单分子生物物理

IL-25-IL-17RB-IL-17RA和IL-17A-IL-17RC-IL-17RA复合物的冷冻电镜结构显示尖端到尖端的结构，这是IL-17受体家族的一个关键组织原理。

由DNA折纸制成的纳米级旋转电机，由棘轮驱动，由外部电场提供动力，显示出给弹簧上弦的能力，并具有接近生物电机的机械性能。

使用单分子光谱和结构研究来检查eIF1A和eIF5B与人类翻译起始复合物的关联动力学，以及它们在将tRNA呈现给复合物以启动翻译中的作用。

一种结合使用光学俘获、荧光显微镜和微流体分析染色体内部结构的方法表明，染色体在响应张力时存在明显的非线性硬化。

HELQ受刺激解旋酶活性的RAD51和抑制解旋酶活性并刺激退火的RPA的差异调控。

冷冻电子显微镜和单分子荧光方法用于阐明细菌核糖体早期易位事件的机制。

直接监测单个cAMP分子与HCN离子通道的结合，揭示了离子通道异构体不同生理反应下的结合动力学。

定位算法应用于传统和高速原子力显微镜获得的数据集，以增加图像分辨率，超出尖端半径设置的限制。

利用DNA seqFISH+对小鼠胚胎干细胞3660个染色体位点进行了多重成像，并对17个染色质标记和亚核结构进行了免疫荧光，揭示了单个细胞内位点的不变组织，以及细胞亚群中异质和长寿命的独特组合染色质状态。

单分子荧光共振能量转移和荧光相关光谱实时共聚焦激光跟踪共同表征个体如何虫胶阻遏分子绕过操作位点，以微秒的时间尺度探索DNA表面。

单分子可视化显示，凝聚蛋白——一种只向一个方向挤压DNA的马达蛋白——可以遇到并通过第二个凝聚蛋白分子，形成一种新的DNA环，从两边聚集DNA。

Cas1-Cas2以长度和pam序列依赖的方式从DNA片段中选择前体预间隔体，这些前体被DnaQ外切酶切割，使其能够以正确的方向整合到CRISPR位点。

利用光镊和荧光粒子跟踪相结合的方法对Hsp100解聚物ClpB的动力学进行了分析，表明多肽环的加工挤压是其活性的机制基础。

单个MhsT转运蛋白(神经递质:钠转运蛋白家族的二级转运蛋白的成员)的底物转运成像在单次和多次周转分辨率下显示，速率限制步骤随着运输底物的身份而变化。

单分子动力学揭示了真核生物起始因子eIF5B的GTPase活性是翻译起始到延伸转变的动力学检查点。

ORBIT(基于折纸转子的成像和跟踪)用于在单分子尺度和毫秒时间分辨率上跟踪RecBCD解旋酶解开DNA和RNAP转录导致的DNA旋转。

对完整病毒上HIV-1包膜糖蛋白三聚体构象状态和先前结构研究中使用的三聚体的单分子荧光共振能量转移成像显示，后者是下游构象，而不是预先触发的构象。

动力蛋白向微管负端移动的动力由连接电机和微管的线圈柄的长度和角度控制。

基于DNA结合解旋酶的结构，提出了一种由解旋酶展开富含鸟嘌呤的DNA“四丛”的机制。

组蛋白H1和原胸腺素-α的高亲和力复合物揭示了一种意想不到的相互作用机制，其中较大的相对净电荷使两种蛋白质即使在复合物中也保持高度无序。

具有交互作用的亨廷顿蛋白复合物的结构总体分辨率为4 Å，为进一步了解该蛋白的细胞功能铺平了道路。

低温电子显微镜和单分子研究表明，适配器BICDR1和HOOK3将两个动力蛋白分子招募到动力蛋白微管马达上，从而增加动力蛋白-动力蛋白微管马达的力和速度。

单分子荧光共振能量转移被用于识别该化合物构象循环中的限速步骤和新中间体单核细胞增多性李斯特氏菌钙转运蛋白LMCA1。

G蛋白偶联受体及其G蛋白伙伴在活细胞中通过单分子成像进行研究，揭示了细胞膜上受体和G蛋白相互作用并发出信号的热点。

肿瘤抑制复合物BRCA1-BARD1在同源重组过程中促进单链DNA模板的生成，也与重组酶RAD51结合并增强其功能。

SpCas9的一个新工程版本，称为HypaCas9，显示出更高的编辑精度，而不显着损失所需目标的效率。

单分子FRET成像提供了洞察配体结合和g蛋白核苷酸结合口袋之间的变构联系β₂肾上腺素受体(β₂AR)和提高对g蛋白激活机制的理解。

单分子荧光原位进行杂交以识别肝脏中的几个标志性基因，并使用它们在单细胞RNA测序中的表达水平来空间重建所有肝脏基因的分区。

MutS和mutl是高度保守的核心蛋白，负责修复不匹配的DNA形式的序列稳定滑动夹，它们一起调节沿DNA的一维扩散，并与MutH一起促进对远处切除起始位点的搜索。

