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文章
|开放获取一个转录开关控制性别的决定恶性疟原虫
人类疟疾寄生虫性别决定的非遗传机制,恶性疟原虫男性发育1基因被确定为阻断疟疾传播的干预措施的潜在靶点。
- A. R.戈麦斯
- ,答:Marin-Menendez
- &a·m·塔尔曼
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文章|
用于细胞监测和操作的可编程RNA传感
RNA传感介导的有效载荷表达提供了一种特殊的、通用的、简单的和可推广的检测和操纵动物细胞的方法,具有广泛的潜在应用。
- Yongjun钱
- ,Jiayun李
- &Z. Josh Huang
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文章|
基因调控元件氧化损伤修复机制研究
核有丝分裂器蛋白NuMA通过占据转录起始位点周围的区域,结合DNA修复因子和促进损伤后的转录,帮助保护基因免受氧化损伤。
- Swagat雷
- ,Arwa A. Abugable
- &Sherif F. El-Khamisy
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文章|
CDK11通过SF3B1磷酸化调控pre-mRNA剪接
在剪接体激活过程中,CDK11与SF3B1结合并磷酸化SF3B1 N端苏氨酸残基,CDK11的抑制阻断了激活并导致内含子广泛保留,以及在前mrna和染色质上无功能剪接体的积累。
- 米兰Hluchy
- ,Pavla Gajduš剥
- &Dalibor Blazek
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文章|
通过CRISPR技术添加retron条形码,记录DNA中基因的表达顺序
retrocascorder是一种按时间顺序记录转录输出的系统,它使用retrons作为标记,在CRISPR阵列中介导DNA条形码的获取。
- 桑蒂Bhattarai-Kline
- ,西拉·k·李尔
- &赛斯·l·希普曼
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不同的辅因子依赖性定义了不同类型的人类增强子
通过辅助因子依赖性对人类增强子进行系统分类,为理解增强子的序列和染色质多样性及其在不同基因调控计划中的作用提供了一个概念框架。
- Christoph梅尔
- ,Vanja Haberle
- &亚历山大·斯塔克
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文章|
人类增强子和启动子序列的相容性规则
一项新的高通量实验应用于人类细胞中的1000个增强子和1000个启动子,揭示了不同类别的增强子和启动子如何控制RNA表达。
- 德鲁·t·伯格曼
- ,Thouis R. Jones
- &杰西·m·恩格雷茨
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文章|
吉宾中胚层调节模式上皮发育
吉宾的描述,由AHDC1,提供了在Xia-Gibbs中所见的表皮和中胚层模式表型和人类相关综合征的见解,这些症状源于基因特异性DNA甲基化决定导致的异常中胚层成熟。
- 安科利尔
- ,安琪拉刘
- &安东尼·e·奥罗
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文章|
活胚胎中远端调控基因的转录偶联
在果蝇在美国,遥远的副同源基因存在广泛的物理和功能联系,包括共享增强子的共同调控和近250千碱基的共转录起始。
- 米甲左旋的
- ,若昂Raimundo
- &迈克尔·s·莱文
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文章
|开放获取性腺激素受体的基因调控是大脑性别差异的基础
一项研究绘制了雌激素受体-α的神经元基因组靶点,并展示了它们如何协调大脑的性别分化,得出的结论是,在结构二态性已经建立之后,基因组仍然对激素变化有反应。
- b . Gegenhuber
- ,吴敏武
- &j . Tollkuhn
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文章
|开放获取通过增强子-启动子相互作用对转录的非线性控制
增强子的转录效果取决于它与启动子的非线性接触概率,增强子的强度决定了绝对转录水平以及启动子对ctcf介导的转录绝缘的敏感性。
- 杰西卡Zuin
- ,格雷戈里·罗斯
- &卢卡Giorgetti
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文章|
非达霉素窄谱活性的基础Clostridioides固执的
结构分析Clostridioides固执的RNA聚合酶与非达霉素的复合物结合生化、遗传和生物信息学分析确定了决定非达霉素敏感性的关键残留物。
