标准

研究中的标准是指质量或成就的特定水平。例如,在医学研究方面,已经制定了报告标准,以确保出版物的作者报告充分理解和复制已发表的研究所必需的一切。标准还可以包括商定的命名法或标识符。

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新闻及评论

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    生物医学研究界正在大力投资生物医学云平台。云计算在解决大数据挑战和确保生物学的可重复性方面前景广阔。然而,尽管云平台有其优势,但其本身并不自动支持公平。全球对生物医学云平台开发的推动带来了新的挑战,包括平台锁定、跨平台集成困难以及用户和开发人员的重复工作。在这里,我们认为这些困难是系统性的,来自于鼓励在自给自足的平台和数据存储库而不是可互操作的微服务上进行开发的激励措施。我们认为,通过优先考虑微服务和以更小的块或汇总形式访问模块化数据,其中许多问题都可以得到缓解。我们建议,强调模块化和互操作性将导致一个更强大的类unix的web服务生态系统,用于生物医学分析和数据检索。我们向资助者、开发者和研究人员提出挑战,要求他们支持通过微服务作为下一代基于云的生物信息学来提高互操作性的愿景。

    • 内森·c·谢菲尔德
    • 维维安·r·波纳齐
    • 安德鲁·d·耶茨
    科学数据 9, 553年
  • 新闻|

    他踏上了通往组织成像的完美转化未来之路。

    • 薇薇安马克思
    自然方法 19, 261年
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    结合多通道显微镜、单细胞测序和来自正常和患病标本的其他组学数据的组织图谱即将发布,迫切需要数据和元数据标准来指导数据沉积、管理和发布。我们描述了一个关于高度复用组织成像(MITI)的最低信息标准,该标准将基因组学和其他显微镜数据开发的最佳实践应用于高度复用组织图像和传统组织学。

    • 丹尼斯·夏皮罗
    • 克拉伦斯卷边装订
    • 彼得·k·索尔杰
    自然方法 19, 262 - 267
  • 评论与观点|

    需要严格的记录保存和质量控制,以确保成像数据的质量、可重复性和价值。4DN倡议和BINA在此提出了光学显微镜元数据规范,扩展了OME数据模型,扩展了实验意图和复杂性,并使科学家能够创建成像实验的全面记录。

    • 马赛厄斯锤
    • Maximiliaan豪氏威马
    • Caterina Strambio-De-Castillia
    自然方法 18, 1427 - 1440