研究12月16日|开放获取 Pan-kinome的军团菌通过生物信息学调查扩展 玛丽安娜Krysiń斯卡 ,Bartosz巴拉诺维斯基 &Marcin Gradowski 科学报告 12, 21782年
研究12月2日|开放获取 protein - peptide Turnover Profiling揭示了蛋白成熟过程中PTM的添加和去除顺序 代谢标记常用于测量蛋白质周转。在这里,作者表明,对于互转换蛋白物种,如磷酸型,代谢标记不能提供关于周转差异的信息,但修饰的相对顺序可以确定观察到的动态。 亨里克·M. Hammarén ,生产Geissen &米哈伊尔·m·萨维茨基 自然通讯 13, 7431年
研究2022年10月22日|开放获取 在多个序列比对上训练的蛋白质语言模型学习系统发育关系 蛋白质语言模型以多个序列比对为输入捕获蛋白质结构和突变效应。在这里,作者表明这些模型也编码了系统发育关系,并且可以从系统发育关系中分离出由于结构约束造成的相关性。 Umberto卢波 ,达米亚Sgarbossa &Anne-Florence Bitbol 自然通讯 13, 6298年
研究9月22日|开放获取 大量注释细菌l-天冬酰胺酶揭示了它们令人困惑的分布和频繁的基因转移事件 Andrzej Zielezinski ,乔安娜·i·洛克 &科学家们Jaskolski 科学报告 12, 15797年
研究|2022年8月29日 US-align:蛋白质、核酸和大分子复合物的通用结构排列 US-align是一种用于蛋白质、RNA和DNA分子的单体和寡聚体结构比对的通用协议,建立在统一TM-score目标函数和启发式迭代搜索算法的耦合基础上。 诚张 ,摩根发光 &杨张 自然方法 19, 1109 - 1115
新闻及观点|2021年12月9日 新测序生物的组合视图 新测序的生物对蛋白质功能预测提出了挑战,因为它们缺乏实验特征。网络传播方法将功能网络关系与蛋白质注释集成在一起,从经过充分研究的生物体转移,产生了可能的蛋白质功能的更完整的图像。 张迎迎 ,Shayne D. Wierbowski &海原余 自然机器智能 3., 1011 - 1012
新闻及观点|2021年1月14日 基于深度学习的β淀粉样蛋白动力学 表征β淀粉样肽的聚集对于更好地了解阿尔茨海默病和寻找药物开发的潜在靶点至关重要。深度神经网络使得描述这种肽的动力学成为可能,为实现这一目标开辟了道路。 Fanjie孟 &海成忠 自然计算科学 1, 20日至21日
新闻及观点|4月11日 胺脱氢酶在自然界中存在 用于还原性胺化的工程胺脱氢酶的多样性仍然有限。现在,天然的氨基脱氢酶提供了不同的序列空间和催化特性,增强和拓宽了生物催化工具箱。 Andreas S. Bommarius 催化性质 2, 288 - 289
新闻及观点|2018年6月15日 重新定义系统性红斑狼疮- smarart蛋白质组学 由于系统性红斑狼疮(SLE)的诊断和治疗具有挑战性,基于生物标志物数据重新分类SLE提供了新的见解。为了将这些新的分析框架转化为实时临床应用,需要对抗核抗体的定义和对smarart标准(特异性-敏感性、可测量性、可操作性、附加值、现实性、滴度、及时性)的关注。 马文·j·弗里茨勒 &迈克尔·马勒 自然评论风湿病 14, 451 - 452