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环境因素对荷兰人群肠道微生物群的影响
在一项研究中,来自2756个家庭的8208个人的肠道微生物群被表征并与241个宿主和环境因素相关,确定了不同疾病中共享的微生物组模式,并表明微生物组在很大程度上是由环境和同居形成的。
- r . Gacesa
- ,答:Kurilshikov
- &r·k·威尔斯玛
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|开放获取乳腺癌治疗反应的多组学机器学习预测器
在使用机器学习的预测模型中整合治疗前的肿瘤特征,可以告知对治疗的反应。
- Stephen-John Sammut
- ,Mireia Crispin-Ortuzar
- &卡洛斯卡尔达斯
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融合蛋白质图像和相互作用的细胞结构的多比例尺地图
蛋白质免疫荧光成像和亲和纯化-质谱结合起来,创建了跨尺度的人类细胞结构的统一地图,作者称之为多尺度集成细胞(MuSIC)。
- 秦越
- ,爱德华·l·赫特林
- &特雷Ideker
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|开放获取细胞类型的特化是由特定的染色质拓扑结构编码的
一种名为immunoGAM的新技术,将基因组结构定位(GAM)与免疫选择结合起来,能够在小鼠脑组织的特定细胞群中发现与基因表达相关的特化染色质构象。
- 沃伦Winick-Ng
- ,亚历山大Kukalev
- &安娜Pombo
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|开放获取扩充了人类和小鼠基因组中DNA元素的百科全书
作者总结了DNA元素百科全书(ENCODE)项目第三阶段产生的数据,该项目是更好地理解人类和小鼠基因组的资源。
- 费德里科•Abascal
- ,雷耶斯Acosta
- &挚萍翁
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|开放获取人DNase I超敏位点的指数和生物学谱
来自733个人类生物样本的DNase I高分辨率地图被用于识别和索引人类基因组中的调控DNA。
- Wouter Meuleman
- ,亚历山大·穆拉托夫
- &约翰Stamatoyannopoulos
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人类二元蛋白质相互作用组的参考图
人类二元蛋白质相互作用组图,包括大约53000种蛋白质-蛋白质相互作用,涉及8000多种蛋白质,为研究人类细胞在健康和疾病中的功能提供了参考。
- 是运气
- ,Dae-Kyum金
- &迈克尔·a·卡尔德伍德
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核孔复合体的综合结构和功能解剖
酵母核孔复合体的结构,使用结合了广泛数据的综合方法在亚纳米精度下确定,揭示了其结构、运输机制和进化起源的细节。
- 金承中
- ,哈维尔Fernandez-Martinez
- &迈克尔·p·鲁特
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信
|开放获取罕见变异对跨组织基因表达的影响
作者表明,罕见的遗传变异有助于在不同的人类组织中产生巨大的基因表达变化,并为解释个体基因组中的罕见变异提供了一种综合方法。
- 鑫李
- ,Yungil金
- &史蒂芬·b·蒙哥马利
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季节性流感病毒的全球传播模式因抗原漂移而异
对12年期间人类季节性流感病毒的9000多个血凝素序列的分析表明,a /H1N1和B病毒的全球循环模式不同于特征明显的a /H3N2病毒;特别是A/H1N1病毒和B病毒显示在几个季节在局部持续存在,不像H3N2病毒那样显示出相同程度的全球移动。
- 特雷弗贝德福德
- ,史蒂文•莱利
- &科林·a·拉塞尔
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|开放获取111个参考人类表观基因组的综合分析
这项研究描述了111个参考人类表观基因组的综合分析,组蛋白修饰模式,DNA可及性,DNA甲基化和RNA表达;这些结果说明了不同组织和细胞类型中的候选调控元件,它们的候选调控元件,以及它们显示出遗传变异富集的一组人类特征,为解释人类疾病的分子基础提供了资源。
- Anshul Kundaje
- ,Wouter Meuleman
- &Manolis >
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信
|开放获取拓扑关联域是复制时序调控的稳定单元
一项对小鼠和人类细胞DNA复制时间的研究表明,复制域(基因组中同时复制的域)与拓扑关联域具有相关性;这些结果将细胞类型特异性亚核区隔化与发育稳定的染色体结构域相协调,并为大规模染色体结构和功能提供了统一的模型。
- 本杰明·d·波普
- ,泰隆Ryba
- &大卫·m·吉尔伯特
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|开放获取多样性和动态性果蝇转录组
大规模的转录组分析黑腹果蝇跨组织、细胞类型和条件,提供了转录起始、剪接、多聚腺苷酸化和非编码RNA表达的全球模式和多样性的见解。
- 詹姆斯·布朗
- ,内森博伊尔
- &Susan E. Celniker
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|开放获取尿路上皮性膀胱癌的综合分子特征
本文报道了作为癌症基因组图谱项目的一部分,在DNA、RNA和蛋白质水平上对尿路上皮性膀胱癌进行的整合分子分析;在32个基因中发现了周期性突变,包括细胞周期调节、染色质调节和激酶信号通路;染色质调节基因在尿路上皮癌中的突变频率高于目前所研究的任何其他常见癌症。
- 约翰·韦恩斯坦
- ,Rehan Akbani
- &格雷格等
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|开放获取透明细胞肾细胞癌的综合分子特征
癌症基因组图谱研究网络报告了一项基于基因组、DNA甲基化、RNA和蛋白质组学特征的400多个透明细胞肾细胞癌样本的综合分析;在PI(3)K/AKT通路中发现了频繁的突变,这表明该通路可能是一个潜在的治疗靶点,研究结果也证明了代谢重塑与肿瘤分期和严重程度相关。
- 查德·j·克莱顿
- ,玛格丽特·摩根
- &海蒂·j·索菲亚。