数据集成

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    心肌梗死后人类心脏重构的时间分辨高分辨率地图,整合了单细胞转录组、染色质可及性和空间转录组数据,为该领域提供了有价值的资源。

    • Christoph Kuppe
    • 里卡多·o·拉米雷斯·弗洛雷斯
    • 拉斐尔Kramann
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    在一项研究中,来自2756个家庭的8208个人的肠道微生物群被表征并与241个宿主和环境因素相关,确定了不同疾病中共享的微生物组模式,并表明微生物组在很大程度上是由环境和同居形成的。

    • r . Gacesa
    • 答:Kurilshikov
    • r·k·威尔斯玛
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    一种名为immunoGAM的新技术,将基因组结构定位(GAM)与免疫选择结合起来,能够在小鼠脑组织的特定细胞群中发现与基因表达相关的特化染色质构象。

    • 沃伦Winick-Ng
    • 亚历山大Kukalev
    • 安娜Pombo
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    来自733个人类生物样本的DNase I高分辨率地图被用于识别和索引人类基因组中的调控DNA。

    • Wouter Meuleman
    • 亚历山大·穆拉托夫
    • 约翰Stamatoyannopoulos
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    人类二元蛋白质相互作用组图,包括大约53000种蛋白质-蛋白质相互作用,涉及8000多种蛋白质,为研究人类细胞在健康和疾病中的功能提供了参考。

    • 是运气
    • Dae-Kyum金
    • 迈克尔·a·卡尔德伍德
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    通过对27种癌症中1188种肿瘤的转录组和全基因组测序数据的综合分析,提供了癌症中rna水平变化的全面目录。

    • 克劳迪娅花茎甘蓝
    • 娜塔莉·r·戴维森
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    酵母核孔复合体的结构,使用结合了广泛数据的综合方法在亚纳米精度下确定,揭示了其结构、运输机制和进化起源的细节。

    • 金承中
    • 哈维尔Fernandez-Martinez
    • 迈克尔·p·鲁特

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    作者表明,罕见的遗传变异有助于在不同的人类组织中产生巨大的基因表达变化,并为解释个体基因组中的罕见变异提供了一种综合方法。

    • 鑫李
    • Yungil金
    • 史蒂芬·b·蒙哥马利
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    对12年期间人类季节性流感病毒的9000多个血凝素序列的分析表明,a /H1N1和B病毒的全球循环模式不同于特征明显的a /H3N2病毒;特别是A/H1N1病毒和B病毒显示在几个季节在局部持续存在,不像H3N2病毒那样显示出相同程度的全球移动。

    • 特雷弗贝德福德
    • 史蒂文•莱利
    • 科林·a·拉塞尔
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    这项研究描述了111个参考人类表观基因组的综合分析,组蛋白修饰模式,DNA可及性,DNA甲基化和RNA表达;这些结果说明了不同组织和细胞类型中的候选调控元件,它们的候选调控元件,以及它们显示出遗传变异富集的一组人类特征,为解释人类疾病的分子基础提供了资源。

    • Anshul Kundaje
    • Wouter Meuleman
    • Manolis >

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    一项对小鼠和人类细胞DNA复制时间的研究表明,复制域(基因组中同时复制的域)与拓扑关联域具有相关性;这些结果将细胞类型特异性亚核区隔化与发育稳定的染色体结构域相协调,并为大规模染色体结构和功能提供了统一的模型。

    • 本杰明·d·波普
    • 泰隆Ryba
    • 大卫·m·吉尔伯特
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    大规模的转录组分析黑腹果蝇跨组织、细胞类型和条件,提供了转录起始、剪接、多聚腺苷酸化和非编码RNA表达的全球模式和多样性的见解。

    • 詹姆斯·布朗
    • 内森博伊尔
    • Susan E. Celniker
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    本文报道了作为癌症基因组图谱项目的一部分,在DNA、RNA和蛋白质水平上对尿路上皮性膀胱癌进行的整合分子分析;在32个基因中发现了周期性突变,包括细胞周期调节、染色质调节和激酶信号通路;染色质调节基因在尿路上皮癌中的突变频率高于目前所研究的任何其他常见癌症。

    • 约翰·韦恩斯坦
    • Rehan Akbani
    • 格雷格等
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    癌症基因组图谱研究网络报告了一项基于基因组、DNA甲基化、RNA和蛋白质组学特征的400多个透明细胞肾细胞癌样本的综合分析;在PI(3)K/AKT通路中发现了频繁的突变,这表明该通路可能是一个潜在的治疗靶点,研究结果也证明了代谢重塑与肿瘤分期和严重程度相关。

    • 查德·j·克莱顿
    • 玛格丽特·摩根
    • 海蒂·j·索菲亚。