- Xinyun曹
- ,韩德先生Boyaci
- &伊丽莎白·a·坎贝尔
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文章|
转录偶联DNA修复在细菌中的关键作用和机制
综合结构功能研究表明,转录偶联DNA修复(TCR) -而不是全球基因组修复-是细菌中大多数染色体修复事件的原因,并且TCR主要独立于Mfd转位酶发生。
- Binod K. Bharati
- ,希Gowder
- &Evgeny Nudler
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文章|
醛驱动的转录应激触发厌食性DNA损伤反应
内源性甲醛积累揭示了小鼠的Cockayne综合征,并刺激近端小管细胞中厌食肽GDF15的产生。
- 李Mulderrig
- ,Juan I. Garaycoechea
- &科坦·j·帕特尔
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文章
|开放获取人类转录- dna修复耦合的结构基础
作者解析了五种含有RNA聚合酶II和CSA和CSB蛋白的复合物的结构,为DNA损伤的修复如何与转录耦合提供了见解。
- Goran Kokic
- ,菲利克斯·r·瓦格纳
- &帕特里克·克莱默
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文章|
BANP打开染色质,激活cpg岛调控基因
BANP被确定为一种转录因子,它以dna甲基化依赖的方式结合CGCG元件,打开染色质并激活一类必需的cpg岛调控基因。
- 拉尔夫·s·格兰德
- ,卢卡斯汉堡
- &德克Schubeler
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文章|
增强子释放和重定向激活疾病易感性基因
一个启动子的破坏可以释放它的伙伴增强子来激活同一接触域中的其他启动子,这个过程被称为“增强子释放和重定向”,通常会导致导致疾病的基因改变。
- Soohwan哦
- ,在教坊邵
- &迈克尔·g·罗森菲尔德
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文章|
人介质- rna聚合酶II预起始复合物的结构
确定了与转录前起始复合物结合的人Mediator的重组20亚基版本的结构,为RNA聚合酶II起始的调控提供了深入的了解。
- Srinivasan Rengachari
- ,桑德拉Schilbach
- &帕特里克·克莱默
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文章|
哺乳动物RNA聚合酶II起始前复合物的结构
哺乳动物不同功能状态下的预起始复合物的高分辨率结构为转录起始机制提供了详细的见解。
- Shintaro Aibara
- ,桑德拉Schilbach
- &帕特里克·克莱默
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文章|
出芽酵母基因组的高分辨率蛋白质结构
ChIP-exo方法用于定义与基因转录、DNA复制、着丝粒、亚端粒和转座子相关的蛋白质的全基因组位置组织,揭示了构成性和诱导性基因表达的不同蛋白质组装。
- 马修·j·罗西
- ,Prashant K. Kuntala
- &富兰克林·普
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文章|
转录因子与非编码变异结合的系统分析
一种超高通量的多重蛋白质- dna结合试验用于评估270个人类转录因子与人类基因组中95,886个非编码变异的结合,为改进非编码变异对转录因子结合影响的预测提供数据,从而增加对不同人类性状和遗传疾病相关分子途径的理解。
- 建研
- ,Yunjiang邱
- &Bing任
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文章|
人类线粒体DNA转录的小分子抑制剂
靶向人类线粒体RNA聚合酶的线粒体转录抑制剂为研究线粒体DNA表达在广泛病理中的作用提供了化学生物学工具。
- 尼娜·a·博内坎普
- ,布拉德利彼得
- &Nils-Goran拉尔森
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文章|
粗类噬菌体病毒粒子RNA聚合酶的结构与功能
来自粗类噬菌体phi14:2的RNA聚合酶与噬菌体DNA一起易位到宿主细胞并转录早期噬菌体基因,在结构上与真核RNA干扰聚合酶最相似,这表明后者具有噬菌体起源。
- Arina V. Drobysheva
- ,索菲亚·a·帕纳菲迪娜
- &Maria L. Sokolova
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文章|
