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|开放获取
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|开放获取结直肠癌中基因组和表观基因组的共同进化
一项研究通过单个腺体和邻近正常组织的空间多组学分析,以单克隆分辨率绘制原发性结直肠腺瘤和癌症的遗传和表观遗传异质性。
- 丁满海德
- ,雅各Househam
- &安德里亚Sottoriva
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|开放获取结直肠癌进化中的表型可塑性和遗传控制
在结直肠癌中,肿瘤内遗传祖先很少影响基因表达特征和亚克隆进化,大多数肿瘤内遗传变异没有检测到表型后果,而转录可塑性在肿瘤内广泛存在。
- 雅各Househam
- ,丁满海德
- &特雷弗·a·格雷厄姆
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确定促进肠道炎症的环境因素
除草剂丙酰胺会增加小肠和大肠的炎症,而AHR-NF -κB-C /EBPβ信号轴(在T细胞和树突状细胞中起作用以促进肠道炎症)是丙酰胺的靶标。
- 莉莉安娜·m·桑马可
- ,Chun-Cheih曹国伟
- &弗朗西斯科·j·金塔纳
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肠道细菌通过降解肠道尼古丁来缓解吸烟相关的NASH
吸烟过程中,尼古丁在肠道中积累,加速非酒精性脂肪性肝病向非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的发展,但它可以被人体共生体有效降解拟杆菌xylanisolvens。
- 波陈
- ,露露的太阳
- &Changtao江
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免疫基因的进化与黑死病有关
Klunk和他的同事鉴定了自然选择的特征鼠疫杆菌并证明它们对遗传多样性和对某些疾病易感性的影响。
- 詹妮弗Klunk
- ,Tauras P. Vilgalys
- &路易斯·巴雷罗
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HRG-9同源物调节血红素从富含血红素的隔间中运输
HRG-9(也称为TANGO2)是一种进化上保守的血红素伴侣,它从真核细胞的储存或合成位点运输血红素。
- Fengxiu太阳
- ,赵真真心心
- &Caiyong陈
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依赖于胶原蛋白溶解的DDR1信号通路决定胰腺癌的预后
分裂的I型胶原和完整的I型胶原对胰腺导管腺癌(PDAC)有不同的影响,通过DDR1信号介导的I型胶原重构是PDAC患者生存的预后指标。
- 华苏
- ,范杨
- &迈克尔·卡琳
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基因调控元件氧化损伤修复机制研究
核有丝分裂器蛋白NuMA通过占据转录起始位点周围的区域,结合DNA修复因子和促进损伤后的转录,帮助保护基因免受氧化损伤。
- Swagat雷
- ,Arwa A. Abugable
- &Sherif F. El-Khamisy
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|开放获取前列腺癌的非洲特异性分子分类学
前列腺癌的分子分类学揭示了在非洲和欧洲人群中发现的一种与拷贝数损失相关的亚型,预测预后较差,还有两种亚型——一种与高突变噪声相关,一种与非洲人群特有的拷贝数增加相关。
- Weerachai Jaratlerdsiri
- ,爵江
- &凡妮莎·m·海耶斯
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|开放获取特定环境下SARS-CoV-2 Delta变种的出现和增长
对来自世界各地的SARS-CoV-2基因组的分析表明,在最初主要从印度输入后,三角洲病毒在英格兰的传播首先由跨区域旅行推动,然后由当地人口混合推动。
- 约翰·t·麦克龙
- ,真实性山
- &莫里茨·u·g·克雷默
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人心肌梗死的多组学空间图
心肌梗死后人类心脏重构的时间分辨高分辨率地图,整合了单细胞转录组、染色质可及性和空间转录组数据,为该领域提供了有价值的资源。
- Christoph Kuppe
- ,里卡多·o·拉米雷斯·弗洛雷斯
- &拉斐尔Kramann
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|开放获取良性和恶性组织中空间分辨克隆拷贝数改变
