系统生物学

脑类器官发育的多组学图谱使用新开发的Pando框架促进了潜在基因调控网络的推断，并结合摄动实验表明，GLI3通过与HES4/5规则的相互作用控制前脑命运的建立。

不同的抗生素对表现出质的不同的细菌清除相互作用-一些对表现出相互抑制，即药物混合的功效弱于单独的药物，并且随着药物的加入，清除功效降低。

一种称为细胞状态转移评估和调节的方法使用不同的多组学数据来绘制细胞状态，模拟它们的转变，并了解控制它们的信号网络。

一种用于构建膜界、分子拥挤、成分、结构和形态复杂的合成细胞的生菌策略为制造新的合成细胞模块和增强的活/合成细胞构造提供了机会。

介绍了一种合成的细胞-细胞粘附逻辑，使用4位信息的群集大肠杆菌，使接口编程能够在大规模上结合形成通用的镶嵌模式。

在人类白细胞表面发现的蛋白质之间的相互作用的系统测量提供了免疫细胞由受体动态连接的方式的全局视图。

描述人类线粒体蛋白质的多组学资源能够识别生物功能，并支持线粒体病理的遗传诊断。

一项新的高通量实验应用于人类细胞中的1000个增强子和1000个启动子，揭示了不同类别的增强子和启动子如何控制RNA表达。

在酵母中的实验表明，内含子在诱导表型异质性中起作用，内含子介导的核糖体蛋白调节使酵母种群在营养匮乏的条件下多样化，从而具有适应性优势。

一种将深度突变扫描与基于神经网络的热力学建模相结合的方法被用于提供两个常见蛋白质域突变的能量和变构效应的全面地图。

一个研究和工程基因调控DNA序列的框架，基于大规模随机DNA文库训练的深度神经序列-表达模型，提供了对调控DNA进化、可进化性和适应性景观的深入了解。

在多发性硬化症不一致的同卵双胞胎中，使用配对分析确定遗传易感性和环境因素的影响。

SARS-CoV-2 Alpha变体比第一波SARS-CoV-2分离株更有效地抑制先天免疫反应，这是spike编码区以外的突变导致病毒先天免疫拮抗剂上调的结果。

来自MetaCardis队列的2173个个体的分析量化了一系列药物对宿主健康、代谢组和肠道微生物组在心脏代谢性疾病中的个体和组合影响。

细菌在急性应激下的特征揭示了可以使用物理老化概念模型预测的特征。

一种名为immunoGAM的新技术，将基因组结构定位(GAM)与免疫选择结合起来，能够在小鼠脑组织的特定细胞群中发现与基因表达相关的特化染色质构象。

GTPase开关蛋白Gsp1(人类RAN的酵母同源物)的界面突变变构地影响开关周期的动力学，揭示了多特异性的系统水平机制。

皮层-基底神经节-丘脑网络的中尺度连接组映射揭示了关键的结构和信息处理特征。

对15种药物与25种肠道细菌菌株之间相互作用的分析表明，细菌细胞内药物的生物积累是肠道微生物改变药物可用性和疗效的另一种机制。

通过诱导周围组织发生变化，突变的肠道干细胞创造了一个不利的生态位环境，使它们相对于非突变的邻居具有竞争优势。

近端依赖生物素化技术定义了人类细胞中4000多个蛋白质的位置，以及蛋白质之间近端36,000种相互作用，包括那些在线粒体和ER界面上的相互作用。

天然反义转录物MAPT-AS1干扰大脑中mRNA转录物转化为tau蛋白的翻译，可能代表一种控制内在无序蛋白水平的一般机制，与神经退行性疾病特别相关。

对SARS-CoV-2和SARS-CoV对肺源性人类细胞系A549影响的多组学分析，生成了一个数据集，能够识别常见和病毒特异性感染机制。

两个完整的体积重建秀丽隐杆线虫主神经环(神经环)揭示了多尺度的空间组织，支持保守和可变的电路，并使神经环的模块化结构功能模型的推导成为可能。

在斑马鱼胚胎发育过程中，基因的配对对于分割时钟基因的稳健表达至关重要。

热蛋白质组分析与反向遗传学方法相结合，可深入了解全球蛋白质组的丰度和热稳定性大肠杆菌．

转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、全群体遗传关联研究和结构功能分析为g蛋白偶联受体异构体的差异表达如何在不同组织中实现信号多样化提供了一幅图像。

