中DNA错配修复的失活产生动态突变谱并产生新抗原，从而改善对这些细胞的免疫监视。

关联分析确定了65个新的乳腺癌风险位点，预测了已知风险位点的靶基因，并证明了在乳腺癌中与体细胞驱动基因有很强的重叠。

对小鼠胚胎在几个发育阶段的整体重甲基化的分析确定了胚胎内胚胎外组织分区的表观遗传景观，类似于人类癌症基因组调控中频繁的全球偏离。

一项在诊断、复发和尸检时产生原位患者来源的异种移植的方案证明了将这些肿瘤用于儿科实体肿瘤的基础和转化研究的原则。

一个在活的有机体内胶质母细胞瘤的RNA干扰筛选策略能够识别胶质母细胞瘤细胞存活所需的一系列表观遗传靶点，包括转录暂停释放因子JMJD6，这可能是发现癌症新治疗靶点的有力工具。

brca1相关蛋白1 (BAP1)调节内质网中的钙通量以促进凋亡的执行，揭示了BAP1作为环境肿瘤抑制因子的新作用。

对myc驱动的小鼠淋巴瘤和人类伯基特淋巴瘤的联合研究揭示了b细胞抗原受体在控制肿瘤b细胞适应性中的重要作用在体外而且在活的有机体内这可能具有生物学和临床意义。

ENL在基因组规模的功能丧失筛查中被确定为急性白血病增殖的关键要求，是白血病基因表达所必需的，其YEATS染色质阅读域对白血病生长至关重要。

在近一半的各种组织学类型的人类癌症中发现了环状染色体外DNA，它比染色体扩增更有效地增加了驱动癌基因的拷贝数和瘤内异质性，并促进了肿瘤的进化。