从良性和恶性组织的空间转录组数据推断的拷贝数变化揭示了全器官水平的克隆结构。
- 安德鲁-埃里克森
- ,Mengxiao他
- &乔阿欣Lundeberg
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|开放获取截断FGFR2在多种癌症中是否存在临床可行的致癌基因
第18外显子的截断FGFR2(FGFR2ΔE18)在小鼠和人类中是一种强有力的驱动突变,fgfr靶向治疗应被考虑用于表达稳定的癌症患者FGFR2ΔE18变体。
- 丹尼尔Zingg
- ,Jinhyuk Bhin
- &乔斯jonker
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|开放获取DOCK2与严重COVID-19的宿主遗传学和生物学有关吗
一项全基因组关联研究强调了一种变异DOCK2这在东亚人群中很常见,但在欧洲很少见,是严重COVID-19的宿主遗传风险因素。
- 何鸿燊Namkoong
- ,Ryuya Edahiro
- &Yukinori冈田克也
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抑制ASGR1可以通过促进胆固醇排泄来降低血脂水平
抑制ASGR1可以增加胆固醇向胆汁和粪便的排泄,为降低胆固醇提供了一种独特的方法,从而为治疗心血管疾病提供了一种安全有效的方法。
- Ju-Qiong王
- ,亮亮李
- &Bao-Liang歌
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RNA编辑是常见炎症疾病的遗传风险基础
独联体-RNA编辑数量性状位点与免疫原性双链rna相关,是常见自身免疫性疾病和炎症性疾病全基因组关联研究变异的基础。
- 秦李
- ,Michael J. Gloudemans
- &金比利·李
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耐药前列腺癌的深度全基因组ctDNA年代学
对一系列血液样本和匹配的转移性组织的深度全基因组测序表明,循环肿瘤DNA分析能够对转移性人类癌症中治疗驱动的亚克隆动力学、表观基因组学和全基因组体细胞进化进行详细研究。
- 卡梅伦赫伯特
- ,马蒂·Annala
- &亚历山大·怀亚特
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ADAR1通过抑制自发的ZBP1激活来预防自身炎症
除了抑制MDA5和PKR激活的作用外,ADAR1是zpb1介导的细胞凋亡和坏死的负调节因子,为Aicardi-Goutières综合征的病理提供了见解。
- 理查德·德·罗伊
- ,西蒙Verdonck
- &乔纳森Maelfait
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|开放获取卵母细胞通过抑制复合物I维持无ros的线粒体代谢
卵母细胞通过消除复合物I重塑线粒体电子传递链来防止活性氧的产生,这一策略使它们能够长期生存。
- Aida Rodriguez-Nuevo
- ,Ariadna托雷斯
- &脉斑岩博客
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细胞-基质界面调节结肠癌干细胞的休眠
人类结直肠类器官中的遗传谱系追踪系统识别了一群在化疗期间持续存在并使癌症再生的休眠癌细胞,细胞粘附分子COL17A1在打破休眠的过程中起着关键作用。
- 雪太
- ,小松藤井裕久
- &Toshiro佐藤
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|开放获取废水测序揭示了早期神秘的SARS-CoV-2变体传播
早期发现了令人担忧的新出现的SARS-CoV-2变异,使用高分辨率废水和临床测序发现了临床基因组监测未捕捉到的多例病毒传播病例。
- Smruthi Karthikeyan
- ,约书亚·列维
- &Rob骑士
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|开放获取肾谱系因子PAX8控制肾癌的致癌信号
谱系转录因子PAX8被证明在确定透明细胞肾细胞癌的癌症风险中发挥关键作用,为基因突变如何导致特定类型的癌症提供了见解。
- Saroor A. Patel
- ,祥子Hirosue
- &萨卡里Vanharanta
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|开放获取克隆性造血的纵向动力学和自然史
一项对385名人类捐献者的长期研究报告称,驱动基因突变和年龄决定了克隆造血的终身动态
- 玛格丽特·a·法布尔
- ,José吉列尔梅·德·阿尔梅达
- &乔治·s·瓦西里欧