DNA错配揭示了蛋白质- DNA识别中的构象惩罚
一项将错配的碱基对引入DNA序列的高通量实验表明,错配可以通过提前支付扭曲DNA的一些能量成本来增加转录因子结合亲和力。
- 阿里尔Afek
- ,Honglue史
- &Raluca云
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文章|
利用机器学习识别人类DPR核心启动子元件
一种机器学习方法表明,下游核心启动子区域(DPR)广泛应用于人类基因启动子中,许多启动子要么包含DPR,要么包含TATA盒子,但不是两者都包含。
- 龙Vo ngoc
- ,黄云静
- &James T. Kadonaga
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文章|
HDAC3活性的二分参与控制炎症反应
在脂多糖激活小鼠巨噬细胞期间,组蛋白去乙酰化酶3通过抑制和激活基因转录来控制炎症反应,这取决于它与转录因子的差异关联。
- 黄昌博。阮
- ,海洋Adlanmerini
- &米切尔·a·拉扎尔
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文章
|开放获取全组织和单细胞分辨率下小鼠胚胎转录组的变化
在胚胎发育的17个小鼠组织中,RNA表达在组织水平上被量化,在发育中的肢体中,RNA表达在单细胞水平上被量化。
- 彭,他
- ,布莱恩·a·威廉姆斯
- &芭芭拉·j·沃尔德
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文章|
MeCP2连接异染色质冷凝物和神经发育疾病
染色质蛋白MeCP2是动态的、液体状异染色质凝聚物的组成部分,MeCP2形成凝聚物的能力因其突变而中断MECP2出现在神经发育障碍Rett综合征中的基因。
- 查尔斯·李
- ,艾略特·l·科菲
- &理查德·a·杨
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文章|
核仁RNA聚合酶II驱动核糖体的生物发生
RNA聚合酶II在核仁中具有意想不到的功能,有助于驱动核糖体RNA的表达,并通过涉及三重r -环结构的机制保护核仁结构。
- 卡兰·亚伯拉罕
- ,Negin Khosraviani
- &卡里姆Mekhail
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文章|
体细胞干细胞转录动力学的单分子成像
单分子荧光原位杂交和活细胞成像技术用于研究转录噪声对干细胞异质性的贡献,揭示随机转录动态有利于伴随的干细胞维持和组织稳态。
- 贾斯汀·c·维特
- ,Yehonatan鞍
- &乌尔里希Steidl
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文章|
复制SARS-CoV-2聚合酶的结构
SARS-CoV-2 RNA依赖RNA聚合酶的冷冻电镜结构揭示了冠状病毒的复制,并有助于分析候选抗病毒药物的抑制机制。
- 豪克·s·海伦
- ,Goran Kokic
- &帕特里克·克莱默
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文章|
核小体结合的SOX2和SOX11结构阐明了前驱因子的功能
先锋转录因子SOX2及其密切同源物SOX11的dna结合域的冷冻电子显微镜结构阐明了这些因子在启动染色质打开和核小体重构中的作用。
- Svetlana O. Dodonova
- ,Fangjie朱
- &帕特里克·克莱默
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文章|
沙粒病毒复制机制的结构洞察
作者提供了两种沙粒病毒聚合酶的高分辨率结构,揭示了沙粒病毒聚合酶的活性位点是固有开启的,不需要5 ' -病毒RNA的变构激活,二聚化促进了聚合酶的活性。
- Ruchao彭
- ,鑫徐
- &彝族史
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文章|
U1 snRNP调控非编码rna的染色质保留
长链非编码RNA和某些不稳定的转录本倾向于定位于染色质,在此过程中,该过程依赖于识别小核核糖核蛋白U1的RNA基序,并依赖于转录。
- 这里阴
- ,陆宇阳
- &小华沈
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文章|
SWI/SNF染色质重塑体RSC与核小体结合的结构
16亚基酵母SWI/SNF复合物RSC与核小体底物复合物的冷冻电子显微镜结构为该蛋白复合物家族的染色质重塑功能提供了深入的了解。
- 菲利克斯·r·瓦格纳
- ,基督教Dienemann
- &帕特里克·克莱默
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文章|
