协议|2022年10月26日 使用H-MAGMA注释基因变异到目标基因 hi -c耦合的基因组注释多标记分析扩展了广泛使用的基因组注释多标记分析工具,通过合并染色质构象数据,可以发现与非编码变体相关的基因,将遗传变体分配到其目标基因。 南希·y·a·赛 ,布兰登·m·普拉特 &Hyejung赢得 自然的协议, 1 - 14
研究2022年10月26日|开放获取 结直肠癌基因组和表观基因组的协同进化 一项研究通过单个腺体和邻近正常组织的空间多组学分析,以单克隆分辨率绘制原发性结直肠腺瘤和癌症的遗传和表观遗传异质性。 丁满海德 ,雅各Househam &安德里亚Sottoriva 自然, 1 - 11
研究2022年10月24日|开放获取 自闭症常见和罕见遗传影响在染色体16p上的统计和功能趋同 染色体16p常见的多基因变异和影响自闭症风险的16p11.2罕见的复发性缺失与整个16p区域的基因表达减少有关,表明罕见和常见的变异效应具有功能收敛性。 丹尼尔·j·韦纳 ,Emi凌 &伊莉斯·b·罗宾逊 自然遗传学, 1 - 10
研究2022年10月22日|开放获取 染色体相关lncRNA基因的表观遗传控制对复制和稳定性至关重要 Heskett等人描述了一类长非编码rna的几个成员,称为ASARs,它们在亚克隆系之间显示出独特的表观遗传调控,对正常的DNA复制时间和人类常染色体的稳定性至关重要。 迈克尔·b·海斯克特 ,Athanasios E. Vouzas &马修·j·塞耶 自然通讯 13, 6301年
研究2022年10月20日|开放获取 非洲火山口湖慈鲷物种形成早期的表观遗传差异 两种基因的DNA甲基组分析Astatotilapia calliptera从一个大约1000年前分离的湖泊和第三个可能在大约10000年前分离的河流,显示出与生态相关基因的转录活性改变相关的表观遗传差异,尽管遗传差异水平较低。 格雷戈勒Vernaz ,艾伦·g·哈德森 &埃里克·a·米斯卡 自然生态与进化, 1 - 12
评论|2022年10月19日 腺嘌呤甲基化在RNA中的生物学作用 Boulias和Greer回顾了N6-methyladenosine (m6A)在分子、基因组和有机体水平上的RNA。他们描述了m的影响6RNA底物上的沉积,染色质结构,基因表达和基因组稳定性的表观遗传调控,以及m6A在干细胞分化,神经发生和免疫中的作用。 Konstantinos Boulias &埃里克·利伯曼·格里尔 《自然评论》遗传学,队
新闻和观点|2022年9月7日 当RNA甲基化与DNA甲基化相遇 在这一期中,邓和他的同事们展示了RNA m6修饰解读器FXR1将DNA 5-甲基胞嘧啶双加氧酶TET1引入基因组区域,以去甲基化DNA,这突出了染色质中RNA甲基化和DNA甲基化之间的串扰。 麒徐 &Hongjie沈 自然遗传学 54, 1261 - 1262
新闻和观点|2022年8月8日 调控序列如何学习细胞表征 卷积神经网络是一种新的计算方法独联体-调控序列分析,分析和聚类scATAC-seq数据。 斯坦Aerts 自然方法 19, 1041 - 1043
新闻和观点|2022年7月21日 内源性逆转录病毒引导转录凝析物远离多能性 内源性逆转录病毒沉默在哺乳动物发育过程中的影响尚不清楚。一项新的研究表明,它们在多能细胞中的异常重新激活,通过扰乱与超级增强子功能相关的转录冷凝物,破坏了关键的基因调节网络。 爱德华·j·格鲁 自然遗传学 54, 1068 - 1069