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炎症性肠病中生物活性微生物基因产物的发现
被称为MetaWIBELE(识别微生物组中新型生物活性元素的工作流)的计算系统被用于识别潜在生物活性并在炎症性肠病的发病机制中具有功能作用的微生物基因产物。
- Yancong张
- ,Amrisha博思勒
- &埃里克·a·弗兰佐萨
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通过深度多组学分析定义线粒体蛋白功能
描述人类线粒体蛋白质的多组学资源能够识别生物功能,并支持线粒体病理的遗传诊断。
- 贾里德·w·伦斯沃尔德
- ,Evgenia Shishkova
- &大卫·j·帕格里尼
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吉宾中胚层调节模式上皮发育
吉宾的描述,由AHDC1,提供了在Xia-Gibbs中所见的表皮和中胚层模式表型和人类相关综合征的见解,这些症状源于基因特异性DNA甲基化决定导致的异常中胚层成熟。
- 安科利尔
- ,安琪拉刘
- &安东尼·e·奥罗
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|开放获取Omicron感染增强了接种者的Delta抗体免疫力
一项量化严重急性呼吸综合征冠状病毒2变种在感染Omicron/BA的个体中的中和的研究。1shows that vaccinated individuals previously infected with Omicron have enhanced protection against reinfection with current variants, \including Omicron/BA.2, while Omicron/BA.1 infected unvaccinated individuals have limited protection.
- 岩洞里汗
- ,淀粉卡里姆
- &亚历克斯Sigal
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神经免疫心血管界面控制动脉粥样硬化
外周神经系统使用神经免疫心血管界面来组装结构动脉-脑回路,对动脉-脑回路的治疗干预可以减弱动脉粥样硬化。
- 萨拉热窝K.莫汉塔
- ,李鹏
- &Andreas J. R. Habenicht
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十种基因中罕见的编码变异赋予精神分裂症的巨大风险
全外显子组测序确定了10个与罕见的蛋白质编码变异有关的精神分裂症风险基因,其中一个子集与其他神经发育障碍的风险基因重叠。
- Tarjinder辛格
- ,蒂莫西·波特
- &马克·j·戴利
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绘制基因组位点涉及精神分裂症的基因和突触生物学
一项包括76000多名精神分裂症患者和243000多名对照组的全基因组关联研究在287个基因组位点上确定了常见的变异关联,进一步的精细定位分析强调了参与突触过程的基因的重要性。
- 瓦西里Trubetskoy
- ,安东尼奥·F. Pardiñas
- &吉姆·范·奥斯
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的角度来看|
确定SARS-CoV-2变异对免疫保护的风险
SARS-CoV-2病毒进化评估(SAVE)计划提供了对SARS-CoV-2变体的实时风险评估,评估其可能影响传播、毒性和对感染和疫苗诱导免疫的抵抗力。
- Marciela M. DeGrace
- ,Ghedin Elodie
- &Mehul S. Suthar
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肝脏亚细胞结构调节控制代谢稳态
使用增强聚焦离子束扫描电镜成像和基于深度学习的自动分割进行详细重建,表明肝细胞亚细胞细胞器结构调节代谢。
- GuneşParlakgul
- ,安娜·宝拉·阿鲁达
- &Gökhan S.霍塔马基亚
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|开放获取全基因组测序揭示COVID-19危重症的宿主因素
对7000多名重症COVID-19患者进行了全基因组测序、转录组全关联和精细作图分析,以确定与COVID-19严重疾病相关的16种独立变异。
- Athanasios Kousathanas
- ,Erola Pairo-Castineira
- &J.肯尼斯·贝利
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文章