Hsp70在其凹槽中结合未折叠的蛋白质片段，但由于其可移动的盖子，也可以结合和稳定折叠的蛋白质结构，ATP水解和共同伴侣允许控制这些对比效应。

单分子分析表明，UvrA和UvrAB招募到DNA损伤上形成的Mfd-RNA聚合酶复合体，阻止了易位复合体并导致其溶解。

单分子技术的结合表明，修复蛋白XRCC4和XLF形成了异构体移动袖状复合体，可以连接和连接断裂的DNA片段。

利用超分辨率成像直接观察的三维组织果蝇在从单个基因到整个基因调控域的尺度上，作者发现转录活跃、不活跃和多梳抑制的染色质状态都有不同的空间组织。

利用酵母中高度纯化的预起始复合物(PIC)，开发了一种单分子光镊检测实时监测真核RNA聚合酶II的转录起始;观察表明，在启动过程中，在形成PIC的一部分的TFIIH解旋酶的驱动下，DNA模板中打开了一个大气泡，同时在从转录启动过渡到延伸之前合成了一个扩展的转录本。

摘要- - - - - -的怪兽终止地点大肠杆菌并不能完全有效地阻止DNA复制，大约有一半的复制体绕过了这个封锁;在这里，复制机制的速度被证明是决定的结果之间的replisome和Tus -相遇的怪兽．

smFRET被用于探测两个全长哺乳动物谷氨酸受体的激活机制，揭示了这些g蛋白偶联受体的细胞外配体结合域在三种确认(静止、激活和短暂的中间状态)之间相互转换，并且正位激动剂的功效与活跃状态的占用程度相关。

单件装配果蝇RNA诱导的沉默复合物(RISCs)使用7个纯化的蛋白质重新构建，揭示伴侣有助于稳定蛋白质异源二聚体Dicer-2-R2D2结合到短干扰RNA与Ago2的相互作用。

利用单分子FRET和x射线晶体学对人类谷氨酸转运蛋白的细菌同源物进行分析，揭示了其不同转运结构域和支架结构域之间的界面的开放是转运周期的速率决定因素。

传统上认为，在单个酶催化事件中释放的热量不会以任何方式扰动酶;然而，这里使用单分子荧光相关光谱表明，对于催化具有大反应焓的化学反应的酶，在催化过程中，蛋白质活性位点释放的热量会短暂地取代蛋白质的质量中心，本质上产生了推动酶的反坐效应。

单分子-相互作用-测序包括将DNA条形码附着在蛋白质上，在水溶液中分析这些条形码蛋白质，然后在聚丙烯酰胺膜中固定，放大和分析条形码DNA，这种方法允许精确的蛋白质定量和同时询问分子结合的亲和力和特异性。

人类atp依赖性染色质组装和重塑因子(ACF)的核小体间距机制。

为了研究信使RNA翻译过程中帧移的机制，研究人员开发了一种技术，利用Förster共振能量转移(FRET)实时监测单个分子的翻译;核糖体在框架转移位点的延伸过程中暂停的时间比平常长十倍。

利用三色荧光共振能量转移和分子动力学模拟研究了30S核糖体组装早期发生的事件;在非原生中间S4核糖体蛋白- 16s RNA结构中，S4能够改变RNA螺旋动态，促进构象变化，从而使后续蛋白质结合。

本研究定义了短DNA序列PAM对于crispr相关酶Cas9查询目标DNA至关重要——DNA融化和异双工形成在PAM附近启动，并定向扩展到剩余的目标序列，同时PAM还需要激活Cas9的催化活性。

含eIF3和丙型肝炎病毒(HCV)样内部核糖体进入位点(IRES)的40S复合体的亚纳米重建显示，IRES从40S中取代eIF3并将其隔离以获得40S亚基。

在这里，Kramers扩散系数和自由能势垒首次通过单分子荧光测量蛋白质折叠过渡路径时间的温度和粘度依赖性来表征。

谷氨酸转运体是促进神经递质从突触间隙摄取到胶质细胞和神经元细胞质的完整的膜蛋白，转运机制包括面向细胞外和面向细胞内构象的转换;在这里，作者使用单分子荧光共振能量转移成像直接观察嵌入膜中的谷氨酸转运蛋白细菌同源物三聚体的构象动力学。

细菌RecBCD解旋酶/核酸酶在单个分子的展开速率中显示出广泛的、明显静态的异质性:这里表明，在过程易位期间短暂停止一种酶允许一种变化，很可能是构象的变化，这样分子在暂停后的速度可以落在整个群体的速率谱内的任何地方。

被称为触发因子的细菌伴侣被发现可以稳定蛋白质折叠中间产物，并最终转化为原生状态，这表明伴侣在指导蛋白质折叠中起着直接作用。