SAGA的结构及TBP在基因启动子上的沉积机制
酵母转录辅激活复合物SAGA (Spt-Ada-Gcn5-acetyltransferase)的结构研究为这种在真核生物中保守的多蛋白复合物启动调控转录的机制提供了深入的了解。
- 伽柏Papai
- ,亚历山大Frechard
- &ben - shem亚当
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文章|
转录辅激活子SAGA的结构
酵母转录辅激活复合物SAGA (Spt-Ada-Gcn5-acetyltransferase)的结构研究为这种在真核生物中保守的多蛋白复合物启动调控转录的机制提供了深入的了解。
- 王叫海波
- ,基督教Dienemann
- &帕特里克·克莱默
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文章|
基因边界的负超线圈调节基因拓扑结构
拓扑异构酶Top2和染色质结合蛋白Hmo1在基因的不同区域维持欠缠绕和过缠绕的DNA,从而调节基因的拓扑结构。
- Yathish Jagadheesh Achar
- ,Mohamood Adhil
- &马可Foiani
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文章|
动态谱系启动是由ERK直接增强子调控驱动的
ERK通过辅助因子和RNA聚合酶从多能性到早期分化增强子的选择性再分配可逆地调节胚胎干细胞转录,同时使转录因子与其增强子结合,从而保持可塑性。
- 威廉·b·汉密尔顿
- ,Yaron Mosesson
- &约书亚·m·布里克曼
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信|
A型流感病毒RNA聚合酶的结构为病毒基因组复制提供了见解
人类和禽流感病毒RNA聚合酶的结构揭示了RNA聚合酶二聚体的界面在病毒基因组复制中启动病毒RNA合成所必需的。
- 海地的粉丝
- ,亚历山大·p·沃克
- &欧文Fodor
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信|
BORIS在治疗耐药癌细胞中促进染色质调控相互作用
CTCF旁基BORIS在转录重编程的对靶向治疗有抗性的成神经细胞瘤细胞中上调,其中它促进了调节染色质相互作用,维持抗性表型。
- 大卫·n·德布鲁因
- ,鲁本干
- &拉妮·e·乔治
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信|
Pol II磷酸化调节转录和剪接冷凝物之间的切换
具有低磷酸化c端结构域的RNA聚合酶II优先与中介缩合物结合,而具有过磷酸化c端结构域的RNA聚合酶II优先与剪接因子缩合物结合,揭示了磷酸化是缩合物偏好的调节机制。
- Yang Eric Guo
- ,约翰·c·曼泰加
- &理查德·a·杨
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评论文章|
转录因子和三维基因组构象在细胞命运的决定
三维基因组结构在基因表达调控中具有重要作用,因此是正常发育和疾病状态下细胞身份的关键决定因素。
- 拉尔夫Stadhouders
- ,纪尧姆·菲利翁
- &托马斯·格拉夫
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信|
转录辅因子对不同类型的核心启动子显示特异性
筛选23个转录辅因子的能力,以激活72,000个候选核心启动子黑腹果蝇确定了不同的相容性组,提供了对转录程序选择性激活机制的深入了解。
- Vanja Haberle
- ,科斯玛斯·d·阿诺德
- &亚历山大·斯塔克
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文章|
突变体mRNA降解引发的遗传补偿
转录适应是一种基因补偿过程,生物体通过上调相关基因来应对突变,由mRNA衰变触发,涉及序列依赖机制。
- Mohamed A. El-Brolosy
- ,撒迦利亚Kontarakis
- &Didier Y. R. Stainier
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信|
BRCA1的募集限制了mycn驱动的停滞RNA聚合酶的积累
在人类成神经细胞瘤肿瘤中,MYCN以usp11 - brca1依赖的方式参与抑制停滞RNAPII的积累,并诱导基因的激活和抑制。
- 施特菲·赫罗尔德
- ,杰奎琳·卡尔布
- &马丁Eilers
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文章|
在单细胞分辨率下可视化胚胎中的DNA折叠和RNA
染色质结构的光学重建和多重RNA标记追踪单细胞中的DNA路径及其与转录的关系。
- 莱斯利·j·马特奥
- ,塞多娜·e·墨菲
- &阿利斯泰尔·n·伯蒂格