|开放获取人类疾病中蛋白质编码变异的遗传关联
结合来自英国生物银行参与者的全外显子组测序数据和来自FinnGen参与者的估算基因型的荟萃分析,能够在罕见和低频等位基因谱中识别与人类疾病的遗传关联
- 本杰明·b·孙
- ,Mitja I. Kurki
- &海科Runz
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|开放获取双胞胎研究揭示多发性硬化症中非遗传性免疫紊乱
在多发性硬化症不一致的同卵双胞胎中,使用配对分析确定遗传易感性和环境因素的影响。
- Florian Ingelfinger
- ,丽莎·安·格德斯
- &伯克哈德比结
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文章
|开放获取T细胞对SARS-CoV-2的反应会交叉识别Omicron
T细胞对来自SARS-CoV-2 Omicron变种(B.1.1.529)的刺突蛋白的反应与接种疫苗、感染疫苗和未接种疫苗的个体对祖先、Beta (B.1.351)和Delta (B.1.617.2)刺突蛋白的反应大致相似。
- Roanne Keeton
- ,马吕斯·b·丁乔
- &凯瑟琳Riou
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评论文章|
COVID-19重症肺炎的人类遗传和免疫决定因素
COVID人类遗传研究通过寻找免疫的因果错误,检查了各种sars - cov -2相关疾病表现的分子、细胞和免疫决定因素。
- 张倩
- ,保罗的混蛋
- &Jean-Laurent卡萨诺瓦
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从系统发育推断骨髓增生性肿瘤的生活史
来自12个个体骨髓增生性肿瘤的1013个克隆造血菌落的全基因组测序揭示了造血系统发育,并表明驱动突变从生命早期开始依次获得。
- 尼古拉斯•威廉姆斯
- ,乔•李
- &Jyoti Nangalia
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文章|
自由放养白尾鹿感染SARS-CoV-2
在俄亥俄州东北部进行的测试中,超过三分之一的野鹿显示出人类感染SARS-CoV-2的证据。
- 凡妮莎·l·黑尔
- ,帕特里夏·m·丹尼斯
- &安德鲁·s·鲍曼
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文章
|开放获取对SARS-CoV-2变种Alpha的适应性增强,而不是Beta
SARS-CoV-2 α变体在体内上呼吸道复制竞争中优于前体SARS-CoV-2。
- 洛伦兹乌尔里希
- ,尼克·乔尔·哈尔
- &Charaf Benarafa
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KEYNOTE-811在HER2阳性胃癌中的双重PD-1和HER2阻断试验
一项her2阳性胃腺癌III期临床试验的中期分析显示,与单曲妥珠单抗和化疗相比,派姆单抗联合曲妥珠单抗和化疗可提高有效率。
- Yelena Y. Janjigian
- ,天皇明仁Kawazoe
- &郑玄哲
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文章
|开放获取镰状血红蛋白对疟疾的保护取决于寄生虫基因型
在大脑的三个区域之间发现了强烈的联系恶性疟原虫严重疟疾儿童的基因组和镰状血红蛋白,表明寄生虫已经适应了克服自然宿主免疫。
- Gavin乐队
- ,艾伦·m·莱弗勒
- &Dominic P. Kwiatkowski
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评论文章|
SARS-CoV-2的出现、基因组多样性和全球传播
讨论了SARS-CoV-2的潜在起源和全球传播、令人关注的SARS-CoV-2变体的出现以及基因组监测对控制COVID-19大流行的重要性。
- 胡安·李
- ,Shengjie赖
- &伟峰史
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肠道菌群调节小鼠停止吸烟后的体重增加
一项对暴露在香烟烟雾中的小鼠的研究表明,戒烟引起的体重增加与由吸烟相关代谢物驱动的生物失衡状态有关。
- Leviel Fluhr
- ,乌里亚铁道部
- &伊兰Elinav
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不具代表性的大型调查严重高估了美国的疫苗接种量
对三次COVID-19疫苗行为调查的分析表明,更大的调查过度自信地高估了疫苗的摄取量,这表明样本量越大反而会导致估计不准确。
- 瓦莱丽·c·布拉德利
- ,Shiro Kuriwaki
- &赛斯Flaxman