一个机器人管道被用来调查突变库在ADrosphila基因增强子，表明大多数突变改变了基因表达，并具有广泛的多效性效应，可能会限制调控进化。

一个基于类器官的筛选平台绘制了肠道发育和再生背后的遗传相互作用，表明维甲酸代谢维持了再生和稳态之间的平衡，类维甲酸X受体拮抗剂促进体内再生。

小鼠癌细胞系中的全基因组CRISPR筛选用于识别一组核心的保守基因和通路，这些基因和通路控制癌细胞如何逃避细胞毒性T淋巴细胞的杀伤。

LifeTime倡议是一项雄心勃勃的多学科计划，旨在通过跟踪疾病过程中的单个人类细胞和对治疗的反应来改善医疗保健，以便在欧洲开发和实施基于细胞的拦截医学。

序贯通量瓶颈模型解释了暴露在波动生长条件下的细菌稳态生长和生理适应时间之间的普遍权衡。

的系统级映射拟南芥激素信号网络由2000多个二元蛋白质-蛋白质相互作用组成，揭示了数百个途径间接触点，其中许多介导了不同激素途径之间的串音。

结构细胞除了作为屏障和结缔组织的作用外，还具有广泛的免疫调节功能，并且在对病毒感染的快速反应中利用表观遗传编码的免疫基因激活潜力。

单分子荧光原位杂交和活细胞成像技术用于研究转录噪声对干细胞异质性的贡献，揭示随机转录动态有利于伴随的干细胞维持和组织稳态。

先进的蛋白质组学工作流程用于识别来自100个分类多样性物种的340,000个蛋白质，在进化范围内提供蛋白质组的比较视图。

深入了解Facebook上支持和反对疫苗接种群体之间的相互作用，可以制定政策和方法，试图中断向反疫苗接种观点的转变，并说服犹豫不决的个人采取支持疫苗接种的立场。

人- sars - cov -2蛋白相互作用图突出了被病毒劫持的细胞过程，这些细胞过程可以被现有药物靶向，包括mRNA翻译抑制剂和sigma受体的预测调控因子。

人类二元蛋白质相互作用组图，包括大约53000种蛋白质-蛋白质相互作用，涉及8000多种蛋白质，为研究人类细胞在健康和疾病中的功能提供了参考。

单细胞RNA测序用于生成涵盖成人和胎儿阶段所有主要人体器官的数据集，从而能够与小鼠组织的类似数据集进行比较。

乳腺癌的单细胞、空间分辨分析显示了肿瘤和间质组织的异质性，并提供了比当前基于组织学的系统更详细的患者分类方法。

一种新的计算框架，novoSpaRc，利用单细胞数据重建细胞的空间背景和跨组织和生物的空间表达，基于基因表达的组织原则。

开拓性的细菌细胞利用自身产生的吸引梯度进行趋化，以促进在营养丰富的环境中快速定植。

为了成功地在存在竞争趋化细菌种群的栖息地中殖民，获胜者必须以栖息地大小和种群翻倍时间所给定的速度扩大其范围。

工程双组分信号蛋白大肠杆菌具有与其亲本蛋白不同的残基特异性，且与所有现存的旁基序列正交，表明序列空间不被密集占据。

在两个患者来源的结直肠癌异种移植模型和一个小鼠原位软组织肉瘤模型中，通过对单碳代谢的影响，限制蛋氨酸的饮食影响癌症的结局，并与抗代谢物和放射疗法相互作用。

一种被称为scSLAM-seq的技术，将单细胞RNA测序与代谢RNA标记和核苷转换相结合，用于研究单个小鼠成纤维细胞中巨细胞病毒感染的发生。

实现积分反馈拓扑的合成基因电路被证明可以在活细胞中实现鲁棒的完美自适应——数学分析证明这种拓扑对于具有噪声动态的网络的自适应是必要的。

炎症性肠病多组学数据库包括纵向数据，包括对100多人的粪便、血液和活组织检查的大量分析，并提供了炎症性肠病中宿主和微生物活动的全面描述。